| Clone Name | bags31p03 |
|---|---|
| Clone Library Name | barley_pub |
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 455/459 (99%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 862 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 918 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 977 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 1037 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 1097 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 1157 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 1217 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 1277 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 1316
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 455/459 (99%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 455/459 (99%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 455/459 (99%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 455/459 (99%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 371 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137451.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 371 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 371 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 371 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtyacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgktatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 454/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaagn-gttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttncaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatttacgaattc 531
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatttacgaattc 531
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 453/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 371 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 825 bits (416), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatctnctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 80 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 136 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 195 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 255 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 256 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 315 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 375 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 435 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 436 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 495 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 534
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 80 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 136 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 195 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 255 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 256 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 315 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 375 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 435 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 436 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 495 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 534
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 80 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 136 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 195 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 255 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 256 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 315 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 375 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 435 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 436 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 495 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 534
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 452/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgcngaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 76 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 132 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 133 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 191 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 192 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 251 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 252 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 311 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 312 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 371 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 372 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 431 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 432 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 491 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 492 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 530
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 448/458 (97%), Gaps = 4/458 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 13 aattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaaa 72 || |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 78 aaytcttnattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaaa 134 Query: 73 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagna 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 135 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag-a 193 Query: 133 gtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggt 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 194 gtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggt 253 Query: 193 tccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaac 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 254 tccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaac 313 Query: 253 tgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcga 312 |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 314 tgtttggactkatggacttaccagtcttgatcgtthcaaaggacgatgctatcacatcga 373 Query: 313 gcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatt 372 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 374 gcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatt 433 Query: 373 tgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaa 432 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 434 tgaggagggttccgttacyaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaa 493 Query: 433 agccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 494 agccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 133 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 192 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 193 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 252 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 253 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 312 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 313 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 372 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 373 agcctgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 432 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 433 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 492 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 493 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 531
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 76 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 132 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 133 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 191 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 192 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 251 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 252 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 311 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 312 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 371 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 372 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 431 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 432 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 491 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 492 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 530
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagaggggtccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 451/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 450/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 26 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 82 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 83 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 141 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 142 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 201 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 202 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 261 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 262 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 321 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 322 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 381 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 382 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 441 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 442 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 480
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 450/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 76 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 132 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 133 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 191 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 192 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcatcctgggg 251 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 252 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 311 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 312 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 371 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 372 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 431 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 432 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 491 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 492 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 530
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 450/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 450/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 450/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 450/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 450/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 450/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54876 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 54932 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54933 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 54991 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54992 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 55051 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55052 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 55111 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55112 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 55171 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55172 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 55231 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 55232 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 55291 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55292 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 55330
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 450/459 (98%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 62 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 118 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 agcaggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 177 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 178 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 237 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 238 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 297 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 298 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 357 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 358 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 417 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 418 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 477 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 478 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 516
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 803 bits (405), Expect = 0.0 Identities = 449/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 80 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 136 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 195 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 255 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 256 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 315 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 375 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 435 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | Sbjct: 436 ttgaagagggttccgttactaacntgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttna 495 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 534
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 801 bits (404), Expect = 0.0 Identities = 449/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 76 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 132 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 133 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 191 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 192 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 251 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 252 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaa 311 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 312 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 371 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 372 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 431 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 432 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 491 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 492 aagccctacgtgctctacgnttggaggatctacgaattc 530
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 420/423 (99%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 449/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 76 gaatttttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 132 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 133 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 191 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 192 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 251 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 252 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaa 311 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 312 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 371 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 372 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 431 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 432 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 491 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 492 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 530
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 449/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 76 gaatttttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 132 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 133 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 191 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 192 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 251 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 252 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaa 311 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 312 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 371 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 372 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 431 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 432 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 491 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 492 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 530
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 449/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 76 gaatttttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 132 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 133 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 191 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 192 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 251 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 252 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaa 311 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 312 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 371 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 372 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 431 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 432 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 491 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 492 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 530
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 449/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaatttttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 449/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaagatctacgaattc 469
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 449/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacgtggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>emb|Z49844.1|HBCHRBPCX H.brachyantherum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1224 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 420/423 (99%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 448/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 18 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 74 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 agcaggtgttgggtttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 133 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 134 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 193 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 194 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 253 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 254 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 313 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 314 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 373 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 374 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 433 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 434 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 472
