| Clone Name | rbasd22f15 |
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| Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 647/649 (99%), Gaps = 2/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 73 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 133 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 193 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 253 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 313 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 373 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 433 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 493 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 553 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 612 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 613 aagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 647/649 (99%), Gaps = 2/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 73 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 133 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 193 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 253 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 313 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 373 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 433 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 493 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 553 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 612 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 613 aagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 647/649 (99%), Gaps = 2/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1427 Query: 73 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1367 Query: 133 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1307 Query: 193 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1247 Query: 253 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1187 Query: 313 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1127 Query: 373 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1067 Query: 433 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 1007 Query: 493 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 947 Query: 553 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 612 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 887 Query: 613 aagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 886 aagtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 644/647 (99%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1067 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1007 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 947 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 636/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 636/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 636/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 636/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 636/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 636/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 636/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 636/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 636/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 641/647 (99%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1067 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcaatgctttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1007 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 947 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 792
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 635/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatantatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctakttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 634/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 633/639 (99%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 632/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 631/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 940 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 640/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 640/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 640/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 640/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 638/647 (98%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1005 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 945 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 885 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 884 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 637/647 (98%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 accttcttatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1005 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 945 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 885 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 884 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 638/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 639/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 639/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 639/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 638/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1426 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1366 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1306 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1246 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1186 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1126 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1066 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1065 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacat 1006 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaa 886 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 637/647 (98%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 945 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 901
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 637/647 (98%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 945 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 901
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 637/647 (98%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 945 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 901
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 631/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 627/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcg 1353 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 874 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 633/642 (98%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 79 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1431 Query: 80 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1371 Query: 140 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 199 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1311 Query: 200 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 259 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1251 Query: 260 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1191 Query: 320 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1131 Query: 380 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1071 Query: 440 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1011 Query: 500 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 951 Query: 560 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 619 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 950 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 891 Query: 620 attttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 890 a-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 851
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 633/642 (98%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 79 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 80 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 140 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 199 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 200 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 259 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 260 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 320 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 380 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 440 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 500 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 560 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 619 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 880 Query: 620 attttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 879 a-tttgcggtaaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 633/642 (98%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 79 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56340 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 56281 Query: 80 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56280 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 56221 Query: 140 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 199 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56220 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 56161 Query: 200 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 259 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56160 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 56101 Query: 260 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56100 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 56041 Query: 320 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56040 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 55981 Query: 380 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55980 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 55921 Query: 440 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55920 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 55861 Query: 500 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55860 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 55801 Query: 560 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 619 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55800 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 55741 Query: 620 attttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 55740 a-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 55701
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 633/642 (98%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 79 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1467 Query: 80 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1407 Query: 140 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 199 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1347 Query: 200 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 259 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1287 Query: 260 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1227 Query: 320 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1167 Query: 380 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1107 Query: 440 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1047 Query: 500 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 987 Query: 560 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 619 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 986 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 927 Query: 620 attttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 926 a-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 887
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 632/641 (98%), Gaps = 2/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1480 Query: 81 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1420 Query: 141 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 200 ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 agatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1360 Query: 201 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 260 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1300 Query: 261 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1240 Query: 321 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1180 Query: 381 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1120 Query: 441 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 500 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 ccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 1060 Query: 501 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 1000 Query: 561 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 999 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta 940 Query: 621 ttttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 939 -tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 901
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 635/647 (98%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 945 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 901
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 630/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 939 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 901
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 626/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 874 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 629/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 635/647 (98%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1005 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 945 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 885 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 884 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 627/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 874 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 627/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 874 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 627/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 874 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 627/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 874 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 632/642 (98%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 79 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 80 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 140 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 199 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 200 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 259 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 260 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 320 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 380 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 439 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 440 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 500 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 560 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 619 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 880 Query: 620 attttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 879 a-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 629/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ngctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 888 tgcacggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 626/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggct 1365 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1305 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1185 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 826 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 792
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 634/647 (97%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 74 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttyg 1126 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 945 gtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 901
