| Clone Name | rbags22n01 |
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| Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 679/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 679/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 679/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 678/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 677/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctakttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 677/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 675/680 (99%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1459 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1399 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 1339 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1279 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1219 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1159 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 1100 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 gta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 922 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 861 tcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 675/680 (99%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1456 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1397 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1337 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 1277 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1217 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1157 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1097 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 1038 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 gta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 918 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 860 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 799 tcatttcttcacatgtaccc 780
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 677/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 677/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 677/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 677/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 677/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 677/683 (99%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1269 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 675/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 675/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 675/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 675/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 675/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 675/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 674/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 673/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanntggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 673/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 674/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 674/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 674/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 673/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 673/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 672/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 673/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 673/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 673/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 672/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 672/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 672/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaanacngctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 672/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1411 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1410 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1351 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1350 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1291 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1231 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1171 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1111 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1052 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 993 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 933 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 873 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 872 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 814 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 taatcatttcttcacatgtaccc 791
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 671/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 672/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 672/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 672/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56320 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 56261 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 56260 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 56201 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 56200 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 56141 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56140 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 56081 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56080 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 56021 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56020 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55961 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55960 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 55902 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55901 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 55843 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55842 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 55783 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55782 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 55723 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 55722 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 55664 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55663 taatcatttcttcacatgtaccc 55641
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 672/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1506 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1447 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1446 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1387 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1386 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1327 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1267 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1207 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1147 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1088 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1029 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 969 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 909 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 908 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 850 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 taatcatttcttcacatgtaccc 827
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 671/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagataatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtcaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 669/680 (98%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1459 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1458 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgag 1399 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1398 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1339 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtca 1279 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1219 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1159 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 1100 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 gta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 922 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaactctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 861 tcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 671/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 671/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1043 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 983 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 923 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 922 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 864 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 taatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 671/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1043 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 983 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 923 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 922 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 864 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 taatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 671/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1043 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 983 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 923 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 922 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 864 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 taatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 671/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1043 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 983 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 923 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 922 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 864 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 taatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 671/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 668/680 (98%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1349 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1348 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1289 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1288 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1229 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1169 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1109 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1049 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 812 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 751 tcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1043 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 983 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 923 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 922 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctnt 864 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 taatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 668/680 (98%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1462 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1461 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1402 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1401 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1342 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1282 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1222 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1162 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 1103 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1044 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 984 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 983 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 925 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 924 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 865 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 864 tcatttcttcacatgtaccc 845
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taagcatttcttcacatgtaccc 732
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1189 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1188 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1129 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1128 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1069 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1009 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 949 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 889 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 830 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 771 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 711 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 710 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatccccc 651 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 650 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 592 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 591 taatcatttcttcacatgtaccc 569
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1189 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1188 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1129 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1128 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1069 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1009 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 949 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 889 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 830 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 771 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 711 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 710 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatccccc 651 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 650 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 592 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 591 taatcatttcttcacatgtaccc 569
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1378 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1319 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1318 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1259 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1258 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1199 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1198 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1139 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1079 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1019 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaacttacctact 960 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 901 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 841 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 781 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 780 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 722 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 721 taagcatttcttcacatgtaccc 699
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taagcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 669/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 670/683 (98%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taagcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 667/679 (98%), Gaps = 4/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 gaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 63 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 gaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 1317 Query: 64 gcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagc 123 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1316 gcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagc 1257 Query: 124 ttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 183 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1256 ttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagg 1197 Query: 184 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 1137 Query: 244 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 1077 Query: 304 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 1017 Query: 364 caataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactg 423 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1016 caataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactg 958 Query: 424 tacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 483 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 ta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 899 Query: 484 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 839 Query: 544 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggt 603 |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 838 agtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccccc-ggt 780 Query: 604 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 779 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 720 Query: 664 catttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||| Sbjct: 719 catttcttcacatgtaccc 701