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 419/423 (99%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY607059.1| Psathyrostachys rupestris subsp. rupestris voucher H6701 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1611 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 448/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 76 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 132 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 133 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 191 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 192 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 251 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 252 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 311 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 312 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 371 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 372 agcctgttcctggggaagaggagcaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 431 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 432 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 491 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 492 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 530
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 448/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 448/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 419/423 (99%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtaggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 787 bits (397), Expect = 0.0 Identities = 445/459 (96%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtwagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttaccaktcttgatcgttacaaasgacgatgctatcacatcs 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 arcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 785 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 447/459 (97%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 15 gaattcttaattcaag-agttataggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 71 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag- 130 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 131 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 190 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 191 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 250 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 251 ctgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 310 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 311 agcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctat 370 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 371 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttnggttca 430 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 431 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 469
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 777 bits (392), Expect = 0.0 Identities = 402/404 (99%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 67 ccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 366 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 409
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 775 bits (391), Expect = 0.0 Identities = 417/423 (98%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgcttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 769 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 401/404 (99%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 67 ccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 409
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 769 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 416/423 (98%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 119 tccgagtaagtccacagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgncg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacagccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY090549.1| Deschampsia antarctica clone Dacor 1.8-1 ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase mRNA, 5' UTR and partial cds Length = 749 Score = 769 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 445/459 (96%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 284 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 340 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 341 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-gg 399 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 400 agtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctgggg 459 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 460 ttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 519 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 520 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 579 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 580 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 639 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 640 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 699 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 700 aagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 738
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 769 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 445/459 (96%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 65 gaattcttaattcaag-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 121 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 122 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-gg 180 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 181 agtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctgggg 240 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 ttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 300 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 360 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 agcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 420 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 421 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 480 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 519
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 761 bits (384), Expect = 0.0 Identities = 394/396 (99%), Gaps = 1/396 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagt 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag-agt 59 Query: 135 atgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttc 194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 atgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttc 119 Query: 195 cgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactg 254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactg 179 Query: 255 tttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagc 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 tttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagc 239 Query: 315 ctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttg 374 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 ctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttg 299 Query: 375 aggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaag 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 aggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaag 359 Query: 435 ccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 ccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 395
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 761 bits (384), Expect = 0.0 Identities = 410/416 (98%), Gaps = 2/416 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagtcctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatcta 463 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtgtttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatcta 414
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 759 bits (383), Expect = 0.0 Identities = 415/423 (98%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 751 bits (379), Expect = 0.0 Identities = 414/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 749 bits (378), Expect = 0.0 Identities = 394/398 (98%), Gaps = 1/398 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 73 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagna 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag-a 59 Query: 133 gtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggt 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 gtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggt 119 Query: 193 tccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaac 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaac 179 Query: 253 tgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcga 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 tgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcga 239 Query: 313 gcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatt 372 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 gcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatt 299 Query: 373 tgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaa 432 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 300 tgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaa 359 Query: 433 agccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 agccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 397
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 749 bits (378), Expect = 0.0 Identities = 394/398 (98%), Gaps = 1/398 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 73 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagna 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag-a 59 Query: 133 gtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggt 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 gtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggt 119 Query: 193 tccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaac 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaac 179 Query: 253 tgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcga 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 tgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcga 239 Query: 313 gcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatt 372 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 gcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatt 299 Query: 373 tgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaa 432 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 300 tgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaa 359 Query: 433 agccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 agccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 397
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 745 bits (376), Expect = 0.0 Identities = 398/404 (98%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 67 ccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtttggaagatctacgaattc 409
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 396/402 (98%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 ag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 120 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacgtgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 401
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 396/402 (98%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 ag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 120 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacgtgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 401
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 396/402 (98%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaggtgttggattcaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 ag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 401
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 737 bits (372), Expect = 0.0 Identities = 412/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 |||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacactcc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 735 bits (371), Expect = 0.0 Identities = 412/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttgggtttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctgcgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 735 bits (371), Expect = 0.0 Identities = 387/391 (98%), Gaps = 1/391 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 80 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaa 139 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1 ttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag-agtatgaa 59 Query: 140 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 119 Query: 200 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 179 Query: 260 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 239 Query: 320 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 240 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 299 Query: 380 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 300 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 359 Query: 440 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 390
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 733 bits (370), Expect = 0.0 Identities = 380/382 (99%), Gaps = 1/382 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 3 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggat 61 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 62 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 121 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 181 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 182 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaa 241 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 242 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 301 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 361 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 362 cgtttggaggatctacgaattc 383
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 733 bits (370), Expect = 0.0 Identities = 411/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagannn 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 733 bits (370), Expect = 0.0 Identities = 380/382 (99%), Gaps = 1/382 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 3 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag-agtatgaaactaaggat 61 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 62 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 121 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 181 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 182 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaa 241 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 242 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 301 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 361 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 362 cgtttggaggatctacgaattc 383
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 729 bits (368), Expect = 0.0 Identities = 411/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacagccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacttatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 729 bits (368), Expect = 0.0 Identities = 411/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 722 bits (364), Expect = 0.0 Identities = 395/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 67 ccag-agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatta 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 409
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 718 bits (362), Expect = 0.0 Identities = 408/421 (96%), Gaps = 2/421 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 50 gtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattata 109 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 gtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattata 59 Query: 110 aattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 169 ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 aattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 118 Query: 170 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 229 ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 cgagtaactcctcaacctggggttcctccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 178 Query: 230 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 238 Query: 290 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 349 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 239 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 298 Query: 350 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 409 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 358 Query: 410 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 469 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 359 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 418 Query: 470 c 470 | Sbjct: 419 c 419
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 716 bits (361), Expect = 0.0 Identities = 394/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacact 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct: 67 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 409
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 716 bits (361), Expect = 0.0 Identities = 394/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacact 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct: 67 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 409
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 714 bits (360), Expect = 0.0 Identities = 393/403 (97%), Gaps = 1/403 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 68 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 127 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 60 Query: 128 cagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 187 | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct: 61 c-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacct 119 Query: 188 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 247 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 179 Query: 248 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 239 Query: 308 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 299 Query: 368 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 427 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 ctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 359 Query: 428 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 ttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 402