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 637/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1011 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 951 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 950 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 905
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 626/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 874 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 630/642 (98%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 79 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 80 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 140 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 199 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 200 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 259 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 260 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 320 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 380 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 440 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 500 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 560 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 619 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 880 Query: 620 attttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 879 a-tttgcggtaaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 629/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 629/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 792
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 629/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1336 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1276 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1216 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1156 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1096 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1036 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1035 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 976 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 916 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 856 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 855 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 797 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 796 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 759
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 629/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 629/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 631/642 (98%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 79 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1209 Query: 80 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1149 Query: 140 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 199 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1089 Query: 200 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 259 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1029 Query: 260 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 969 Query: 320 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 909 Query: 380 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 849 Query: 440 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 789 Query: 500 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 729 Query: 560 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 619 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 728 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagt 669 Query: 620 attttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 668 a-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 629
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 636/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1011 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 951 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 950 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 905
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 625/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnc 1233 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 874 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 629/641 (98%), Gaps = 2/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 80 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1419 Query: 81 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1359 Query: 141 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 200 ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 agatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1299 Query: 201 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 260 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1239 Query: 261 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1179 Query: 321 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1178 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacga 1119 Query: 381 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1059 Query: 441 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaat 999 Query: 501 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 939 Query: 561 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 938 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta 879 Query: 621 ttttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 878 -tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 636/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 934 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 874 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 873 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaa 814 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 813 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 768
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 635/648 (97%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 628/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1338 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1278 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1218 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1158 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1098 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cggtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1038 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 978 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 918 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 858 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 857 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 799 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 798 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 761
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 636/648 (98%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 934 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 874 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 873 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaa 814 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 813 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 768
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 628/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 625/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1082 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagta-tttgc 663 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 662 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 629
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 627/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 627/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 628/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cgctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcgtgcattaca 840
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 635/648 (97%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataac 1011 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 951 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 950 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 905
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 629/641 (98%), Gaps = 2/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1371 Query: 81 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1311 Query: 141 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 200 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 201 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 260 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 261 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 320 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 321 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 380 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 381 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 441 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 500 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 501 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 891 Query: 561 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta 831 Query: 621 ttttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| Sbjct: 830 -tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcgtgcattaca 792
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 627/639 (98%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 632/648 (97%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 634/648 (97%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgcnnnaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1011 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 951 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 950 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 905
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 624/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 atagtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1334 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1274 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1214 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1154 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1094 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1034 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 974 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 853 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 795 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 794 ggtaaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 761
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 623/635 (98%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 874 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 840
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 626/639 (97%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 792
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 626/639 (97%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagta-t 878 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcgtgcattaca 840
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 624/639 (97%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgacca 1082 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagta-tttgc 663 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 662 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 629
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 629/648 (97%), Gaps = 3/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 73 |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 74 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 134 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 193 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 194 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 253 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 254 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 313 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 314 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 374 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 434 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 493 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgnnnnagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 902
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 626/642 (97%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1482 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1423 Query: 80 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1422 cgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagc 1363 Query: 140 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 199 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1303 Query: 200 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 259 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgga 1243 Query: 260 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 319 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 atcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1183 Query: 320 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1123 Query: 380 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1063 Query: 440 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1003 Query: 500 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1002 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatg 943 Query: 560 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 619 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 942 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 883 Query: 620 attttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 882 a-tttgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 843
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 621/639 (97%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1388 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1329 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1328 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1269 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1268 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1209 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1208 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1149 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1089 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1029 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 969 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 909 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 849 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 848 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 790 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 789 ttgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 752
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 621/639 (97%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 792
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 604/617 (97%), Gaps = 2/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 105 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 164 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 165 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 224 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 225 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 285 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 345 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 404 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 405 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 464 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 465 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 524 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 917 Query: 525 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 584 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 857 Query: 585 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggttta 644 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 856 aagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcccccag-tta 799 Query: 645 agtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||||| Sbjct: 798 agtagtcatgcattaca 782
