| Clone Name | rbags31p21 |
|---|---|
| Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 662/665 (99%), Gaps = 3/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gaccttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttc 61 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1547 gaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 242 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 302 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 362 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 422 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccccta 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 947 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccccta 889 Query: 662 attct 666 ||||| Sbjct: 888 attct 884
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 662/665 (99%), Gaps = 3/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gaccttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttc 61 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1547 gaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 242 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 302 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 362 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 422 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccccta 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 947 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccccta 889 Query: 662 attct 666 ||||| Sbjct: 888 attct 884
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 662/665 (99%), Gaps = 3/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gaccttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttc 61 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1485 gaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1426 Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1366 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1306 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1246 Query: 242 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1186 Query: 302 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1126 Query: 362 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1066 Query: 422 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 886 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccccta 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 885 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccccta 827 Query: 662 attct 666 ||||| Sbjct: 826 attct 822
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 660/664 (99%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1067 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1007 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 947 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 946 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 888 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 887 ttct 884
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 652/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 652/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 652/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 652/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 652/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 652/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 652/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 652/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 652/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 657/664 (98%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1067 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcaatgctttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1007 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 947 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 946 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 888 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 887 ttct 884
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 651/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 651/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 642/646 (99%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctakttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 651/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 651/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 651/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 651/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 651/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 651/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 651/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 640/644 (99%), Gaps = 2/644 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 895
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 650/656 (99%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 649/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 648/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 647/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 938 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 640/646 (99%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 640/646 (99%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 640/646 (99%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 640/646 (99%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 654/664 (98%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1005 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 945 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 885 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 826 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 825 ttct 822
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 653/664 (98%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1484 accttcttatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1005 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 945 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 885 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 826 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 825 ttct 822
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 638/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 639/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 639/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 639/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 638/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 638/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 653/664 (98%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 945 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 887 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 886 ttct 883
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 653/664 (98%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 945 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 887 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 886 ttct 883
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 653/664 (98%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 945 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 887 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 886 ttct 883
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 647/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 649/659 (98%), Gaps = 3/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 cttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagc 67 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1490 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1431 Query: 68 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1371 Query: 128 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 187 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1311 Query: 188 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 247 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1251 Query: 248 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1191 Query: 308 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1131 Query: 368 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1071 Query: 428 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1011 Query: 488 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 951 Query: 548 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 607 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 950 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 891 Query: 608 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 890 atttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 833
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 649/659 (98%), Gaps = 3/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 cttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagc 67 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 68 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 128 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 187 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 188 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 247 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 248 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 308 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 368 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 428 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 488 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 548 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 607 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 880 Query: 608 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 879 atttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 649/659 (98%), Gaps = 3/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 cttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagc 67 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 56340 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 56281 Query: 68 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56280 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 56221 Query: 128 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 187 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56220 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 56161 Query: 188 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 247 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56160 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 56101 Query: 248 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56100 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 56041 Query: 308 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56040 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 55981 Query: 368 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55980 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 55921 Query: 428 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55920 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 55861 Query: 488 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55860 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 55801 Query: 548 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 607 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55800 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 55741 Query: 608 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55740 atttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 55683
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 649/659 (98%), Gaps = 3/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 cttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagc 67 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1526 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1467 Query: 68 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1407 Query: 128 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 187 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1347 Query: 188 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 247 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1287 Query: 248 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1227 Query: 308 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1167 Query: 368 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1107 Query: 428 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1047 Query: 488 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 987 Query: 548 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 607 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 986 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 927 Query: 608 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 926 atttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 869
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 648/658 (98%), Gaps = 3/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 ttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagct 68 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1539 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1480 Query: 69 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1420 Query: 129 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 188 ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 agatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1360 Query: 189 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 248 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1300 Query: 249 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1240 Query: 309 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1180 Query: 369 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1120 Query: 429 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 488 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 ccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 1060 Query: 489 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 1000 Query: 549 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 608 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 999 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta 940 Query: 609 tttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 939 tttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 883
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 637/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 638/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 638/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 638/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 638/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 637/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagttca 1359 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 879 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 819 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 818 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 651/664 (98%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 945 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 887 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 886 ttct 883
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 646/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 938 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 937 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 883
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 645/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 651/664 (98%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1005 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 945 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 885 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 826 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 825 ttct 822
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 648/659 (98%), Gaps = 3/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 cttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagc 67 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 68 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 128 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 187 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 188 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 247 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 248 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 308 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 368 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 427 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 428 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 488 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 548 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 607 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 880 Query: 608 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 879 atttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 637/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 645/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ngctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 650/664 (97%), Gaps = 3/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttcttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttca 62 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttyg 1126 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 946 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 945 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 887 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 886 ttct 883
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0 Identities = 653/665 (98%), Gaps = 4/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttctt-atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttc 61 |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 241 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 242 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 302 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 362 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 422 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1011 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 951 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccccta 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 950 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccccta 892 Query: 662 attct 666 ||||| Sbjct: 891 attct 887
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0 Identities = 646/659 (98%), Gaps = 3/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 cttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagc 67 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 68 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 128 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 187 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 188 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 247 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 248 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 308 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 368 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 428 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 488 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 548 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 607 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 880 Query: 608 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 879 atttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 645/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 645/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 645/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1395 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1336 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1276 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1216 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1156 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1096 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1036 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1035 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 976 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 916 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 856 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 855 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 796 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 795 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 741