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 712 bits (359), Expect = 0.0 Identities = 395/406 (97%), Gaps = 1/406 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 65 aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactaca 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 6 aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactaca 65 Query: 125 ccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcag 184 |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 66 cccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcag 124 Query: 185 cctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 244 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125 cctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 184 Query: 245 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 185 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 244 Query: 305 cacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccatta 364 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 245 cacatcgagcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccatta 304 Query: 365 gacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 424 ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 305 gacttatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtattt 364 Query: 425 gggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 365 ggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 410
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 710 bits (358), Expect = 0.0 Identities = 394/405 (97%), Gaps = 1/405 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 66 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 125 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 aactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 62 Query: 126 cccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagc 185 ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | Sbjct: 63 ccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaac 121 Query: 186 ctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacat 245 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 ctggagttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacat 181 Query: 246 ggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 ggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatc 241 Query: 306 acatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattag 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 242 acatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattag 301 Query: 366 acctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttg 425 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 acctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttg 361 Query: 426 ggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 362 gtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 406
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 708 bits (357), Expect = 0.0 Identities = 393/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 67 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 409
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 708 bits (357), Expect = 0.0 Identities = 393/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 67 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 409
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 708 bits (357), Expect = 0.0 Identities = 393/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 62 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 63 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 121 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 tggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 181 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 241 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 242 catcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 301 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 tctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 361 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 362 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 405
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 708 bits (357), Expect = 0.0 Identities = 393/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 62 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct: 63 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacc 121 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 tggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 181 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 241 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 242 catcgatcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 301 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 361 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 362 tttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 405
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 708 bits (357), Expect = 0.0 Identities = 382/389 (98%), Gaps = 1/389 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 82 ggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaac 141 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1 ggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag-agtatgaaac 59 Query: 142 taaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccga 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccga 119 Query: 202 agaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggac 261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 agaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggac 179 Query: 262 tgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 180 tgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcc 239 Query: 322 tggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggaggg 381 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 240 tggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagaggg 299 Query: 382 ttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacg 441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 300 ttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacg 359 Query: 442 tgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 tgctctacgtttggaggatctacgaattc 388
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 706 bits (356), Expect = 0.0 Identities = 408/423 (96%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttattacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatactatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 704 bits (355), Expect = 0.0 Identities = 391/402 (97%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct: 61 -ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 401
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 704 bits (355), Expect = 0.0 Identities = 383/391 (97%), Gaps = 1/391 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 80 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaa 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccag-agtatgaa 59 Query: 140 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 119 Query: 200 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 179 Query: 260 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 239 Query: 320 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 379 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 240 cctggggaagaggagcaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 299 Query: 380 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 300 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 359 Query: 440 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 390
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 702 bits (354), Expect = 0.0 Identities = 406/421 (96%), Gaps = 2/421 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 50 gtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattata 109 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 gtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattata 59 Query: 110 aattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 169 ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 aattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 118 Query: 170 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 229 ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 cgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 178 Query: 230 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 238 Query: 290 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 349 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 239 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 298 Query: 350 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 409 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 gtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 358 Query: 410 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 469 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 359 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 418 Query: 470 c 470 | Sbjct: 419 c 419
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 700 bits (353), Expect = 0.0 Identities = 392/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct: 67 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggacgacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 409
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 700 bits (353), Expect = 0.0 Identities = 392/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct: 67 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcgattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 409
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 700 bits (353), Expect = 0.0 Identities = 392/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct: 67 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 409
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 700 bits (353), Expect = 0.0 Identities = 392/404 (97%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 60 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct: 61 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacc 119 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 179 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 239 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 catcgagcctgttgctggggacgacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 299 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 359 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 403
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 698 bits (352), Expect = 0.0 Identities = 391/403 (97%), Gaps = 1/403 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 68 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 127 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 60 Query: 128 cagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 187 | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct: 61 c-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacct 119 Query: 188 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 247 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 179 Query: 248 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 239 Query: 308 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 367 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 atcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 299 Query: 368 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 427 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 ctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 359 Query: 428 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 ttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 402
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 696 bits (351), Expect = 0.0 Identities = 390/402 (97%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 -ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcata 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttctattgtgggtaacgtatttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 401
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 696 bits (351), Expect = 0.0 Identities = 390/402 (97%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct: 61 -ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagatc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 401
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 696 bits (351), Expect = 0.0 Identities = 393/406 (96%), Gaps = 1/406 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 65 aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactaca 124 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7 aaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactaca 66 Query: 125 ccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcag 184 |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 67 cccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcag 125 Query: 185 cctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 244 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 cctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 185 Query: 245 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 245 Query: 305 cacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccatta 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 cacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccatta 305 Query: 365 gacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 424 ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 gacttatttgaagaaggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 365 Query: 425 gggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 366 ggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 411
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 692 bits (349), Expect = 0.0 Identities = 391/404 (96%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 7 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttattacacc 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 67 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 catcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 306 tctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 409
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 690 bits (348), Expect = 0.0 Identities = 406/423 (95%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaaatgttggatttaaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaacccctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgcctggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 688 bits (347), Expect = 0.0 Identities = 389/402 (96%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 -ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 401
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 688 bits (347), Expect = 0.0 Identities = 389/402 (96%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 -ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 401
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 688 bits (347), Expect = 0.0 Identities = 389/402 (96%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | Sbjct: 61 -ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacccg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggacgacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 401
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 684 bits (345), Expect = 0.0 Identities = 381/392 (97%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttaaagcaggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tgctggggaagacaatcaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 391
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 682 bits (344), Expect = 0.0 Identities = 405/423 (95%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcgggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagtcaatatatcgctt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 680 bits (343), Expect = 0.0 Identities = 373/382 (97%), Gaps = 1/382 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| Sbjct: 2 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggat 60 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 actgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagca 120 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 180 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 240 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 241 gacggccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgtt 300 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctcta 360 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtttggaggatctacgaattc 382
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 680 bits (343), Expect = 0.0 Identities = 376/386 (97%), Gaps = 1/386 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 85 tttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaa 144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || Sbjct: 1 tttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaa 59 Query: 145 ggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaaga 204 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 60 ggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaaga 119 Query: 205 agcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactga 264 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 agcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactga 179 Query: 265 tggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctgg 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 tggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctgg 239 Query: 325 ggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttc 384 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 240 ggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttc 299 Query: 385 cgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 300 cgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgc 359 Query: 445 tctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tctacgtctggaggatctacgaattc 385
>emb|AJ746280.1| Agrostis stolonifera chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1316 Score = 680 bits (343), Expect = 0.0 Identities = 388/402 (96%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggattccaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 -ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccgttagact 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtcggtaacgtatttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 401