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1404 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggct 1345 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1285 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacca 1225 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcc 1165 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttct 985 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgc 806 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 772
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1365 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1185 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 agcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgc 826 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 792
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1522 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1463 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1462 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1403 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1343 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1342 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1283 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1223 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1163 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1103 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 agcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1043 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 983 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 982 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgc 924 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 923 ggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 890
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 619/639 (96%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 792
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 620/641 (96%), Gaps = 2/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 80 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagcc 1371 Query: 81 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 140 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 141 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 201 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 260 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 261 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 320 || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 321 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcga 1071 Query: 381 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcc 1011 Query: 441 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 501 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 891 Query: 561 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 620 ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagta 831 Query: 621 ttttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||| Sbjct: 830 -tttgcggtgaatcccccag-tgatgtagtcatgcattaca 792
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 563/566 (99%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccgg-ttaagtagtcatgcattaca 780
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 611/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 924 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 923 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 864 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 863 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggta 805 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 aatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 775
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 562/566 (99%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcc 791 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cccgg-ttaagtagtcatgcattaca 766
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 569/576 (98%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-tttg 771 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 736
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 569/576 (98%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta-tttg 771 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 736
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 826 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1411 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1352 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1351 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1292 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1291 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1232 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1231 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1172 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1171 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1112 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1052 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 992 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 932 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 872 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 871 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 813 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 812 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 779
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 610/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 925 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 924 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 865 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtg 806 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 805 aatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 776
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1409 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1350 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1290 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1289 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1230 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1229 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1170 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1169 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1110 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1050 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 990 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 930 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 870 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 869 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 811 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 810 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 777
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1423 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1364 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1304 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1303 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1244 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1243 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1184 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1183 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1124 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1064 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1004 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 944 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 884 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 883 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 825 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 824 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 791
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 612/631 (96%), Gaps = 4/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124338 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124279 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124278 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124219 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 124218 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 124160 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124159 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 124130 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 612/631 (96%), Gaps = 4/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29811 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29752 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29751 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29692 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 29691 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 29633 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29632 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 29603
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 609/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55050 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54991 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54990 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54931 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 54930 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 54872 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54871 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 54842
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 609/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125391 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 125332 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 125331 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 125272 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 125271 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 125213 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125212 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 125183 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 609/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 30332 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30331 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 30272 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30271 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 30212 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 30211 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 30153 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30152 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 30123
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 612/635 (96%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 86 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 826 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 615/639 (96%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 atcgatagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgc 1284 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1283 ggcaagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag 1224 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1223 atcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgc 1164 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1163 acccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1104 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 atccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1044 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 984 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 924 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 864 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 804 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct: 803 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-t 745 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 707
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 609/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527570 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 33527629 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 33527630 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 33527689 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 33527690 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 33527748 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527749 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 33527778 Score = 87.7 bits (44), Expect = 4e-14 Identities = 64/68 (94%), Gaps = 2/68 (2%) Strand = Plus / Minus Query: 594 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcat 653 ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcat 39115415 Query: 654 gcattaca 661 |||||||| Sbjct: 39115414 gcattaca 39115407
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 609/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72767 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 72826 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 72827 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 72886 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 72887 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 72945 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72946 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 72975
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 609/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55029 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54970 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54969 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54910 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 54909 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 54851 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54850 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 54821
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 822 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 792
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54983 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 54982 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 54924 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54923 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 54894
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54983 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 54982 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 54924 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54923 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 54894
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124299 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 124298 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 124240 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124239 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 124210 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29718 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 29717 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 29659 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29658 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 29629
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124299 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 124298 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 124240 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124239 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 124210 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29718 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 29717 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 29659 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29658 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 29629