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 645/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 645/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 636/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 647/659 (98%), Gaps = 3/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 cttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagc 67 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1268 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1209 Query: 68 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1149 Query: 128 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 187 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1089 Query: 188 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 247 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1029 Query: 248 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 969 Query: 308 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 909 Query: 368 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 849 Query: 428 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 789 Query: 488 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 729 Query: 548 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 607 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 728 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagt 669 Query: 608 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 668 atttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 611
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 652/665 (98%), Gaps = 4/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttctt-atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttc 61 |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 241 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 242 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 302 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 362 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 422 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1011 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 951 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccccta 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 950 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccccta 892 Query: 662 attct 666 ||||| Sbjct: 891 attct 887
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 636/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1255 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1196 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1195 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1136 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1076 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1016 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 956 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 896 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 836 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 776 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 775 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 716 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 715 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaat 656 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 655 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 611
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 635/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 652/665 (98%), Gaps = 4/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttctt-atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttc 61 |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 241 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 242 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 302 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 362 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 422 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 934 Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 874 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 873 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaa 814 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccccta 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 813 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccccta 755 Query: 662 attct 666 ||||| Sbjct: 754 attct 750
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 644/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1397 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1338 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1278 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1218 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1158 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1098 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cggtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1038 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 978 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 918 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 858 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 857 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 798 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 797 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 743
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 652/665 (98%), Gaps = 4/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttctt-atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttc 61 |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 241 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 242 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 302 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 362 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 422 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 934 Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 874 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 873 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaa 814 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccccta 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 813 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccccta 755 Query: 662 attct 666 ||||| Sbjct: 754 attct 750
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 644/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 643/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 643/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 644/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cgctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 651/665 (97%), Gaps = 4/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttctt-atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttc 61 |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 241 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 242 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 302 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 362 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 422 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataac 1011 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 951 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccccta 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 950 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccccta 892 Query: 662 attct 666 ||||| Sbjct: 891 attct 887
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 645/658 (98%), Gaps = 3/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 ttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagct 68 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1371 Query: 69 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1311 Query: 129 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 188 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 189 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 248 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 249 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 309 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 368 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 369 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 429 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 488 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 489 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 891 Query: 549 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 608 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagta 831 Query: 609 tttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 830 tttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 624/634 (98%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 895
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 635/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1328 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1327 ggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1268 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1208 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1148 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1088 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1028 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 968 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 908 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 848 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 847 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaat 788 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 787 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 743
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 632/646 (97%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 643/656 (98%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 650/665 (97%), Gaps = 4/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accttctt-atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttc 61 |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 241 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgcnnnaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 242 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 302 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 362 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 422 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1011 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 951 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccccta 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 950 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccccta 892 Query: 662 attct 666 ||||| Sbjct: 891 attct 887
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 634/646 (98%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 927 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 867 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 866 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 642/656 (97%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 642/656 (97%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 876 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaatagg-aacccctaattct 822
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 633/646 (97%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1255 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1196 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1195 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1136 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1135 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgca 1076 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1016 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 956 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 896 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 836 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 776 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 775 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 716 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 715 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaat 656 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 655 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 611
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 640/656 (97%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 629/646 (97%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccct 1409 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1108 cctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaat 1049 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 989 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 929 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 928 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 884
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 642/659 (97%), Gaps = 3/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 cttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagc 67 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1482 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1423 Query: 68 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 127 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1422 cgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagc 1363 Query: 128 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 187 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1303 Query: 188 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 247 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgga 1243 Query: 248 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 307 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 atcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1183 Query: 308 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1123 Query: 368 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1063 Query: 428 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1003 Query: 488 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1002 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatg 943 Query: 548 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 607 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 942 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 883 Query: 608 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 atttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 825
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 621/634 (97%), Gaps = 2/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 aactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 92 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 93 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 152 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 153 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 212 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 213 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 273 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 333 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 392 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 393 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 452 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 453 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 512 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 917 Query: 513 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 857 Query: 573 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaag 632 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 856 aagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaag 797 Query: 633 tagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 796 tagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 764
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 581/583 (99%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 637/656 (97%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || Sbjct: 1388 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1329 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1328 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1269 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1268 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1209 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1208 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1149 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1089 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1029 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 969 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 909 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 849 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 848 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 789 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 788 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 734
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 637/656 (97%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 580/583 (99%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 790 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 789 ccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 748
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 628/646 (97%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttca 1339 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1338 ggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1279 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1278 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgca 1219 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1218 tttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1159 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1099 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1039 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactta 979 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 919 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 859 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 799 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 798 cccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 754
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 628/646 (97%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttca 1359 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaag 1179 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagctta 999 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 879 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 878 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 819 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 818 cccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 628/646 (97%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1516 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttca 1457 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1456 ggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1397 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1337 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1336 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaag 1277 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 atttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1217 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 cctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1157 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagctta 1097 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1037 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 977 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 976 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 917 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 916 cccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 872
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 587/593 (98%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 718
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 587/593 (98%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 718