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 680 bits (343), Expect = 0.0 Identities = 373/382 (97%), Gaps = 1/382 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| Sbjct: 2 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggat 60 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 actgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagca 120 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 180 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 240 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 241 gacggccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgtt 300 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctcta 360 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtttggaggatctacgaattc 382
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 680 bits (343), Expect = 0.0 Identities = 391/406 (96%), Gaps = 1/406 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 65 aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactaca 124 ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 7 aaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattatagattgacttactaca 66 Query: 125 ccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcag 184 |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 67 cccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcac 125 Query: 185 cctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 126 cctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 185 Query: 245 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 304 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 tggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 245 Query: 305 cacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccatta 364 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 246 cacatcgagcctgttgctggggaagacagtcaatggatctgttatgtagcttatccatta 305 Query: 365 gacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 424 || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 306 gatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtattt 365 Query: 425 gggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 366 ggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 411
>emb|AJ746255.1| Aira praecox chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1126 Score = 676 bits (341), Expect = 0.0 Identities = 380/392 (96%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || Sbjct: 240 tgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccgttagacttatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtcggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 391
>emb|AJ746279.1| Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1301 Score = 674 bits (340), Expect = 0.0 Identities = 379/391 (96%), Gaps = 1/391 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 80 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaa 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaa 59 Query: 140 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 199 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 accaaggatactgatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcctggggttccgccg 119 Query: 200 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 179 Query: 260 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 239 Query: 320 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 379 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 gctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagaa 299 Query: 380 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 300 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 359 Query: 440 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 360 cgtgctctacgtctggaagatctacgaattc 390
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 672 bits (339), Expect = 0.0 Identities = 390/406 (96%), Gaps = 1/406 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 65 aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactaca 124 ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 4 aaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattataaattgacttactaca 63 Query: 125 ccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcag 184 |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 64 cccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcag 122 Query: 185 cctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123 cctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 182 Query: 245 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 183 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 242 Query: 305 cacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccatta 364 |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 243 cacatcgagcctgttgctggggaagagagtcaatttatcgcttatgtagcttatccatta 302 Query: 365 gacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 424 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 303 gacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 362 Query: 425 gggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 363 ggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 408
>gb|AF458076.1| Trithuria submersa ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1333 Score = 672 bits (339), Expect = 0.0 Identities = 379/392 (96%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaastcctcaacccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tgctggggaagatagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 391
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 664 bits (335), Expect = 0.0 Identities = 371/382 (97%), Gaps = 1/382 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| Sbjct: 5 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggat 63 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 64 actgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagca 123 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 183 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 184 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 243 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| Sbjct: 244 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacttatttgaagaaggttccgtt 303 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 304 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctcta 363 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||| Sbjct: 364 cgtctggaggatctacgaattc 385
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 664 bits (335), Expect = 0.0 Identities = 371/382 (97%), Gaps = 1/382 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| Sbjct: 5 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggat 63 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 64 actgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagca 123 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 183 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 184 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 243 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| Sbjct: 244 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacttatttgaagaaggttccgtt 303 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 304 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctcta 363 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||| Sbjct: 364 cgtctggaggatctacgaattc 385
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 664 bits (335), Expect = 0.0 Identities = 386/402 (96%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaaatgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 61 -ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaacccctcaacctg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgtgctctacgcctggaggatctacgaattc 401
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 664 bits (335), Expect = 0.0 Identities = 371/382 (97%), Gaps = 1/382 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| Sbjct: 1 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggat 59 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 60 actgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagca 119 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 179 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 239 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 240 gacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgtt 299 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctcta 359 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 cgtctggaggatctacgaattc 381
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 662 bits (334), Expect = 0.0 Identities = 370/381 (97%), Gaps = 1/381 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 90 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggata 149 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| Sbjct: 1 agctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggata 59 Query: 150 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 209 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 60 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcag 119 Query: 210 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 179 Query: 270 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatatcgagcctgttgctggggaag 239 Query: 330 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 389 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 240 acaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgtta 299 Query: 390 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 449 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 ctaacatgtttacttctattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 359 Query: 450 gtttggaggatctacgaattc 470 || |||||||||||||||||| Sbjct: 360 gtctggaggatctacgaattc 380
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 662 bits (334), Expect = 0.0 Identities = 370/381 (97%), Gaps = 1/381 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 90 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggata 149 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| Sbjct: 1 agctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggata 59 Query: 150 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 209 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 60 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcag 119 Query: 210 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 179 Query: 270 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatatcgagcctgttgctggggaag 239 Query: 330 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 389 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 240 acaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgtta 299 Query: 390 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 449 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 ctaacatgtttacttctattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 359 Query: 450 gtttggaggatctacgaattc 470 || |||||||||||||||||| Sbjct: 360 gtctggaggatctacgaattc 380
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 656 bits (331), Expect = 0.0 Identities = 377/392 (96%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggastatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tgctggggaagacagtcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 391
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 648 bits (327), Expect = 0.0 Identities = 416/442 (94%), Gaps = 3/442 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 29 agttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttc 88 |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 400 agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggattta 457 Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| Sbjct: 458 aagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacgaaaccaaggat 516 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 517 actgatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcccggggttccgcctgaagaagca 576 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 577 ggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 636 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 637 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgttcctggggaa 696 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 697 gaagatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgtt 756 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 757 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctcta 816 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 817 cgtttggaggatctacgaattc 838
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 644 bits (325), Expect = 0.0 Identities = 376/392 (95%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagacagtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 391
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 644 bits (325), Expect = 0.0 Identities = 376/392 (95%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 120 cgaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggactactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagacagtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 391
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 644 bits (325), Expect = 0.0 Identities = 429/459 (93%), Gaps = 5/459 (1%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 123306 gaattcttaattcatg-agttgtaggg--gggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 123361 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 123362 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 123420 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 123421 agtacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 123480 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123481 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 123540 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123541 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 123600 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123601 agcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 123660 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 123661 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 123720 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 123721 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 123759 Score = 644 bits (325), Expect = 0.0 Identities = 429/459 (93%), Gaps = 5/459 (1%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 28779 gaattcttaattcatg-agttgtaggg--gggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 28834 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 28835 agcaagtgttggatttcaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 28893 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 28894 agtacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 28953 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 28954 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 29013 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29014 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 29073 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29074 agcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 29133 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29134 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 29193 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 29194 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 29232
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 642 bits (324), Expect = 0.0 Identities = 400/423 (94%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacaccccggaa-tacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagcccggggttccgcctgaagaagcaggggctgcagtagctgcgg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgaacccgttcctggggaagaggatcaatatatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagatctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 640 bits (323), Expect = 0.0 Identities = 415/442 (93%), Gaps = 3/442 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 29 agttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttc 88 |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 420 agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggattta 477 Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| Sbjct: 478 aagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacgaaaccaaggat 536 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 537 actgatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcccggggttccgcctgaagaagca 596 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 597 ggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 656 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 657 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgttcctggggag 716 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 717 gaagatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgtt 776 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 777 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctcta 836 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 837 cgtttggaggatctacgaattc 858
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 640 bits (323), Expect = 0.0 Identities = 400/423 (94%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaggtgttggatttaaagccggtgttaaagatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttattacactccag-agtacgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagcctggggttccccctgaagaagcaggagctgcagtagctgcgg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||| ||||||| Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacatcgagcccgttcctggggatgaaggtcaatatatctgtt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 636 bits (321), Expect = e-179 Identities = 375/392 (95%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggaagaagcaggggctgctgtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgctgctatcacatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tgctggggaagaaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 636 bits (321), Expect = e-179 Identities = 375/392 (95%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgaccgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagaggatcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 391