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55035 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55034 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54975 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 54974 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 54916 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54915 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 54886
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 822 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaact 1001 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 822 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatccccctg-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 614/639 (96%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 acccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | Sbjct: 888 tgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53304 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 53245 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 53244 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 53185 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 53184 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 53126 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53125 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 53096
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128237 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 128178 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 128177 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 128118 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 128117 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 128059 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128058 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 128029
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346912 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10346853 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10346852 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 10346793 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 10346792 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 10346734 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10346733 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 10346704
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 996 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 995 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 936 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 935 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 877 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 876 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 847
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 739 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 738 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 679 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 678 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 620 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 619 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 590
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352951 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10352892 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10352891 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 10352832 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 10352831 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 10352773 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10352772 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 10352743
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1328 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1327 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 1268 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1267 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtg 1209 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1208 aatcccccgg-tcaagtagtcatgcattaca 1179
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1361 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1360 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 1301 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1300 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 1242 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 aaccccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 1212 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 113 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 568/578 (98%), Gaps = 2/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 144 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 203 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 204 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 263 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 264 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 324 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 384 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 444 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 504 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 564 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 623 |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagta-tt 809 Query: 624 tgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcgtgcattaca 772
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 565/575 (98%), Gaps = 2/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 806 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcrtgcattaca 772
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 566/576 (98%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttg 807 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccag-ttaagtagtcgtgcattaca 772
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 583/599 (97%), Gaps = 2/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 122 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 123 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 182 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 183 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 243 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 302 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 303 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 362 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 363 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 423 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 483 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 543 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaa 829 Query: 603 tagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 828 taatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 772
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 592/611 (96%), Gaps = 2/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 111 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 170 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 171 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 230 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 231 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 290 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 291 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 350 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 351 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 411 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 471 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 530 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 531 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 591 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagt 650 |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtaaatcccccag-ttaagtagt 788 Query: 651 catgcattaca 661 ||||||||||| Sbjct: 787 catgcattaca 777
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 607/632 (96%), Gaps = 2/632 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 89 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 90 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 149 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 150 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 210 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 269 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 270 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 330 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 389 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 390 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 450 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 914 Query: 510 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 913 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 854 Query: 570 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggt 629 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 853 tgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggt 795 Query: 630 gaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 794 gaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 764
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 565/576 (98%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttg 797 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 606/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614142 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614083 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614082 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 5614023 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 5614022 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 5613964 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 5613963 aatcccctgg-ttaagtagtcatgcattaca 5613934 Score = 537 bits (271), Expect = e-149 Identities = 316/327 (96%), Gaps = 3/327 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 335 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 395 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 455 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 514 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 515 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 574 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 575 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatc 634 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatc 13436806 Query: 635 ccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 13436805 ccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 13436780 Score = 254 bits (128), Expect = 3e-64 Identities = 160/168 (95%), Gaps = 2/168 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 494 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 554 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 613 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 614 agtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 13397931 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 138 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 280 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 309 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 360 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 394 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.58 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 278 ggtcagagctggcatatgccaa 299 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 607/631 (96%), Gaps = 3/631 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203993 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 23204052 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 23204053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 23204112 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 23204113 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 23204171 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23204172 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 23204201 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 143 atc 145 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 143 atc 145 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 607/631 (96%), Gaps = 3/631 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154641 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 154700 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 154701 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 154760 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 154761 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 154819 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154820 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 154849
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 607/631 (96%), Gaps = 3/631 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38755 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38814 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38815 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 38874 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 38875 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 38933 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38934 aatcccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 38963
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 606/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614131 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614072 Query: 511 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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 455 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 514 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 515 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 574 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 575 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatc 634 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatc 13391080 Query: 635 ccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 13391079 ccccgg-ttaagtagtcatgcattaca 13391054 Score = 254 bits (128), Expect = 3e-64 Identities = 160/168 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Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 280 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 309 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 360 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 394 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.58 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 278 ggtcagagctggcatatgccaa 299 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 606/631 (96%), Gaps = 2/631 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 31 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 90 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 91 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 150 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 151 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 210 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 211 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 270 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 271 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 331 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 451 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 510 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38743 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38802 Query: 511 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38803 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 38862 Query: 571 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtg 630 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 38863 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtg 38921 Query: 631 aatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 38922 aatcccctgg-ttaagtagtcatgcattaca 38951