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 627/646 (97%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttca 1359 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgccct 1299 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1179 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataaca 1119 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 879 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 878 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 819 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 818 cccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 636/658 (96%), Gaps = 3/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 ttatcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagct 68 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagcc 1371 Query: 69 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 128 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 129 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 189 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 248 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 249 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 308 || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 309 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcga 1071 Query: 369 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 428 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcc 1011 Query: 429 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 488 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 489 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 891 Query: 549 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 608 ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagta 831 Query: 609 tttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 830 tttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 625/646 (96%), Gaps = 2/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 tctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1342 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1341 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtcct 1282 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1222 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1221 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1162 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1161 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1102 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1042 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 982 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 922 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 921 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtga 862 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct: 861 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaat 802 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct: 801 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-agcccctaattct 757
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 586/595 (98%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 72 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 132 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 191 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 192 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 251 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 252 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 312 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 372 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 432 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 492 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 552 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 611 |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 612 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaatagg-aacccctaattct 754
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 583/592 (98%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 134 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 135 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 194 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 195 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 254 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 255 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 315 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 375 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 435 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 495 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 555 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 614 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 805 Query: 615 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 804 gtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaatagg-aacccctaattct 754
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 584/593 (98%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaatagg-aacccctaattct 754
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 624/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1343 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1342 ggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1283 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1282 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1223 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1222 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1163 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1162 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1103 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1043 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 983 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 923 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 922 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtga 863 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 803 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 802 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 759
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 626/645 (97%), Gaps = 4/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124754 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 124695 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124694 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 124635 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124634 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 124575 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 124574 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaag 124515 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 124514 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataaca 124456 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124455 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caata 124397 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124396 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 124337 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124336 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 124277 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 124276 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 124217 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124216 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 124157 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124156 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 124113 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 626/645 (97%), Gaps = 4/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30227 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 30168 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30167 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 30108 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30107 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 30048 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 30047 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaag 29988 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 29987 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataaca 29929 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 29928 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caata 29870 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29869 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 29810 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29809 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 29750 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 29749 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 29690 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 29689 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 29630 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29629 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 29586
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55468 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55409 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55408 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55349 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55348 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55289 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55288 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55229 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55228 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55169 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55168 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55109 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55108 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55049 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55048 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 54989 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 54988 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 54929 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 54928 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 54869 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54868 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 54825
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125809 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 125750 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 125749 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 125690 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125689 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 125630 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 125629 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 125570 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 125569 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 125510 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125509 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 125450 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125449 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 125390 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125389 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 125330 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 125329 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 125270 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 125269 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 125210 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 125209 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 125166 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30749 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 30690 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30689 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 30630 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30629 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 30570 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 30569 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 30510 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 30509 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 30450 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30449 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 30390 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30389 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 30330 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30329 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 30270 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 30269 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 30210 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 30209 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 30150 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30149 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 30106
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1239 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1179 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 938 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtga 879 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 819 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 818 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 tctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1346 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1345 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1286 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1285 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1226 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1225 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1166 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1165 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1106 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1046 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 986 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 926 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 925 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtga 866 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 806 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 805 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 762
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1344 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1343 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1284 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1283 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1224 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1223 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1164 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1104 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1044 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 984 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 924 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 923 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtga 864 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 804 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 760
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 tctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1358 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1357 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1298 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1297 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1238 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1237 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1178 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1177 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1118 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1058 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 998 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 938 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 937 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtga 878 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 818 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 774
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527152 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 33527211 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 33527212 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 33527271 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527272 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 33527331 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 33527332 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 33527391 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 33527392 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 33527451 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527452 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 33527511 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527512 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 33527571 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527572 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 33527631 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 33527632 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 33527691 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 33527692 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 33527751 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 33527752 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 33527795 Score = 135 bits (68), Expect = 2e-28 Identities = 81/84 (96%), Gaps = 1/84 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 582 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 641 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 642 attacaataggaaacccctaattc 665 ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 39115412 attacaatagg-aacccctaattc 39115390
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 583/593 (98%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 744
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72349 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 72408 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 72409 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 72468 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72469 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 72528 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 72529 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 72588 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 72589 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 72648 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72649 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 72708 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72709 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 72768 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72769 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 72828 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 72829 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 72888 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 72889 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 72948 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 72949 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 72992
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55447 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55388 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55387 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55328 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55327 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55268 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55267 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55208 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55207 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55148 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55147 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55088 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55087 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55028 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55027 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 54968 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 54967 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 54908 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 54907 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 54848 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54847 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 54804