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 667/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 gctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacnnngca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1044 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 984 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 924 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 865 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 taatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 667/680 (98%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1462 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1461 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1402 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1401 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1342 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1282 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1222 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1162 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 gcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 1103 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1044 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 984 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 983 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 925 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 924 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 865 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 864 tcatttcttcacatgtaccc 845
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 667/680 (98%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1318 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1317 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1258 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1257 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1198 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1138 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1137 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanctggcatgg 1078 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1018 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 959 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 gta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 900 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 840 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 839 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 781 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 780 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttca 721 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 720 tcatttcttcacatgtaccc 701
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 668/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagrtttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttygcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1043 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 983 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 923 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 922 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 864 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 taatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 667/680 (98%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1325 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1324 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1265 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1264 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1205 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1145 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1085 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1025 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 966 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 gta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 907 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 847 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 846 aagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 788 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 787 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 728 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 727 tcatttcttcacatgtaccc 708
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 668/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1043 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 983 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 923 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 922 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctnt 864 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 taatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 667/680 (98%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1325 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1324 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1265 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1264 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1205 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1145 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1085 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1025 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 966 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 gta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 907 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 847 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 846 aagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 788 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 787 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 728 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 727 tcatttcttcacatgtaccc 708
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 668/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 861 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctnt 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 669/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taagcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 668/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taagcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 668/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcag 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 669/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 666/680 (97%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1462 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1461 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1402 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1401 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1342 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1282 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1222 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1162 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 1103 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1044 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 atgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 984 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 983 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 925 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 924 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 865 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 864 tcatttcttcacatgtaccc 845
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 668/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 agacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcacatgtaccc 732
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 668/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggccccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taagcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 665/680 (97%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1462 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1461 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1402 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1401 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgcatttccccaag 1342 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1282 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1222 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1162 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 1103 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1044 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 984 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 983 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 925 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 924 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 865 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 864 tcatttcttcacatgtaccc 845
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 667/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1189 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1188 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1129 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct: 1128 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgcatttcccc 1069 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1009 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 949 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 889 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 830 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 771 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 711 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 710 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatccccc 651 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 650 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 592 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 591 taatcatttcttcacatgtaccc 569
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 662/680 (97%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1459 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1458 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacgag 1399 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1398 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1339 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtca 1279 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1219 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1159 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1158 gcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctannnct 1100 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1099 gta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaatacacggaa 1041 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-gg 922 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||| Sbjct: 861 tcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 667/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 982 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 922 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 862 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 861 -agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctctct 803 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 taatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 623/627 (99%), Gaps = 3/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 720
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 665/683 (97%), Gaps = 4/683 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taagcatttcttcacatgtaccc 732
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 657/672 (97%), Gaps = 4/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 -agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttctt 671 |||||||||||| Sbjct: 754 taatcatttctt 743
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/627 (99%), Gaps = 3/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 912 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 852 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 851 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 792 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 cccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 733 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 732 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 706
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 664/682 (97%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1403 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1402 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1343 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1283 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1282 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1223 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1163 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1103 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 cgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1044 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 985 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggtgaatgtg 925 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 865 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 -agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 806 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 taatcatttcttcacatgtacc 784
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 629/637 (98%), Gaps = 3/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 951 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 832 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 772 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 771 gcggtgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 713 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 712 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 676
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 629/637 (98%), Gaps = 3/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 951 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 832 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 772 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 771 gcggtgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 713 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 712 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 676
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 660/678 (97%), Gaps = 4/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 6 aactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 64 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 65 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 124 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 125 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 184 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 185 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 245 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 305 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 364 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 365 aataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 424 ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtga-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 978 Query: 425 acccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 484 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 a-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 919 Query: 485 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 859 Query: 545 gtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggtt 604 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 858 gtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agtt 800 Query: 605 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 664 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| Sbjct: 799 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctcttcatc 740 Query: 665 atttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||| Sbjct: 739 atttcttcacatgtaccc 722
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 662/682 (97%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1371 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1312 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1311 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1252 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1251 gagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1192 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1191 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcgg 1132 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1072 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 aggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1012 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 953 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 894 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 893 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 834 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 833 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 774 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 773 -agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 715 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 714 taatcatttcttcacatgtacc 693
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 662/682 (97%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcacatgtacc 733
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 662/682 (97%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcag 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcacatgtacc 733