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 557/566 (98%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtaaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccgg-ttaagtagtcatgcattaca 780
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 590/611 (96%), Gaps = 2/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 110 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 111 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 170 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 171 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 230 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 231 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 290 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 291 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 350 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 351 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 411 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 471 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 530 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 531 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 591 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagt 650 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagt 788 Query: 651 catgcattaca 661 ||||||||||| Sbjct: 787 catgcattaca 777
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 611/639 (95%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 atcgatggtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgc 1339 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1338 ggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag 1279 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1158 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1099 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1098 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatc 1039 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | Sbjct: 858 tgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-t 800 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 565/578 (97%), Gaps = 2/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 144 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 203 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 204 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 263 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 264 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 324 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 383 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 384 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 444 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 504 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 564 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 623 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tt 809 Query: 624 tgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 772
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 563/576 (97%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 883 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttg 825 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 790
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 563/576 (97%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttg 797 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 580/599 (96%), Gaps = 2/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 122 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 123 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 182 ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 183 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 243 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 302 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 303 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 362 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 363 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 423 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 483 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 543 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaa 829 Query: 603 tagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 828 taatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 772
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 610/639 (95%), Gaps = 2/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 82 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 83 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 142 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 143 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 202 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgc 1249 Query: 203 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 262 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 acctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 263 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 322 ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1129 Query: 323 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 382 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatc 1069 Query: 383 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 442 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 443 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 503 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 562 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 ttttgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 563 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 622 ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| | Sbjct: 888 tgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagta-t 830 Query: 623 ttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 564/578 (97%), Gaps = 2/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 144 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 203 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 204 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 263 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 264 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 324 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 383 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 384 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 444 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 504 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 564 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 623 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tt 810 Query: 624 tgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 773
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 562/576 (97%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttg 791 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 756
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 562/576 (97%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttg 808 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 773
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 562/576 (97%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttg 791 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 756
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 604/632 (95%), Gaps = 2/632 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 89 ||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 90 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 149 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 150 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 209 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 210 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 269 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 270 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 330 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 390 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 450 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 857 Query: 510 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 856 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 797 Query: 570 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggt 629 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| Sbjct: 796 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagta-tttgcggt 738 Query: 630 gaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| || | |||| ||||||||||||||| Sbjct: 737 gaatcctccag-ttaaatagtcatgcattaca 707
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 559/572 (97%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 150 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 210 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 269 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 270 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 330 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 390 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 450 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 509 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 510 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 569 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 570 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggt 629 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggt 823 Query: 630 gaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 570/587 (97%), Gaps = 2/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 134 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 135 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 194 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 195 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 254 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 255 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 314 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 315 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 374 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 375 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 434 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 435 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 495 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 879 Query: 555 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 614 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 878 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 819 Query: 615 gtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 818 ctagta-tttgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 774
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 588/611 (96%), Gaps = 2/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 110 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 111 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 170 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 171 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 230 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 231 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 290 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 291 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 350 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 351 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 410 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 411 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 471 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 530 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 531 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 848 Query: 591 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagt 650 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct: 847 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagt 790 Query: 651 catgcattaca 661 ||||||||||| Sbjct: 789 catgcattaca 779
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 582/603 (96%), Gaps = 2/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 118 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 119 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 178 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 179 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 238 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 239 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 298 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 299 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 358 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 359 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 419 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1032 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatg 973 Query: 479 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 913 Query: 539 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 598 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 912 ctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcg 853 Query: 599 gcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcatt 658 |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| Sbjct: 852 gcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcatt 795 Query: 659 aca 661 ||| Sbjct: 794 aca 792
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 554/566 (97%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccag-ttaagtagtcatgcattaca 780
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 554/566 (97%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | |||||||||| ||||||||| Sbjct: 804 cccag-ttaagtagtcgtgcattaca 780
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 563/578 (97%), Gaps = 2/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 144 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 203 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 204 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 263 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 264 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 324 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 384 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 444 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 503 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 504 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 564 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 623 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || Sbjct: 874 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tt 816 Query: 624 tgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 779
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 556/570 (97%), Gaps = 2/570 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 151 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 152 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 211 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 212 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 271 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 272 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 332 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 391 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 392 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 452 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 511 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 512 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 571 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 572 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtga 631 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtga 809 Query: 632 atcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 780
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 540/548 (98%), Gaps = 2/548 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 114 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 173 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 174 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 234 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 293 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 294 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 354 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 414 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 474 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 534 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 594 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcat 653 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcat 762 Query: 654 gcattaca 661 |||||||| Sbjct: 761 gcattaca 754