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 575/583 (98%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 620/642 (96%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 accggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcagga 83 |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 accgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1356 Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1355 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1296 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1236 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1235 ccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatt 1176 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1175 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1116 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1056 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacct 996 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 actactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 936 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 935 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 876 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 816 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 815 cctgttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1238 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1179 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 879 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 878 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 819 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 818 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55520 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55461 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55460 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55401 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55400 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55341 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55340 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55281 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55280 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55221 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55220 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55161 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55160 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55101 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55100 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 55041 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 55040 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 54981 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54980 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaac 54921 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54920 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 54877
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55520 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55461 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55460 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55401 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55400 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55341 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55340 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55281 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55280 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55221 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55220 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55161 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55160 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55101 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55100 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 55041 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 55040 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 54981 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54980 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaac 54921 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54920 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 54877
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124836 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 124777 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124776 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 124717 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124716 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 124657 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 124656 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 124597 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 124596 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 124537 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124536 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 124477 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124476 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 124417 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124416 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 124357 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 124356 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 124297 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124296 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaac 124237 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124236 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 124193 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30255 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 30196 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 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>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124836 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 124777 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124776 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 124717 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124716 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 124657 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 124656 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 124597 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 124596 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 124537 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124536 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 124477 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124476 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 124417 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124416 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 124357 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 124356 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 124297 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124296 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaac 124237 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124236 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 124193 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30255 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 30196 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 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>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55512 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55453 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55452 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55393 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55392 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55333 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55332 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55273 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55272 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55213 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55212 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55153 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55152 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55093 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55092 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 55033 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 55032 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 54973 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54972 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaac 54913 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54912 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 54869
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1238 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1179 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 879 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 878 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaac 819 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 818 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1239 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1179 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 938 acacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtga 879 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 819 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 818 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53722 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 53663 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 53662 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 53603 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53602 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 53543 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 53542 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 53483 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 53482 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 53423 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53422 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 53363 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53362 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 53303 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53302 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 53243 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 53242 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 53183 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 53182 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 53123 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 53122 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 53079
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128655 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 128596 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 128595 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 128536 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128535 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 128476 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 128475 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 128416 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 128415 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 128356 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128355 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 128296 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128295 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 128236 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128235 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 128176 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 128175 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 128116 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 128115 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 128056 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 128055 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 128012
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347330 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 10347271 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 10347270 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 10347211 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347210 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 10347151 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 10347150 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 10347091 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 10347090 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 10347031 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347030 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 10346971 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346970 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 10346911 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346910 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 10346851 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 10346850 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 10346791 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 10346790 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 10346731 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10346730 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 10346687
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1414 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1413 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1354 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1294 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1293 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1234 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1233 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1174 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1114 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1054 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 994 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 993 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 934 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 933 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaac 874 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 873 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 830
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1157 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1156 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1097 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1037 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1036 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 977 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 976 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 917 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 857 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 797 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 737 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 736 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 677 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 676 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaac 617 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 616 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 573
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353369 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 10353310 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 10353309 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 10353250 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353249 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 10353190 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 10353189 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 10353130 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 10353129 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 10353070 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353069 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 10353010 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353009 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 10352950 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352949 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 10352890 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 10352889 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 10352830 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 10352829 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 10352770 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10352769 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 10352726
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1805 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1746 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1745 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1686 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1685 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1626 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1625 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1566 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1565 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1506 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1505 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1446 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1445 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1386 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 cctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1326 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1325 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 1266 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 1206 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 cccccggtcaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 1162
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1779 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1778 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1719 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1718 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1659 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1658 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1599 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1598 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1539 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1479 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1419 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1359 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 1299 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1298 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaac 1239 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1238 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 1195 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 101 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 631/656 (96%), Gaps = 3/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 1343 atcgatagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgc 1284 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1283 ggcaagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag 1224 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1223 atcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgc 1164 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1163 acccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1104 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 atccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1044 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 984 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 924 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 864 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 804 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 803 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 744 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 743 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 689