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 662/682 (97%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1509 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1450 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1449 atttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1390 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1389 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1330 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1329 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcag 1270 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1210 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 tggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1150 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1149 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacctact 1091 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1032 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 972 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 912 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 -agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 853 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 taatcatttcttcacatgtacc 831
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 661/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1332 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1331 atttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1272 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1271 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgcatttcccc 1212 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1211 aaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1152 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1092 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1032 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 793 -agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 735 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 taatcatttcttcacatgtacc 713
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 627/639 (98%), Gaps = 3/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 404 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 463 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 464 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 524 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 583 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtat 810 Query: 584 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 643 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 ttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctcta 751 Query: 644 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 750 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 712
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 106 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 107 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 166 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 167 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 226 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 227 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 287 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 346 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 347 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttc 986 Query: 407 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 466 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 467 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 527 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 586 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 587 cggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 646 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 806 cggtgaatccccc-agttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagca 748 Query: 647 aatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 aatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 712
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 660/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 gggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 -agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcacatgtacc 733
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 625/637 (98%), Gaps = 3/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 987 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 807 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 712
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/627 (98%), Gaps = 3/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 720
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 658/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1394 gctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1335 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| Sbjct: 1334 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttac 1275 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1274 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1215 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1214 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1155 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1095 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1094 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1035 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 976 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 917 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 916 aaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtg 857 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 856 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatccccc 797 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 -agttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaatacagctctct 738 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 737 taatcatttcttcgcatgtacc 716
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 624/638 (97%), Gaps = 3/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 404 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 463 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 464 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 524 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 583 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 810 Query: 584 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 643 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 ttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 751 Query: 644 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 750 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 658/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttctg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 -agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcacatgtacc 733
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 622/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgctcccctt 1005 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 946 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 886 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 885 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 826 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 767 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 766 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 731
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 635/654 (97%), Gaps = 3/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 87 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 88 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 147 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 148 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 207 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 208 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 267 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 268 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 327 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 328 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 388 cattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 447 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1003 ca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 448 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 508 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatag 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataa 826 Query: 568 tgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaatagg 627 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 tgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaatagg 767 Query: 628 aacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 766 aactcctaattctctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacc 713
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 659/682 (96%), Gaps = 6/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124747 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 124688 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124687 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 124628 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124627 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 124568 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124567 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcgg 124508 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124507 tcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggca 124449 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124448 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataaaatcat 124390 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124389 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 124331 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124330 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 124272 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124271 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 124212 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124211 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 124152 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124151 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctct 124093 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 124092 taatcatttcttcgcatgtacc 124071 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 659/682 (96%), Gaps = 6/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30220 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 30161 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30160 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 30101 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30100 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 30041 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 30040 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcgg 29981 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 29980 tcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggca 29922 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29921 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataaaatcat 29863 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29862 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 29804 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29803 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 29745 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29744 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 29685 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 29684 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 29625 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 29624 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctct 29566 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 29565 taatcatttcttcgcatgtacc 29544
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 656/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 ctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctacta 420 ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataagtcaacaaaacctaaagtca-tgtcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 421 ctgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 480 ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 933 Query: 481 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 873 Query: 541 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccg 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 agaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc- 814 Query: 601 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctctt 754 Query: 661 aatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||| |||||||| Sbjct: 753 aatcatttcttcgcatgtacc 733
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 621/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 792 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 733 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 732 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 697
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 621/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 792 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 733 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 732 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 697
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 621/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 739 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttcatcatgtcttcgcatgtacc 703
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 614/627 (97%), Gaps = 3/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 720
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 629/647 (97%), Gaps = 3/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 94 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 95 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 154 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 155 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 214 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 215 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 274 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 275 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 334 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 335 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttc 394 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttc 1000 Query: 395 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 454 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 941 Query: 455 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 881 Query: 515 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 880 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 821 Query: 575 aagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 634 || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 aactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccct 762 Query: 635 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 761 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 715
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 622/638 (97%), Gaps = 3/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 990 Query: 404 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 463 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 931 Query: 464 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 871 Query: 524 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 583 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 870 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 811 Query: 584 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 643 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 ttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 752 Query: 644 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 751 gcaaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacc 714
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 600/609 (98%), Gaps = 3/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 374 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 433 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 942 Query: 434 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 882 Query: 494 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 881 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 822 Query: 554 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtca 613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 821 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-ggttaagtagtca 763 Query: 614 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 762 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 703 Query: 674 catgtaccc 682 ||||||||| Sbjct: 702 catgtaccc 694
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 600/609 (98%), Gaps = 3/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 374 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 433 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 942 Query: 434 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 882 Query: 494 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 881 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 822 Query: 554 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtca 613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 821 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-ggttaagtagtca 763 Query: 614 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 762 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 703 Query: 674 catgtaccc 682 ||||||||| Sbjct: 702 catgtaccc 694