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 540/548 (98%), Gaps = 2/548 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 114 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 173 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 174 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 234 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 293 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 294 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 354 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 414 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 474 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 534 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 594 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcat 653 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcat 762 Query: 654 gcattaca 661 |||||||| Sbjct: 761 gcattaca 754
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 555/568 (97%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 154 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 214 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 274 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 334 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 394 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 454 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 513 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 514 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 573 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 574 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaat 633 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaat 789 Query: 634 cccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 788 cccccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 553/566 (97%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcc 807 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 806 cccag-ttatgtagtcatgcattaca 782
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 562/578 (97%), Gaps = 2/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 144 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 203 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 204 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 263 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 264 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 323 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 324 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 384 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 444 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 503 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 504 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 564 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 623 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || Sbjct: 872 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tt 814 Query: 624 tgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 777
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 560/576 (97%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttg 791 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 756
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 593/620 (95%), Gaps = 2/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 101 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 102 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 161 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 162 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 221 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 222 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 281 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 282 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 341 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 342 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 402 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 461 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 462 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 521 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 522 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 581 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870 Query: 582 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggt 641 |||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| || | Sbjct: 869 agtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagta-tttgcggtgaatcctccag- 812 Query: 642 ttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattaca 792
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 2/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 118 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 119 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 178 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 179 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 238 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 239 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 298 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 299 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 358 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 359 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 419 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatg 957 Query: 479 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 956 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 897 Query: 539 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 598 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 896 ctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcg 837 Query: 599 gcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcatt 658 |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| Sbjct: 836 gcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcatt 779 Query: 659 aca 661 ||| Sbjct: 778 aca 776
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 561/578 (97%), Gaps = 2/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 144 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 203 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 204 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 263 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 264 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 323 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 324 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 383 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 384 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 444 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 504 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 564 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 623 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tt 809 Query: 624 tgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 772
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 563/581 (96%), Gaps = 2/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 140 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 141 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 200 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 201 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 260 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 261 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 320 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 321 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 381 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 440 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 441 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 500 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 501 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 561 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta 831 Query: 621 ttttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||| Sbjct: 830 -tttgcggtgaatcccccag-tgatgtagtcatgcattaca 792
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 566/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 554/570 (97%), Gaps = 2/570 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 151 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 152 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 211 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 212 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 271 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 272 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 331 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 332 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 391 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 392 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 452 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 511 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 512 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 571 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 572 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtga 631 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtga 809 Query: 632 atcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 780
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 559/576 (97%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttg 807 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 772
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 559/576 (97%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagta-tttg 797 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctg-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 592/620 (95%), Gaps = 2/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 101 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 102 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 161 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 162 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 221 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 222 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 281 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 282 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 341 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 342 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 402 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 461 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 462 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 521 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 522 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 581 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870 Query: 582 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggt 641 |||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| || | Sbjct: 869 agtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagta-tttgcggtgaatcctccag- 812 Query: 642 ttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattaca 792
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 551/566 (97%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 804 cccag-ttatgtagtcatgcattaca 780
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 551/566 (97%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 804 cccag-ttatgtagtcatgcattaca 780
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 551/566 (97%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 804 cccag-ttatgtagtcatgcattaca 780
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 556/573 (97%), Gaps = 2/573 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 89 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 148 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 149 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 208 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 209 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 268 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 269 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 328 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 329 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 389 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 448 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 449 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 508 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 509 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 569 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcgg 628 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcgg 785 Query: 629 tgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| | | | |||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccag-tgatgtagtcatgcattaca 753
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 556/573 (97%), Gaps = 2/573 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 89 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 148 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 149 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 208 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 209 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 268 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 269 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 328 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 329 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 389 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 448 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 449 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 508 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 509 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 569 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcgg 628 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcgg 785 Query: 629 tgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| | | | |||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccag-tgatgtagtcatgcattaca 753
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 565/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 555/572 (97%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 150 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 209 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 210 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 269 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 270 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 330 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 389 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 390 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 450 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 510 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 569 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 570 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggt 629 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 870 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggt 812 Query: 630 gaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 811 gaatcccccag-ttatgtagtcatgcattaca 781