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 583/595 (97%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 72 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 132 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 191 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 192 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 251 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 252 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 312 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 371 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 372 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 432 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 492 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 552 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 611 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 808 Query: 612 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 754
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 585/599 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 115 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 116 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 175 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 176 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 235 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 236 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 295 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 296 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 355 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 356 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 416 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 475 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 476 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 536 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 824 Query: 596 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 654 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 765
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 581/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 883 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 824 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 823 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 772
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 608/628 (96%), Gaps = 2/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 98 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 99 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 158 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 159 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 218 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 219 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 278 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 279 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 338 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 339 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 399 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 459 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 518 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 519 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 579 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 638 |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtca 786 Query: 639 tgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct: 785 tgcattacaatagg-agcccctaattct 759
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 582/595 (97%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 72 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 132 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 191 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 192 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 251 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 252 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 312 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 371 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 372 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 432 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 491 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 492 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 552 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 611 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 809 Query: 612 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 808 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 755
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 629/655 (96%), Gaps = 3/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 atcgatagt-tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgc 70 ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgc 1369 Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 131 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 190 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgc 1249 Query: 191 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 250 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 acccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 251 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1129 Query: 311 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 370 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatc 1069 Query: 371 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 431 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 491 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 551 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 610 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 888 tgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 829 Query: 611 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 620/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1390 tctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttca 1331 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1330 ggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccct 1271 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1270 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgca 1211 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1210 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaag 1151 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| Sbjct: 1150 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataaca 1091 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1090 cctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaata 1031 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactta 971 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 911 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 910 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 851 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 850 atgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 791 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 790 cctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 747
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 580/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 738
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 580/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 755
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 580/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 738
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 620/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614560 tctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttca 5614501 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 5614500 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 5614441 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614440 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 5614381 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 5614380 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 5614321 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 5614320 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 5614261 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614260 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 5614201 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614200 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 5614141 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614140 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 5614081 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 5614080 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 5614021 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 5614020 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 5613961 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5613960 cccctggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 5613917 Score = 585 bits (295), Expect = e-164 Identities = 333/343 (97%), Gaps = 2/343 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 323 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 383 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 443 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 502 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 503 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 562 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 563 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 622 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13436805 Query: 623 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 13436804 cccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 13436763 Score = 299 bits (151), Expect = 6e-78 Identities = 172/179 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccct 660 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccct 13397918 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 126 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 268 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 297 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 348 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 382 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.58 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 266 ggtcagagctggcatatgccaa 287 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 621/645 (96%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203576 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 23203635 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 23203636 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 23203695 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203696 t-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 23203754 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 23203755 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 23203814 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 23203815 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 23203874 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203875 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 23203934 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203935 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaactta 23203994 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203995 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 23204054 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 23204055 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 23204114 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 23204115 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 23204174 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 23204175 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 23204218 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 131 atc 133 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 131 atc 133 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 621/645 (96%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154224 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 154283 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 154284 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 154343 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154344 t-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 154402 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 154403 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 154462 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 154463 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 154522 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154523 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 154582 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154583 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaactta 154642 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154643 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 154702 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 154703 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 154762 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 154763 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 154822 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 154823 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 154866
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 621/645 (96%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38338 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 38397 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 38398 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 38457 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38458 t-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 38516 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 38517 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 38576 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 38577 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 38636 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38637 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 38696 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38697 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaactta 38756 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38757 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 38816 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 38817 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 38876 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 38877 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 38936 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38937 cccccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 38980
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 620/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614549 tctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttca 5614490 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 5614489 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 5614430 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614429 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 5614370 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 5614369 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 5614310 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 5614309 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 5614250 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614249 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 5614190 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614189 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 5614130 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614129 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 5614070 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 5614069 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 5614010 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 5614009 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 5613950 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5613949 cccctggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 5613906 Score = 585 bits (295), Expect = e-164 Identities = 333/343 (97%), Gaps = 2/343 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 323 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 383 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 443 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 502 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 503 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 562 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 563 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 622 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13391079 Query: 623 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 13391078 cccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 13391037 Score = 299 bits (151), Expect = 6e-78 Identities = 172/179 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 482 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 542 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 601 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 602 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccct 660 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccct 13352192 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 71 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 126 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 268 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 297 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 348 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 382 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.58 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 266 ggtcagagctggcatatgccaa 287 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 620/645 (96%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38325 tctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttca 38384 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 38385 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 38444 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38445 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 38504 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 38505 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 38564 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 38565 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 38624 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38625 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 38684 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38685 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 38744 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38745 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 38804 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 38805 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 38864 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 38865 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 38924 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38925 cccctggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 38968
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 588/604 (97%), Gaps = 1/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 122 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 123 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 182 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 183 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 242 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 243 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 302 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 303 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 362 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 363 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 423 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 483 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 879 Query: 543 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 878 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 819 Query: 603 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaa 662 |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 818 ctagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaa 760 Query: 663 ttct 666 |||| Sbjct: 759 ttct 756