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 615/630 (97%), Gaps = 3/630 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 111 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 112 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 171 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 172 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 231 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 232 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 292 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 351 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 352 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaact 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaact 989 Query: 412 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 471 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 472 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 870 Query: 532 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 591 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 810 Query: 592 aatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 651 |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 aatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 751 Query: 652 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 750 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 721
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 620/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 988 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 809 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 749 aaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacc 714
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 613/627 (97%), Gaps = 3/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttcttcacatgtaccc 720
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55461 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55402 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55401 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55342 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55341 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55282 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55281 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55222 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55221 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55162 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55161 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55102 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55101 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 55043 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55042 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 54984 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54983 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 54924 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 54923 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 54864 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 54863 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 54805 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54804 taatcatttcttcgcatgtacc 54783
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 612/626 (97%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 tactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 928 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 868 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 808 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 749 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 723
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 621/638 (97%), Gaps = 3/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 994 Query: 404 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 463 ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 935 Query: 464 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 875 Query: 524 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 583 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 874 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 815 Query: 584 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 643 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 ttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 756 Query: 644 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 755 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 718
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125802 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 125743 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125742 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 125683 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 125682 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 125623 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 125622 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 125563 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 125562 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 125503 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125502 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 125443 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125442 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 125384 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125383 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 125325 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 125324 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 125265 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125264 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 125205 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 125204 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 125146 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 125145 taatcatttcttcgcatgtacc 125124 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30742 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 30683 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30682 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 30623 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30622 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 30563 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 30562 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 30503 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 30502 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 30443 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30442 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 30383 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30382 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 30324 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30323 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 30265 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30264 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 30205 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30204 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 30145 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 30144 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 30086 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 30085 taatcatttcttcgcatgtacc 30064
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 633/654 (96%), Gaps = 3/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 87 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 88 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 147 |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 148 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 207 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 208 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 267 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 268 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 327 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 328 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 388 cattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 447 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1003 ca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 448 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 508 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatag 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataa 826 Query: 568 tgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaatagg 627 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 tgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaatagg 767 Query: 628 aacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 766 aacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527159 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 33527218 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527219 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 33527278 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 33527279 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 33527338 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 33527339 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 33527398 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 33527399 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 33527458 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527459 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 33527518 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527519 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 33527577 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527578 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 33527636 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527637 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 33527696 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527697 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 33527756 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 33527757 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 33527815 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 33527816 taatcatttcttcgcatgtacc 33527837 Score = 202 bits (102), Expect = 1e-48 Identities = 121/126 (96%), Gaps = 1/126 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 556 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatg 615 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatg 39115414 Query: 616 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 675 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 39115413 cattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgca 39115354 Query: 676 tgtacc 681 |||||| Sbjct: 39115353 tgtacc 39115348
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72356 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 72415 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 72416 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 72475 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 72476 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 72535 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 72536 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 72595 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 72596 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 72655 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72656 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 72715 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72716 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 72774 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72775 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 72833 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 72834 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 72893 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72894 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 72953 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 72954 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 73012 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 73013 taatcatttcttcgcatgtacc 73034
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55440 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55381 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55380 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55321 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55320 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55261 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55260 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55201 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55200 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55141 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55140 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55081 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55080 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 55022 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55021 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 54963 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54962 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 54903 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 54902 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 54843 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 54842 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 54784 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54783 taatcatttcttcgcatgtacc 54762
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 619/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 792 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 733 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 732 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 697
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 653/680 (96%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1326 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagttcagggctcc 1267 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1266 atttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1207 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1206 gagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcatttcccc 1147 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1146 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1087 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 1086 taagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacaccaggca 1027 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 967 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 908 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 849 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 789 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 729 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 728 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctct 670 Query: 660 taatcatttcttcacatgta 679 ||||||||||||| |||||| Sbjct: 669 taatcatttcttcgcatgta 650
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 616/632 (97%), Gaps = 3/632 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 410 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 469 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 470 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 529 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 530 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 589 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 590 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 649 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 650 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 733
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 813 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcgcatgtacc 733
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55513 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55454 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55453 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55394 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55393 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55334 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55333 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55274 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55273 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55214 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55213 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55154 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55153 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 55095 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 55036 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55035 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 54976 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54975 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 54917 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 54916 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 54857 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54856 taatcatttcttcgcatgtacc 54835
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55513 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55454 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55453 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55394 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55393 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55334 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55333 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55274 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55273 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55214 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55213 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55154 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55153 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 55095 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 55036 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55035 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 54976 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54975 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 54917 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 54916 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 54857 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54856 taatcatttcttcgcatgtacc 54835