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 600/632 (94%), Gaps = 2/632 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 89 ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 90 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 149 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 150 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 209 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 210 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 269 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 270 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 330 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 389 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 390 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439 Query: 450 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 509 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 1379 Query: 510 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1378 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1319 Query: 570 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggt 629 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1318 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagta-tttgcggt 1260 Query: 630 gaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 gaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 1229
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 558/576 (96%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagta-tttg 797 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctg-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 584/611 (95%), Gaps = 2/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 110 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 111 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 170 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 171 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 230 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 231 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 290 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 291 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 350 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 351 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 410 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 411 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 470 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 471 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 530 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 531 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120001 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 119942 Query: 591 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagt 650 |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| Sbjct: 119941 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagta-tttgcggtgaatcctcctg-ttaagtagt 119884 Query: 651 catgcattaca 661 ||||||||||| Sbjct: 119883 catgcattaca 119873
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 584/611 (95%), Gaps = 2/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 110 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 111 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 170 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 171 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 230 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 231 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 290 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 291 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 350 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 351 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 410 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 411 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 470 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 471 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 530 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 531 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58374 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 58315 Query: 591 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagt 650 |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| Sbjct: 58314 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagta-tttgcggtgaatcctcctg-ttaagtagt 58257 Query: 651 catgcattaca 661 ||||||||||| Sbjct: 58256 catgcattaca 58246
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 564/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 715 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 714 agta-tttgcggtgaatcctccgg-ttaagtagtcatgcattaca 672
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 564/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 564/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 557/576 (96%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 866 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttg 808 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 773
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 557/576 (96%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 869 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttg 811 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | | | |||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccag-tgatgtagtcatgcattaca 776
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 599/632 (94%), Gaps = 2/632 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 89 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 90 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 149 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 150 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 209 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 210 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 269 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 270 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 330 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 389 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 390 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1419 Query: 450 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 509 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1418 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagct 1359 Query: 510 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 569 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1358 aatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1299 Query: 570 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggt 629 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||| |||||||| Sbjct: 1298 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagacaaactagta-tttgcggt 1240 Query: 630 gaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 1209
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 583/611 (95%), Gaps = 2/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 110 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 111 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 170 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 171 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 230 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 231 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 290 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 291 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 350 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 351 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 410 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 411 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 470 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 471 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 530 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 531 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 591 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagt 650 |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagta-tttgcggtgaatcctcctg-ttaagtagt 803 Query: 651 catgcattaca 661 ||||||||||| Sbjct: 802 catgcattaca 792
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 583/611 (95%), Gaps = 2/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 110 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 111 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 170 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 171 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 230 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 231 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 290 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 291 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 350 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 351 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 410 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 411 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 470 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 471 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 530 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 531 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57793 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57734 Query: 591 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagt 650 |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| Sbjct: 57733 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagta-tttgcggtgaatcctcctg-ttaagtagt 57676 Query: 651 catgcattaca 661 ||||||||||| Sbjct: 57675 catgcattaca 57665
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 556/575 (96%), Gaps = 2/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 147 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 207 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 266 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 267 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 327 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 386 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 387 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 447 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 507 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 566 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 567 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgc 626 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgc 826 Query: 627 ggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 792
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 583/611 (95%), Gaps = 2/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 110 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 111 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 170 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 171 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 230 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 231 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 290 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 291 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 350 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 351 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 410 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 411 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 470 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 471 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 530 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 531 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57803 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57744 Query: 591 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagt 650 |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| Sbjct: 57743 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagta-tttgcggtgaatcctcctg-ttaagtagt 57686 Query: 651 catgcattaca 661 ||||||||||| Sbjct: 57685 catgcattaca 57675
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 562/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcatta 659 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcatta 764
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 549/566 (96%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcc 815 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 814 cccag-ttatgtagtcatgcattaca 790
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 549/566 (96%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcc 787 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 786 cccgg-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 563/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 563/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 535/548 (97%), Gaps = 2/548 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 114 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 173 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 174 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 234 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 293 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 294 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 354 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 414 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 474 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 534 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 594 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcat 653 ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcat 759 Query: 654 gcattaca 661 |||||||| Sbjct: 758 gcattaca 751
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 535/548 (97%), Gaps = 2/548 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 114 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 173 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 174 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 234 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 293 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 294 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 354 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 414 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 474 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 534 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 594 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcat 653 ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcccccag-ttatgtagtcat 759 Query: 654 gcattaca 661 |||||||| Sbjct: 758 gcattaca 751
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 556/576 (96%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttg 797 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 582/611 (95%), Gaps = 2/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 110 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 111 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 170 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 171 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 230 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 231 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 290 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 291 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 350 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 351 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 410 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 411 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 470 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 1370 Query: 471 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 530 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1310 Query: 531 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1309 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 1250 Query: 591 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagt 650 |||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||| Sbjct: 1249 ttgtcgcggcaataataagacaaactagta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagt 1192 Query: 651 catgcattaca 661 ||||||||||| Sbjct: 1191 catgcattaca 1181
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 548/566 (96%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | | | |||||||||||||||| Sbjct: 804 cccag-tgatgtagtcatgcattaca 780
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 548/566 (96%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | | | |||||||||||||||| Sbjct: 804 cccag-tgatgtagtcatgcattaca 780