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 576/588 (97%), Gaps = 1/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 78 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 138 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 198 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 257 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 258 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 318 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 378 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 438 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 497 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 498 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 557 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 558 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 617 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 618 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 579/592 (97%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcgg-aacccctaattc 745
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 572/583 (98%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 572/583 (98%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcgtgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 593/611 (97%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 115 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 116 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 175 |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 176 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 235 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 236 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 295 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 296 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 355 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 356 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 416 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 475 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 476 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 536 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 824 Query: 596 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaa 655 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 823 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aa 765 Query: 656 cccctaattct 666 ||||||||||| Sbjct: 764 cccctaattct 754
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 606/627 (96%), Gaps = 2/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 98 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 99 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 158 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 159 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 218 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 219 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 278 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 279 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 338 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 339 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 399 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 459 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 518 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 519 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 579 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 638 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 786 Query: 639 tgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 785 tgcattacaatagg-aacccctaattc 760
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 574/587 (97%), Gaps = 1/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 80 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 139 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 140 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 199 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 200 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 259 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 260 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 320 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 379 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 380 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 440 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 499 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 500 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 560 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 619 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 808 Query: 620 tcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 558/565 (98%), Gaps = 1/565 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 102 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 161 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 162 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 221 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 222 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 281 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 282 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 342 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 402 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 462 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 522 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 582 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 641 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 642 attacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 759 attacaatagg-aacccctaattct 736
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 558/565 (98%), Gaps = 1/565 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 102 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 161 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 162 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 221 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 222 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 281 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 282 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 342 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 402 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 462 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 522 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 582 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 641 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 642 attacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 759 attacaatagg-aacccctaattct 736
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 572/584 (97%), Gaps = 1/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 142 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 202 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 262 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 322 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 382 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 442 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 501 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 502 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 561 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 562 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 621 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 788 Query: 622 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 787 ccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 745
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 571/583 (97%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 806 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 ccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 764
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 580/595 (97%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 72 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 132 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 191 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 192 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 251 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 252 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 311 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 312 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 372 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 432 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 491 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 492 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 552 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 611 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 872 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 813 Query: 612 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 759
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 579/594 (97%), Gaps = 1/594 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 72 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 132 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 191 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 192 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 251 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 252 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 312 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 372 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 431 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 432 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 491 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 492 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 552 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 611 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 874 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 815 Query: 612 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 814 gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcgg-aacccctaattc 762
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 578/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 738
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 618/645 (95%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 tctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1329 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1328 ggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1269 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1209 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1208 ttcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaag 1149 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1148 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1089 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1088 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaata 1029 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 849 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 789 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 745
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 579/595 (97%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 72 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 132 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 191 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 192 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 251 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 252 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 311 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 312 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 371 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 372 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 432 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 491 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 492 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 552 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 611 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 612 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 754
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 604/627 (96%), Gaps = 2/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 98 |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 99 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 158 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 159 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 218 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 219 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 278 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 279 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 338 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 339 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 398 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 399 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 459 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 518 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 519 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 848 Query: 579 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 638 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 847 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 788 Query: 639 tgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 787 tgcattacaatagg-aacccctaattc 762
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 588/607 (96%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 119 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 178 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261 Query: 179 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 238 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 239 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 298 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 299 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 358 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 359 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1021 Query: 419 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccaga 961 Query: 479 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 538 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 catacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 901 Query: 539 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 598 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 900 aactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841 Query: 599 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaaccc 658 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 840 caaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aaccc 782 Query: 659 ctaattc 665 ||||||| Sbjct: 781 ctaattc 775
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 615/642 (95%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 accggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcagga 83 ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1330 accggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1271 Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1270 ctccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1211 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcattt 1151 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatt 1091 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacct 1031 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaa 971 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 911 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 actactgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaataca 851 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 791 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 790 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcct 731 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 730 ccagttaaatagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 690
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 581/598 (97%), Gaps = 1/598 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 128 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 129 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 188 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 189 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 248 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 249 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 308 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 309 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 369 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 428 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 429 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 488 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 489 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 549 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 608 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta 831 Query: 609 tttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 830 tttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 774
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 572/587 (97%), Gaps = 1/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 80 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 139 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 140 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 199 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 200 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 259 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 260 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 319 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 320 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 379 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 380 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 440 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 499 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 500 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 560 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 619 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808 Query: 620 tcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 577/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 806 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 754
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 617/645 (95%), Gaps = 2/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttca 80 |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 81 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 140 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 141 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 200 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgca 1239 Query: 201 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 260 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1238 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaag 1179 Query: 261 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 320 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 321 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 380 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaata 1059 Query: 381 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 taatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 441 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgctaat 939 Query: 501 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 879 Query: 561 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 620 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 878 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcggtgaat 819 Query: 621 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 818 cctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 583/601 (97%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 576/592 (97%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 745