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 620/638 (97%), Gaps = 3/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 404 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 463 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 464 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 524 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 583 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 810 Query: 584 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 643 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 ttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 751 Query: 644 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 750 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124829 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 124770 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124769 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 124710 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124709 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 124650 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 124649 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 124590 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124589 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 124530 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124529 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 124470 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124469 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 124411 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124410 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 124352 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124351 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 124292 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124291 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 124233 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 124232 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 124173 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 124172 taatcatttcttcgcatgtacc 124151 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30248 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 30189 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30188 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 30129 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30128 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 30069 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 30068 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 30009 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 30008 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 29949 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29948 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 29889 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29888 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 29830 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29829 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 29771 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29770 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 29711 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 29710 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 29652 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 29651 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 29592 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 29591 taatcatttcttcgcatgtacc 29570
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124829 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 124770 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124769 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 124710 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124709 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 124650 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 124649 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 124590 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124589 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 124530 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124529 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 124470 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124469 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 124411 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124410 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 124352 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124351 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 124292 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124291 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 124233 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 124232 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 124173 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 124172 taatcatttcttcgcatgtacc 124151 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30248 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 30189 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30188 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 30129 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30128 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 30069 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 30068 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 30009 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 30008 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 29949 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29948 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 29889 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29888 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 29830 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29829 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 29771 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29770 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 29711 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 29710 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 29652 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 29651 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 29592 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 29591 taatcatttcttcgcatgtacc 29570
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55505 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55446 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55445 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55386 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55385 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55326 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55325 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55266 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55265 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55206 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55205 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55146 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55145 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 55087 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55086 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 55028 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55027 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 54968 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54967 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 54909 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 54908 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 54849 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54848 taatcatttcttcgcatgtacc 54827
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 815 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 814 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcgcatgtacc 733
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 gctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1339 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1338 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1279 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1278 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1219 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1218 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1159 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1099 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1039 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 980 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 actgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 921 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 920 aaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtg 861 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 860 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 801 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 800 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctct 742 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 741 tcatcatttcttcgcatgtacc 720
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 gctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1336 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1335 atttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1276 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1275 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1216 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1215 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1156 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1096 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1036 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 977 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 918 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 917 aaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtg 858 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 798 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 797 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctct 739 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 | ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 738 tcatcatatcttcgcatgtacc 717
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 gctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1337 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1336 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1277 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1276 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1217 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1216 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1157 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1097 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1037 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 978 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 actgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 919 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtg 859 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 799 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 798 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctct 740 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 739 tcatcatttcttcgcatgtacc 718
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 gctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1351 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1291 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1290 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1231 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1230 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1171 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1111 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1051 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 992 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 actgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 933 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 932 aaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtg 873 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 813 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 812 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctct 754 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 753 tcatcatttcttcgcatgtacc 732
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 53715 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 53656 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53655 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 53596 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 53595 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 53536 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 53535 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 53476 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 53475 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 53416 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53415 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 53356 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53355 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 53297 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53296 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 53238 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 53237 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 53178 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53177 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 53118 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 53117 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 53059 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 53058 taatcatttcttcgcatgtacc 53037
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 128648 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 128589 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128588 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 128529 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 128528 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 128469 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 128468 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 128409 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 128408 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 128349 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128348 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 128289 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128288 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 128230 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128229 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 128171 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 128170 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 128111 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128110 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 128051 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 128050 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 127992 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 127991 taatcatttcttcgcatgtacc 127970
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 10347323 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 10347264 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10347263 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 10347204 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10347203 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 10347144 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 10347143 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 10347084 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 10347083 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 10347024 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347023 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 10346964 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346963 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 10346905 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346904 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 10346846 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10346845 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 10346786 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346785 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 10346726 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 10346725 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 10346667 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 10346666 taatcatttcttcgcatgtacc 10346645