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 630 bits (318), Expect = e-178 Identities = 357/369 (96%), Gaps = 1/369 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 102 agattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttgg 161 |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1 agattatagattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttgg 59 Query: 162 cagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtag 221 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 cagcattccgagtaagtcctcaacctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtag 119 Query: 222 ctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttg 281 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 120 ctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttg 179 Query: 282 atcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatgga 341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 180 atcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagtcaatgga 239 Query: 342 tctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgttta 401 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tctgttatgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttactaacatgttta 299 Query: 402 cttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatc 461 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 300 cttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatc 359 Query: 462 tacgaattc 470 ||||||||| Sbjct: 360 tacgaattc 368
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 630 bits (318), Expect = e-178 Identities = 354/365 (96%), Gaps = 1/365 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 106 tataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagc 165 |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 tataaattgacttactacactcc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagc 59 Query: 166 attccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgc 225 ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 attccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgc 119 Query: 226 cgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcg 179 Query: 286 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctg 345 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 180 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctg 239 Query: 346 ttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 ttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttc 299 Query: 406 cattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacg 465 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 300 cattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacg 359 Query: 466 aattc 470 ||||| Sbjct: 360 aattc 364
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 630 bits (318), Expect = e-178 Identities = 354/365 (96%), Gaps = 1/365 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 106 tataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagc 165 |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 tataaattgacttactacactcc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagc 59 Query: 166 attccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgc 225 ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 attccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgc 119 Query: 226 cgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcg 179 Query: 286 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctg 345 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 180 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctg 239 Query: 346 ttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 ttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttc 299 Query: 406 cattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacg 465 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 300 cattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacg 359 Query: 466 aattc 470 ||||| Sbjct: 360 aattc 364
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 628 bits (317), Expect = e-177 Identities = 383/404 (94%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 60 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 ccggaa-tacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 119 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cggggttccgcctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatg 179 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 239 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 240 catcgaacccgttcctggggaagacagtcaatatatctgttatatagcttatccattaga 299 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 300 tctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcaattgtgggtaacgtatttgg 359 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 tttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 403
>emb|AJ746294.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1295 Score = 628 bits (317), Expect = e-177 Identities = 365/380 (96%), Gaps = 1/380 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 91 gctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatac 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| Sbjct: 1 gctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatac 59 Query: 151 tgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagg 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 tgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagg 119 Query: 211 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaacagtttggactgatggact 179 Query: 271 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaaga 330 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 180 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaaga 239 Query: 331 cagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttac 390 | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 240 cggccaatggatcgcttatgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttac 299 Query: 391 taacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacg 450 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 taacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacg 359 Query: 451 tttggaggatctacgaattc 470 | |||| ||||||||||||| Sbjct: 360 tctggaagatctacgaattc 379
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 628 bits (317), Expect = e-177 Identities = 374/392 (95%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacggtgttatcacatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagaaagtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtctggaggatctgcgaattc 391
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54069 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 54125 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 54126 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 54184 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 54185 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 54244 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54245 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 54304 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54305 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 54364 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54365 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 54424 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54425 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 54484 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 54485 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 54523
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54069 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 54125 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 54126 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 54184 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 54185 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 54244 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54245 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 54304 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54305 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 54364 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54365 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 54424 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54425 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 54484 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 54485 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 54523
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54017 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 54073 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 54074 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 54132 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 54133 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 54192 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54193 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 54252 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54253 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 54312 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54313 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 54372 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54373 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 54432 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 54433 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 54471
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124358 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 124414 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 124415 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 124473 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 124474 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 124533 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124534 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 124593 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124594 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 124653 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124654 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 124713 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124714 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 124773 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 124774 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 124812 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29298 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 29354 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 29355 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 29413 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 29414 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 29473 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29474 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 29533 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29534 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 29593 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29594 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 29653 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29654 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 29713 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 29714 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 29752
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 123385 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 123441 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 123442 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 123500 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 123501 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 123560 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123561 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 123620 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 123621 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 123680 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123681 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 123740 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 123741 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 123800 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 123801 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 123839 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 28804 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 28860 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 28861 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 28919 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 28920 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 28979 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 28980 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 29039 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29040 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 29099 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29100 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 29159 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29160 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 29219 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 29220 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 29258
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 123385 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 123441 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 123442 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 123500 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 123501 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 123560 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123561 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 123620 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 123621 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 123680 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123681 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 123740 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 123741 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 123800 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 123801 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 123839 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 28804 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 28860 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 28861 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 28919 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 28920 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 28979 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 28980 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 29039 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29040 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 29099 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29100 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 29159 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29160 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 29219 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 29220 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 29258
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54061 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 54117 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 54118 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 54176 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 54177 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 54236 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54237 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 54296 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54297 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 54356 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54357 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 54416 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54417 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 54476 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 54477 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 54515
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 33547395 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 33547451 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 33547452 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 33547510 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 33547511 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 33547570 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33547571 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 33547630 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 33547631 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 33547690 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33547691 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 33547750 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 33547751 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 33547810 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 33547811 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 33547849 Score = 125 bits (63), Expect = 1e-25 Identities = 101/110 (91%), Gaps = 3/110 (2%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 14122783 gaattcttaattcat-tagttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 14122839 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttact 121 |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 14122840 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttact 14122889 Score = 105 bits (53), Expect = 1e-19 Identities = 131/155 (84%), Gaps = 4/155 (2%) Strand = Plus / Minus Query: 162 cagcattccgagtaagtcctcagcctgggg-ttccgcccgaagaagcaggggctgcagta 220 ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||| || |||| || || Sbjct: 30075609 cagcattccgagtaactcctcagacggggggttccgcccaaaggaga---ggctacaata 30075553 Query: 221 gctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtctt 280 ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||| Sbjct: 30075552 gctaccaaatcttctactggtacatggacaattgtttggattaatggacttactagtctt 30075493 Query: 281 gatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 315 ||| | |||||||| ||||||||||||| |||| Sbjct: 30075492 gattgctacaaaggcttatgctatcacatcaagcc 30075458 Score = 65.9 bits (33), Expect = 1e-07 Identities = 70/81 (86%), Gaps = 1/81 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 47 tatgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatt 106 ||||||||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||| Sbjct: 30075723 tatgtcaccggaaacag-aaactaaagaaaatgttaaatttcaagctggtgtcaagaatt 30075665 Query: 107 ataaattgacttactacaccc 127 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30075664 ataaattgacttactacaccc 30075644