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 569/583 (97%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 569/583 (97%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 569/583 (97%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 574/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 136 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 137 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 196 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 197 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 256 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 257 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 316 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 317 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 377 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 436 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 437 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 496 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 497 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 557 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 616 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 617 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 783 gaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 735
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 574/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 136 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 137 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 196 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 197 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 256 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 257 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 316 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 317 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 377 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 436 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 437 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 496 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 497 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 557 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 616 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 617 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 783 gaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 735
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 573/589 (97%), Gaps = 1/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 78 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 138 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 197 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 198 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 257 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 258 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 318 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 377 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 378 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 438 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 498 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 557 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 558 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 617 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 870 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 811 Query: 618 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 810 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 763
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 582/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 575/592 (97%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 745
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 609/636 (95%), Gaps = 2/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 89 |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 90 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 149 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 150 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 209 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 210 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 270 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 329 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 330 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 390 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 449 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 450 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 509 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 510 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 569 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870 Query: 570 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 629 |||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 869 agtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagtt 810 Query: 630 aagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 809 aagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 581/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 715 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 714 agtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 656 Query: 665 c 665 | Sbjct: 655 c 655
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 575/593 (96%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 869 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 810 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 809 ggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 758
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 581/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 581/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 574/592 (96%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 866 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 756
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 608/636 (95%), Gaps = 2/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 89 |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 90 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 149 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 150 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 209 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 210 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 270 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 329 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 330 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 390 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 449 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 450 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 509 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 510 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 569 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870 Query: 570 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 629 |||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 869 agtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagtt 810 Query: 630 aagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 809 aagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 567/583 (97%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 814 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 813 ccagttatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 772
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 575/595 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305 Query: 119 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 178 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1304 ttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1245 Query: 179 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 238 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1185 Query: 239 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 298 |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1184 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatacc 1125 Query: 299 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 358 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1065 Query: 359 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1005 Query: 419 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccaga 945 Query: 479 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 538 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 catacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 885 Query: 539 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 598 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 884 aactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 825 Query: 599 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagga 653 |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 caaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagga 770
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 573/591 (96%), Gaps = 1/591 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 134 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 135 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 194 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 195 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 254 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 255 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 315 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 374 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 375 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 435 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 494 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 495 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 554 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 555 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 614 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 615 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 566/582 (97%), Gaps = 1/582 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 786 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 785 ccggttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 745
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 580/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 553/565 (97%), Gaps = 1/565 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 102 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 161 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 162 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 221 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 222 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 281 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 282 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 342 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 402 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 462 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 522 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 582 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 641 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 642 attacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 756 attacaatagg-aacccctaattct 733
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 553/565 (97%), Gaps = 1/565 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 102 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 161 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 162 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 221 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 222 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 281 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 282 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 342 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 402 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 462 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 522 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 582 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 641 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 642 attacaataggaaacccctaattct 666 ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 756 attacaatagg-aacccctaattct 733
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 566/583 (97%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 566/583 (97%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 566/583 (97%), Gaps = 1/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 762
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 612/643 (95%), Gaps = 2/643 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 accggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcagga 83 |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1852 accggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1793 Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1792 ctccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1733 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1732 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcattt 1673 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1672 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatt 1613 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1612 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1553 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1552 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaa 1493 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1492 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacct 1433 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1432 actactgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaataca 1373 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1372 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 1313 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 tgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcggtgaatcct 1253 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1252 ccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 1211
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 600/627 (95%), Gaps = 2/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 98 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 99 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 158 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 159 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 218 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 219 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 278 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 279 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 338 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 339 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 398 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 399 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 458 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 459 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 518 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 519 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120001 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 119942 Query: 579 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 638 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 119941 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 119882 Query: 639 tgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 119881 tgcattacaatagg-aacccctaattc 119856
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 600/627 (95%), Gaps = 2/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 98 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 99 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 158 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 159 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 218 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 219 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 278 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 279 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 338 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 339 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 398 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 399 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 458 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 459 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 518 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 519 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58374 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 58315 Query: 579 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 638 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 58314 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 58255 Query: 639 tgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 58254 tgcattacaatagg-aacccctaattc 58229
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 574/594 (96%), Gaps = 1/594 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 72 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 132 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 191 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 192 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 252 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 312 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 371 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 372 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 432 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 491 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 492 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 551 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 552 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 611 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 612 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 797 gcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 745
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 571/590 (96%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 76 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 135 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 136 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 195 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 196 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 255 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 256 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 315 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 316 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 375 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 376 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 436 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 495 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 887 Query: 496 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 555 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 886 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 827 Query: 556 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 615 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 767 Query: 616 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 766 tgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 718
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 570/590 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 654 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaa 755
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 569/589 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagga 653 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataatagga 756
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 557/572 (97%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 95 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 154 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 155 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 214 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 215 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 274 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 275 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 335 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 394 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 395 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 455 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 514 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 515 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 575 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 634 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 635 gtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 717