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 548/566 (96%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 156 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 215 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 216 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 275 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 276 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 335 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 336 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 395 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 396 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 456 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 515 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 516 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 576 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcc 635 |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcc 805 Query: 636 cccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| | | | |||||||||||||||| Sbjct: 804 cccag-tgatgtagtcatgcattaca 780
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 557/578 (96%), Gaps = 2/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 144 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 203 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 204 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 264 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 324 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 383 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 384 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 444 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 503 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 504 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 563 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 564 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 623 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tt 799 Query: 624 tgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 554/574 (96%), Gaps = 2/574 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 148 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 208 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 267 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 268 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 328 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 387 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 388 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 448 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 507 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 887 Query: 508 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 567 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 886 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 827 Query: 568 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcg 627 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct: 826 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcg 768 Query: 628 gtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 767 gtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 735
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 562/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 545/563 (96%), Gaps = 2/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 99 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 158 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 159 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 218 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 219 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 279 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 339 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 399 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 459 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 518 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 519 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 579 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatccccc 638 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatccccc 794 Query: 639 ggtttaagtagtcatgcattaca 661 | ||| |||||||||||||||| Sbjct: 793 ag-ttatgtagtcatgcattaca 772
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 562/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 562/585 (96%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 564/585 (96%), Gaps = 4/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 135 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 136 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 195 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 196 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 255 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 256 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 315 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 316 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 375 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 376 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 436 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 495 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 496 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 556 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 615 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 616 tagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattac 660 ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagta-tttgcggtgaatcctcctg-ttaagtagtcatgcattac 763
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 552/572 (96%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 150 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 210 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 269 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 270 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 330 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 389 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 390 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 450 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 509 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 924 Query: 510 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 569 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 864 Query: 570 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggt 629 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 863 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggt 805 Query: 630 gaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 gaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 774
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 555/576 (96%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 146 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 205 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 206 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 265 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 266 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 325 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 326 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 385 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 386 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 445 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 446 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 505 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 506 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 565 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 566 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttg 625 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttg 797 Query: 626 cggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 539/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 107 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 166 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 167 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 226 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 227 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 286 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 287 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 346 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 347 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 406 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 407 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 467 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 526 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 527 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 586 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 587 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaag 646 |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| | Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcccccag-ttatg 750 Query: 647 tagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| Sbjct: 749 tagtcatgcattaca 735
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 539/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 107 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 166 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 167 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 226 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 227 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 286 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 287 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 346 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 347 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 407 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 467 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 527 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 586 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 587 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaag 646 |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | Sbjct: 848 gccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcccccag-ttatg 791 Query: 647 tagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| Sbjct: 790 tagtcatgcattaca 776
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 539/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 107 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 166 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 167 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 226 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 227 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 286 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 287 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 346 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 347 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 406 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 407 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 467 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 526 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 527 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 586 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 587 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaag 646 |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| | Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta-tttgcggtgaatcccccag-ttatg 750 Query: 647 tagtcatgcattaca 661 ||||||||||||||| Sbjct: 749 tagtcatgcattaca 735
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 528/541 (97%), Gaps = 2/541 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 121 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 180 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 181 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 241 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 300 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 301 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 360 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 361 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 420 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 421 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 480 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 918 Query: 481 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 858 Query: 541 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 798 Query: 601 aatagtgagccaaagtagtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattac 660 |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 797 aataatgagccaaagtagta-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattac 740 Query: 661 a 661 | Sbjct: 739 a 739
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 561/585 (95%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 561/585 (95%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcccccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 561/585 (95%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagt 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 561/585 (95%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 561/585 (95%), Gaps = 2/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 137 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 196 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 197 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 256 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 257 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 316 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 317 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 376 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 377 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 436 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 437 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 497 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 556 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 557 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 616 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaact 805 Query: 617 agtattttgcggtgaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agta-tttgcggtgaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 762
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 551/572 (96%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 149 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 150 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 209 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 210 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 269 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 270 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 330 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 390 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 450 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 509 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 510 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 862 Query: 570 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattttgcggt 629 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 861 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagta-tttgcggt 803 Query: 630 gaatcccccggtttaagtagtcatgcattaca 661 |||||| || | |||||||||||||||||||| Sbjct: 802 gaatcctccag-ttaagtagtcatgcattaca 772 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,791,489 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4791489 Number of successful extensions: 132767 Number of sequences better than 10.0: 15352 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15303 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 61 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 92396 Number of HSP's gapped (non-prelim): 22287 length of query: 661 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 638 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10937423935152 effective search space used: 10937423935152 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)