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 92592 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 92648 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 92649 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 92707 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 92708 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 92767 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 92768 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 92827 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 92828 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 92887 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 92888 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 92947 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 92948 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 93007 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 93008 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 93046
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 22 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 78 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 79 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 137 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 138 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 197 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 198 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 257 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 258 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 317 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 318 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 377 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 378 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 437 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 438 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 476
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 53996 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 54052 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 54053 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 54111 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 54112 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 54171 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54172 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 54231 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54232 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 54291 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54292 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 54351 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54352 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 54411 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 54412 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 54450
>gb|L24073.1|RICCHRBCLA Oryza sativa chloroplast rubisco large subunit (rbcL) mRNA, complete cds Length = 1355 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 57 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 58 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 116 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 117 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 176 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 177 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 236 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 237 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 296 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 297 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 356 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 357 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 416 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 417 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 455
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 354 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 410 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 411 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 469 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 470 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 529 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 530 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 589 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 590 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 649 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 650 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 709 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 710 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 769 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 770 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 808
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 626 bits (316), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 387 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 443 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 444 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 502 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 503 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 562 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 563 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 622 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 623 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 682 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 683 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 742 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 743 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 802 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 803 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 841
>gb|AY632370.1| Phaenosperma globosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1143 Score = 624 bits (315), Expect = e-176 Identities = 363/378 (96%), Gaps = 1/378 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 93 tggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| Sbjct: 1 tggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactg 59 Query: 153 atatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagggg 212 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 atatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagggg 119 Query: 213 ctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactta 272 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ctgcagtagctgtcgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactta 179 Query: 273 ccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagaca 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 180 ccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctagggaagaca 239 Query: 333 gccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttacta 392 | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 240 gtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccattacta 299 Query: 393 acatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtt 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 acatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtc 359 Query: 453 tggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||| Sbjct: 360 tggaggatctacgaattc 377
>gb|AC135419.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 5 clone OSJNBa0044P19, complete sequence Length = 176917 Score = 624 bits (315), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 142828 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 142884 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 142885 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccag- 142943 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| Sbjct: 142944 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgaataactcctcagccggggg 143003 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 143004 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgctgaatcttctactggtacatggacaa 143063 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 143064 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 143123 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 143124 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 143183 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 143184 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 143243 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 143244 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 143282
>gb|AC135429.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 5 clone P0636F09, complete sequence Length = 177374 Score = 624 bits (315), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 85405 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 85461 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 85462 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccag- 85520 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| Sbjct: 85521 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgaataactcctcagccggggg 85580 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 85581 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgctgaatcttctactggtacatggacaa 85640 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 85641 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 85700 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 85701 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 85760 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 85761 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 85820 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 85821 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 85859
>dbj|AP008211.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 5, complete sequence Length = 29737217 Score = 624 bits (315), Expect = e-176 Identities = 427/459 (93%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 20829604 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 20829660 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 20829661 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccag- 20829719 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| Sbjct: 20829720 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgaataactcctcagccggggg 20829779 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 20829780 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgctgaatcttctactggtacatggacaa 20829839 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 20829840 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 20829899 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 20829900 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 20829959 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 20829960 ttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 20830019 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 20830020 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 20830058
>gb|AY395529.1| Arrhenatherum elatius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1259 Score = 622 bits (314), Expect = e-175 Identities = 350/361 (96%), Gaps = 1/361 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 110 aattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 169 ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 aattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 59 Query: 170 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 229 ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 cgagtaactcctcaacctggagttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 119 Query: 230 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 179 Query: 290 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 349 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 180 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatagatctgttat 239 Query: 350 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 409 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 299 Query: 410 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 469 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 300 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 359 Query: 470 c 470 | Sbjct: 360 c 360
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 620 bits (313), Expect = e-175 Identities = 373/392 (95%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 620 bits (313), Expect = e-175 Identities = 429/460 (93%), Gaps = 6/460 (1%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 56840 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 56896 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 56897 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 56955 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 56956 agtacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagctcgggg 57015 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57016 ttccgcctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaa 57075 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57076 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 57135 Query: 312 agcctgttgctggggaagacag-ccaatggatctgttatgtagcttatccattagaccta 370 |||| ||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57136 agcccgttcctgggg-acccagatcaatatatctgttatgtagcttatccattagaccta 57194 Query: 371 tttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttc 430 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57195 tttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttc 57254 Query: 431 aaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57255 aaagccttacgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 57294
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 620 bits (313), Expect = e-175 Identities = 429/460 (93%), Gaps = 6/460 (1%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 119048 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 119104 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 119105 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 119163 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 119164 agtacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagctcgggg 119223 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119224 ttccgcctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaa 119283 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119284 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 119343 Query: 312 agcctgttgctggggaagacag-ccaatggatctgttatgtagcttatccattagaccta 370 |||| ||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119344 agcccgttcctgggg-acccagatcaatatatctgttatgtagcttatccattagaccta 119402 Query: 371 tttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttc 430 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 119403 tttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttc 119462 Query: 431 aaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119463 aaagccttacgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 119502
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 620 bits (313), Expect = e-175 Identities = 429/460 (93%), Gaps = 6/460 (1%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 56850 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 56906 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 56907 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 56965 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 56966 agtacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagctcgggg 57025 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57026 ttccgcctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaa 57085 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57086 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 57145 Query: 312 agcctgttgctggggaagacag-ccaatggatctgttatgtagcttatccattagaccta 370 |||| ||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57146 agcccgttcctgggg-acccagatcaatatatctgttatgtagcttatccattagaccta 57204 Query: 371 tttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttc 430 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57205 tttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttc 57264 Query: 431 aaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57265 aaagccttacgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 57304
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 620 bits (313), Expect = e-175 Identities = 429/460 (93%), Gaps = 6/460 (1%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 57421 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacttatgtcaccacaaacag-aaactaa 57477 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 57478 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 57536 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 57537 agtacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagctcgggg 57596 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57597 ttccgcctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaa 57656 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57657 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 57716 Query: 312 agcctgttgctggggaagacag-ccaatggatctgttatgtagcttatccattagaccta 370 |||| ||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57717 agcccgttcctgggg-acccagatcaatatatctgttatgtagcttatccattagaccta 57775 Query: 371 tttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttc 430 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57776 tttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttc 57835 Query: 431 aaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57836 aaagccttacgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 57875
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 620 bits (313), Expect = e-175 Identities = 373/392 (95%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tgctggggaagaaactcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccaatgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtctggaggatctacgaattc 391
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 618 bits (312), Expect = e-174 Identities = 426/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 52271 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 52327 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 52328 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 52386 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 52387 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 52446 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 52447 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 52506 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 52507 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 52566 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 52567 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 52626 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 52627 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 52686 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| Sbjct: 52687 aagccctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattc 52725