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 557/572 (97%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 95 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 154 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 155 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 214 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 215 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 274 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 275 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 334 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 335 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 395 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 455 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 515 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 575 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 634 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 848 gccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 789 Query: 635 gtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 788 gtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 758
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 557/572 (97%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 95 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 154 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 155 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 214 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 215 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 274 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 275 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 335 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 394 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 395 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 455 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 514 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 515 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 575 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 634 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 635 gtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 717
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 569/588 (96%), Gaps = 1/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 78 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 138 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 198 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 257 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 258 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 317 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 318 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 377 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 378 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 438 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 497 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 924 Query: 498 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 557 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 864 Query: 558 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 617 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 804 Query: 618 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 757
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 562/580 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagga 653 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagga 756
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 572/592 (96%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 745
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 599/627 (95%), Gaps = 2/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 98 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 99 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 158 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 159 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 218 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 219 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 278 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 279 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 338 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 339 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 398 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 399 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 458 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 459 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 518 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 519 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 579 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 638 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 801 Query: 639 tgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 800 tgcattacaatagg-aacccctaattc 775
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 599/627 (95%), Gaps = 2/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 98 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 99 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 158 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 159 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 218 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 219 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 278 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 279 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 338 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 339 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 398 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 399 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 458 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 459 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 518 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 519 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57793 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57734 Query: 579 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 638 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 57733 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 57674 Query: 639 tgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 57673 tgcattacaatagg-aacccctaattc 57648
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 611/643 (95%), Gaps = 2/643 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 accggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcagga 83 |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1832 accggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1773 Query: 84 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 143 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1772 ctccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1713 Query: 144 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 203 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1712 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggtgcattt 1653 Query: 204 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1652 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatt 1593 Query: 264 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1592 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1533 Query: 324 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 383 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1532 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaa 1473 Query: 384 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacct 1413 Query: 444 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 503 ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 actactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagctaataca 1353 Query: 504 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 563 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 cggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 1293 Query: 564 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 623 |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagacaaactagtatttgcggtgaatcct 1233 Query: 624 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattct 666 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1232 ccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattct 1191
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 599/627 (95%), Gaps = 2/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 98 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 99 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 158 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 159 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 218 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 219 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 278 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 279 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 338 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 339 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 398 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 399 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 458 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 459 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 518 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 519 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57803 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57744 Query: 579 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 638 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 57743 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 57684 Query: 639 tgcattacaataggaaacccctaattc 665 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 57683 tgcattacaatagg-aacccctaattc 57658
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 546/558 (97%), Gaps = 1/558 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 109 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 168 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 169 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 228 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 229 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 288 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 289 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 348 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 349 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 408 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 409 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 468 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 918 Query: 469 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 858 Query: 529 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 798 Query: 589 aatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaa 648 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 aataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaa 738 Query: 649 taggaaacccctaattct 666 |||| ||||||||||||| Sbjct: 737 tagg-aacccctaattct 721
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 552/568 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 87 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 146 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 147 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 206 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 207 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 267 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 327 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 387 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 447 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 506 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 507 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 567 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccg 626 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccca 793 Query: 627 gttaagtagtcatgcattacaataggaa 654 |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 792 gttatgtagtcatgcattacaataggaa 765
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 579/602 (96%), Gaps = 1/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagt 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 746 Query: 665 ct 666 || Sbjct: 745 ct 744
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/602 (96%), Gaps = 3/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 123 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 124 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 183 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 184 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 243 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 244 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 303 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 304 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 363 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 364 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 424 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 483 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 484 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 544 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 603 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 604 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaat 663 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactatagg-aacccctaat 747 Query: 664 tc 665 || Sbjct: 746 tc 745
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 578/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattgg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 578/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 578/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattgg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 578/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 568/589 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaatagga 653 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagga 756
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 578/601 (96%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 125 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 184 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 185 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 244 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 245 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 304 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 305 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 364 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 365 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 424 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 425 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 485 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 544 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 545 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 604 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaact 805 Query: 605 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaatt 664 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaatt 746 Query: 665 c 665 | Sbjct: 745 c 745
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 568/588 (96%), Gaps = 1/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 78 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 137 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 138 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 197 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 198 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 257 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 258 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 317 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 318 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 378 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 438 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 497 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 498 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 862 Query: 558 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 617 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 802 Query: 618 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 801 aatcctccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 755
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 571/592 (96%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 134 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 193 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 194 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 253 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 254 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 313 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 314 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 373 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 374 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 434 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 493 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 494 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 553 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 554 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 613 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 614 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccctaattc 665 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 agtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccctaattc 745
>dbj|AB088833.1| Phyllostachys bambusoides chloroplast rbcL gene for RuBisCO large subunit, partial cds Length = 1356 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 582/605 (96%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 121 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccntttgcaagctgctcggataatttnattaccttc 1294 Query: 122 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1293 acgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgatt 1234 Query: 182 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccacc-aaattgta 240 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct: 1233 agctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc-tccacccaaattgta 1175 Query: 241 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 300 |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1174 atacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccc 1115 Query: 301 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 360 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1055 Query: 361 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 995 Query: 421 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 994 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagaca 935 Query: 481 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 540 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 tacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 875 Query: 541 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 600 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 874 ctgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 815 Query: 601 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaacccct 660 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 814 aagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatagg-aacccct 756 Query: 661 aattc 665 ||||| Sbjct: 755 aattc 751 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,886,994 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4886994 Number of successful extensions: 128240 Number of sequences better than 10.0: 15314 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15267 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 59 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 95455 Number of HSP's gapped (non-prelim): 22754 length of query: 666 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 643 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 11023140423672 effective search space used: 11023140423672 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)