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 618 bits (312), Expect = e-174 Identities = 426/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 127204 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 127260 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 127261 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 127319 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 127320 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 127379 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 127380 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 127439 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 127440 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 127499 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 127500 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 127559 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 127560 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 127619 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| Sbjct: 127620 aagccctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattc 127658
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 618 bits (312), Expect = e-174 Identities = 426/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10345879 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 10345935 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 10345936 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 10345994 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 10345995 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 10346054 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346055 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 10346114 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 10346115 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 10346174 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346175 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 10346234 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10346235 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 10346294 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| Sbjct: 10346295 aagccctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattc 10346333
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 618 bits (312), Expect = e-174 Identities = 426/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 23205026 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 23204970 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 23204969 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 23204911 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 23204910 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 23204851 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204850 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 23204791 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 23204790 ctgtttgaactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 23204731 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204730 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 23204671 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 23204670 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 23204611 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 23204610 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 23204572
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 618 bits (312), Expect = e-174 Identities = 426/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 155674 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 155618 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 155617 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 155559 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 155558 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 155499 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 155498 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 155439 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 155438 ctgtttgaactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 155379 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 155378 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 155319 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 155318 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 155259 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 155258 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 155220
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 618 bits (312), Expect = e-174 Identities = 426/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 39788 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 39732 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 39731 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 39673 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 39672 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 39613 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39612 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 39553 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 39552 ctgtttgaactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 39493 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39492 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 39433 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 39432 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 39373 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 39372 aagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 39334
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 618 bits (312), Expect = e-174 Identities = 426/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10351918 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 10351974 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 10351975 agcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 10352033 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 10352034 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 10352093 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352094 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 10352153 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 10352154 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 10352213 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352214 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 10352273 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10352274 ttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttca 10352333 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| Sbjct: 10352334 aagccctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattc 10352372
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 617 bits (311), Expect = e-173 Identities = 381/403 (94%), Gaps = 1/403 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 68 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 127 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1 ctaaagcaggtgttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactc 60 Query: 128 cagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 187 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 61 cag-agtacgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcct 119 Query: 188 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 247 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggggttccccctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatgg 179 Query: 248 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 180 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaagggacgatgctatcac 239 Query: 308 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 367 |||||||| ||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 atcgagcccgttcctggggaggaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagac 299 Query: 368 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 427 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 300 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggt 359 Query: 428 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 402
>dbj|AK058516.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-016-H01, full insert sequence Length = 544 Score = 617 bits (311), Expect = e-173 Identities = 412/442 (93%), Gaps = 3/442 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 29 agttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttc 88 |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5 agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggattta 62 Query: 89 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggat 148 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| Sbjct: 63 aagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacgaaaccaaggac 121 Query: 149 actgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagca 208 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 actgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagca 181 Query: 209 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 ggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatgga 241 Query: 269 cttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaa 328 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct: 242 cttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcccgttgttggggag 301 Query: 329 gacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtt 388 || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 302 gataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgtt 361 Query: 389 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctcta 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 362 actaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctcta 421 Query: 449 cgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 422 cgtctggaggatctgcgaattc 443
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 611 bits (308), Expect = e-172 Identities = 396/423 (93%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttattacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| || Sbjct: 239 acaaagggcgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgctt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 611 bits (308), Expect = e-172 Identities = 396/423 (93%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaggatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagctggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||| ||| || Sbjct: 239 acaaaggacgatgctatcacattgagcccgttgttggggaagaaaatcaatatatcgctt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 359 ttgtaggtaacgtatttggtttcaaagctctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 611 bits (308), Expect = e-172 Identities = 396/423 (93%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttattacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| || Sbjct: 239 acaaagggcgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgctt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 611 bits (308), Expect = e-172 Identities = 396/423 (93%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttattacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| || Sbjct: 239 acaaagggcgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgctt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 611 bits (308), Expect = e-172 Identities = 425/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5613109 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 5613165 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 5613166 agcaaatgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 5613224 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 5613225 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 5613284 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613285 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 5613344 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 5613345 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 5613404 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613405 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 5613464 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 5613465 ttgaagagggttttgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacatatttggtttca 5613524 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 5613525 aagccctacgtgctctacgtctggaggatctgcgaattc 5613563
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 611 bits (308), Expect = e-172 Identities = 425/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5613098 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 5613154 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 5613155 agcaaatgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 5613213 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 5613214 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 5613273 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613274 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 5613333 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 5613334 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 5613393 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613394 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 5613453 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 5613454 ttgaagagggttttgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacatatttggtttca 5613513 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 5613514 aagccctacgtgctctacgtctggaggatctgcgaattc 5613552
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 611 bits (308), Expect = e-172 Identities = 425/459 (92%), Gaps = 4/459 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 gaattcttaattcaagnagttgtagggnagggacttatgtcaccacaaacagnaaactaa 71 |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 39776 gaattcttaattcatg-agttgtaggg-agggacgtatgtcaccacaaacag-aaactaa 39720 Query: 72 agcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagn 131 |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 39719 agcaaatgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-gg 39661 Query: 132 agtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgggg 191 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 39660 agtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccggggg 39601 Query: 192 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39600 ttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaa 39541 Query: 252 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcg 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 39540 ctgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcg 39481 Query: 312 agcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctat 371 |||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39480 agcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctat 39421 Query: 372 ttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttca 431 |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 39420 ttgaagagggttttgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacatatttggtttca 39361 Query: 432 aagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 39360 aagccctacgtgctctacgtctggaggatctgcgaattc 39322
>emb|AJ746296.1| Nardus stricta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1297 Score = 607 bits (306), Expect = e-170 Identities = 363/381 (95%), Gaps = 1/381 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 90 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggata 149 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| Sbjct: 1 agctggtgttacagattataaattgacttactacacccc-ggagtatgaaaccaaggata 59 Query: 150 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 209 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 60 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcag 119 Query: 210 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 269 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggctgctgtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 179 Query: 270 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 329 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgctgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 239 Query: 330 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 389 | | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 240 aaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgtta 299 Query: 390 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 449 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 ctaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 359 Query: 450 gtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 gtttggaggatctacgaattc 380
>gb|AY632375.1| Zoysia sp. JID-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1176 Score = 605 bits (305), Expect = e-170 Identities = 371/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggaa-tacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgaacccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagacagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagatttatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 605 bits (305), Expect = e-170 Identities = 371/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaggaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 605 bits (305), Expect = e-170 Identities = 380/404 (94%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 62 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 63 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcc 121 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 gggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 181 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 241 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 |||||||||||||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 242 catcgagcctgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattaga 301 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 361 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 362 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 405
>emb|AJ746175.1| Bambusa emeiensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 707 Score = 605 bits (305), Expect = e-170 Identities = 380/404 (94%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 60 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 119 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 179 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 239 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 ||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 catcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattaga 299 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 359 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 360 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 403
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 605 bits (305), Expect = e-170 Identities = 380/404 (94%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 61 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 62 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 120 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 180 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 240 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 ||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 catcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattaga 300 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 360 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 361 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 404
>emb|AJ746170.1| Bambusa multiplex chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 707 Score = 605 bits (305), Expect = e-170 Identities = 380/404 (94%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 60 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 cc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 119 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 179 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 239 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 ||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 catcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattaga 299 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 359 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 360 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 403
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 605 bits (305), Expect = e-170 Identities = 371/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaggaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 605 bits (305), Expect = e-170 Identities = 371/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaggaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 actcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 603 bits (304), Expect = e-169 Identities = 395/423 (93%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacacccc-ggagtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| || Sbjct: 239 acaaaggccgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggataatcaatatatcgctt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 603 bits (304), Expect = e-169 Identities = 395/423 (93%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttattacacccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| || | |||| ||| || Sbjct: 239 acaaagggcgatgctatcacattgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgctt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>emb|AJ746174.1| Dendrocalamus brandisii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 703 Score = 603 bits (304), Expect = e-169 Identities = 379/403 (94%), Gaps = 1/403 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 68 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 127 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccc 60 Query: 128 cagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 187 | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 c-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccg 119 Query: 188 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 179 Query: 248 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 239 Query: 308 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 367 |||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 atcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 299 Query: 368 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 427 |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 359 Query: 428 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 360 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 402
>emb|AJ746173.1| Dendrocalamus barbatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 702 Score = 603 bits (304), Expect = e-169 Identities = 379/403 (94%), Gaps = 1/403 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 68 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 127 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccc 60 Query: 128 cagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 187 | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 c-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccg 119 Query: 188 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 179 Query: 248 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 239 Query: 308 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 367 |||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 atcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 299 Query: 368 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 427 |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 359 Query: 428 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 360 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 402
>emb|AJ746295.1| Molinia caerulea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 601 bits (303), Expect = e-169 Identities = 378/402 (94%), Gaps = 1/402 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 69 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 128 ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttaaagccggtgttaaggattataaattgacttactacacccc 60 Query: 129 agnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 188 | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 61 -ggagtacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccg 119 Query: 189 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 248 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 gggttccgcctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatgga 179 Query: 249 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 239 Query: 309 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 368 ||||||| ||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 tcgagcccgttcctggggacgaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacc 299 Query: 369 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 428 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 300 tatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 359 Query: 429 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 tcaaagccctacgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 401
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 599 bits (302), Expect = e-168 Identities = 372/394 (94%), Gaps = 1/394 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 77 gtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtat 136 ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| Sbjct: 1 gtgttggatttaaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactccag-agtac 59 Query: 137 gaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccg 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 60 gaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccc 119 Query: 197 cccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtt 256 || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtt 179 Query: 257 tggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcct 316 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 tggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagccc 239 Query: 317 gttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgag 376 ||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 240 gttcctggggatgaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaa 299 Query: 377 gagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcc 436 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 300 gagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcc 359 Query: 437 ctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 ctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 393
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 599 bits (302), Expect = e-168 Identities = 380/405 (93%), Gaps = 1/405 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 66 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 125 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 aactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacac 60 Query: 126 cccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagc 185 ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 61 ccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagc 119 Query: 186 ctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacat 245 | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgggggttccgcccgaagaagccggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacat 179 Query: 246 ggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 ggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatc 239 Query: 306 acatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattag 365 |||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 240 acatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattag 299 Query: 366 acctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttg 425 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 300 acctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttg 359 Query: 426 ggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 360 gtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 404
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 599 bits (302), Expect = e-168 Identities = 380/405 (93%), Gaps = 1/405 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 66 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 125 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 aactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacac 62 Query: 126 cccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagc 185 ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 63 ccc-ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagc 121 Query: 186 ctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacat 245 | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 cgggggttccgcccgaagaagccggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacat 181 Query: 246 ggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 ggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatc 241 Query: 306 acatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattag 365 |||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 242 acatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattag 301 Query: 366 acctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttg 425 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 acctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttg 361 Query: 426 ggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 362 gtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 406
>gb|AY632371.1| Spartina pectinata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1180 Score = 597 bits (301), Expect = e-167 Identities = 370/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggaa-tacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgaacccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagacagtcaatatatctgttatatagcttatccgttagatctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>gb|AY632363.1| Distichlis spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1176 Score = 597 bits (301), Expect = e-167 Identities = 370/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggaa-tacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactccgcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagcagcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgaacccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagacagtcaatatatctgttatatagcttatccattagatctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>gb|AY632362.1| Buergersiochloa bambusoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1171 Score = 597 bits (301), Expect = e-167 Identities = 370/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtatga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tgctggggaagaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagctct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtctggaggatctgcgaattc 391
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 597 bits (301), Expect = e-167 Identities = 370/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 597 bits (301), Expect = e-167 Identities = 370/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 597 bits (301), Expect = e-167 Identities = 370/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>gb|U31379.1|MPU31379 Monachather paradoxus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 597 bits (301), Expect = e-167 Identities = 370/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacccc-ggagtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 597 bits (301), Expect = e-167 Identities = 370/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| || Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactccag-agtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 60 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccccc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggagctgcagtagctgcngaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaagggacgatgctatcacatcgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaggaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 597 bits (301), Expect = e-167 Identities = 370/392 (94%), Gaps = 1/392 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagnagtatga 138 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| || Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttactacactcc-ggagtacga 59 Query: 139 aactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcc 198 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 60 aaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcc 119 Query: 199 cgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttg 258 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 tgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttg 179 Query: 259 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgt 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 180 gactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacattgagcccgt 239 Query: 319 tgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagga 378 | |||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 240 tcctggggaagaaagtcaatatatctgttatatagcttatccattagacctatttgaaga 299 Query: 379 gggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccct 438 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 300 gggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccct 359 Query: 439 acgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 acgcgctctacgtttggaggatctacgaattc 391
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 595 bits (300), Expect = e-167 Identities = 394/423 (93%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 atgtcaccacaaacagnaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 107 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacag-aaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggatta 59 Query: 108 taaattgacttactacaccccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcat 167 ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 60 taaattgacttactacacccc-ggagtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcat 118 Query: 168 tccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 227 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119 tccgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccg 178 Query: 228 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 179 aatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgtt 238 Query: 288 acaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgtt 347 ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| || Sbjct: 239 acaaaggccgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggataatcaatatatcgctt 298 Query: 348 atgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcca 407 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 299 atgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcca 358 Query: 408 ttgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaa 467 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| Sbjct: 359 ttgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacttctggaggatctgcgaa 418 Query: 468 ttc 470 ||| Sbjct: 419 ttc 421
>gb|AY691638.1| Pyrrhanthera exigua ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 595 bits (300), Expect = e-167 Identities = 379/404 (93%), Gaps = 1/404 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 126 ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 7 actaaagcaggtgttggatttaaagccggtgttaaagattataaattgacttattacact 66 Query: 127 ccagnagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 186 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 67 ccag-agtacgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 125 Query: 187 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 246 ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 126 tggggttccccctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatg 185 Query: 247 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 306 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 186 gacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 245 Query: 307 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 366 ||||||||| ||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 246 catcgagcccgttcctggggatgaagggcaatatatctgttatgtagcttacccattaga 305 Query: 367 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 426 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 306 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaatgtatttgg 365 Query: 427 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 366 tttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 409 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 3,058,797 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 3058797 Number of successful extensions: 98927 Number of sequences better than 10.0: 16027 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15683 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 345 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 54707 Number of HSP's gapped (non-prelim): 29512 length of query: 470 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 22 effective length of query: 448 effective length of database: 17,147,199,772 effective search space: 7681945497856 effective search space used: 7681945497856 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)