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1407 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1406 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1347 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1346 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1287 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1286 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1227 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1167 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1107 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1048 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 989 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 988 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 929 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 870 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 869 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 810 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 809 taatcatttcttcgcatgtacc 788
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1150 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1149 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1090 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1089 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1030 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1029 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 970 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 910 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 850 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 791 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 732 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 731 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 672 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 671 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 613 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 612 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 553 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 552 taatcatttcttcgcatgtacc 531
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 10353362 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 10353303 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10353302 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 10353243 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10353242 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 10353183 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 10353182 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 10353123 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 10353122 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 10353063 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353062 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 10353003 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353002 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 10352944 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352943 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 10352885 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10352884 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 10352825 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352824 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 10352765 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 10352764 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 10352706 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 10352705 taatcatttcttcgcatgtacc 10352684
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1798 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1739 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1738 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1679 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1678 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1619 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1618 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1559 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1558 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1499 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1498 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1439 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1380 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1379 actgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1321 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1320 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 1261 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 1201 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1200 -ggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 1142 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1141 taatcatttcttcgcatgtacc 1120
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1831 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1772 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1771 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1712 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1711 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1652 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1651 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1592 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1591 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1532 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1472 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 1413 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 1354 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1353 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 1294 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1293 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa-ccccc 1235 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1234 cggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 1175 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1174 taatcatttcttcgcatgtacc 1153 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 73 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 622/641 (97%), Gaps = 3/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 100 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 101 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 160 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 161 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 220 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 221 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 280 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 281 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 341 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttc 400 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttc 1012 Query: 401 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 460 |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 953 Query: 461 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 520 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 952 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcat 893 Query: 521 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 580 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct: 892 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactag 833 Query: 581 tatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 640 ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 832 tatttgcggtgaatccccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 774 Query: 641 ctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 773 ctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 733
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 612/628 (97%), Gaps = 3/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 114 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 174 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 233 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 234 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 294 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 354 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaactta 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 414 cctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 473 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 910 Query: 474 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 533 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 tacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 850 Query: 534 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 593 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 790 Query: 594 tcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 653 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 789 tccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 731 Query: 654 ctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 730 ctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 610/626 (97%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 721
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 653/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 933 aaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 813 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 754 tcatcatttcttcgcatgtacc 733
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 615/633 (97%), Gaps = 3/633 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 108 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 109 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 168 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 169 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 228 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 229 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 288 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 289 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 349 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 408 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 965 Query: 409 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 468 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 469 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 846 Query: 529 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 588 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 845 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 786 Query: 589 gtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 648 ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 785 gtgaatccccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 727 Query: 649 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 726 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 694
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 646/673 (95%), Gaps = 4/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 933 aaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 813 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttc 672 | ||||||||||| Sbjct: 754 tcatcatttcttc 742
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 615/633 (97%), Gaps = 3/633 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 108 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 109 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 168 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 169 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 228 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 229 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 288 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 289 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 349 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 408 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 965 Query: 409 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 468 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 469 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 846 Query: 529 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 588 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 845 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 786 Query: 589 gtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 648 ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 785 gtgaatccccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 727 Query: 649 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 726 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 694
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 651/680 (95%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 cgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcaggactccatt 1321 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1320 tggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1261 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1260 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaag 1201 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1200 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtca 1141 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 gagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatgg 1081 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 atacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgc 1021 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 gcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 962 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 gta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 903 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 902 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 843 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | Sbjct: 842 aagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctcc-ag 784 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 783 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttca 724 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||| ||||||||| Sbjct: 723 tcatttcttcgcatgtaccc 704
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 617/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 987 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 808 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 807 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgc 749 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 614/632 (97%), Gaps = 3/632 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 992 Query: 410 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 469 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 933 Query: 470 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 932 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcac 873 Query: 530 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 589 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 872 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 813 Query: 590 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 649 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 812 tgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 754 Query: 650 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 753 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 722
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 651/680 (95%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 cgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcaggactccatt 1349 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 tggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1289 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaag 1229 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1228 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtca 1169 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatgg 1109 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 atacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgc 1049 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 gcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | Sbjct: 870 aagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctcc-ag 812 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttca 752 Query: 663 tcatttcttcacatgtaccc 682 |||||||||| ||||||||| Sbjct: 751 tcatttcttcgcatgtaccc 732
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 608/624 (97%), Gaps = 3/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 739 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttc 669 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttc 715
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 610/628 (97%), Gaps = 3/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 111 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 112 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 171 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 172 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 231 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 232 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 292 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 351 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 352 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaact 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaact 989 Query: 412 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 471 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 472 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 870 Query: 532 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 591 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 869 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 810 Query: 592 aatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 651 |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 aatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 751 Query: 652 agctctcttaatcatttcttcacatgta 679 |||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 750 agctcttttaatcatttcttcacatgta 723
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 652/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614553 gctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 5614494 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 5614493 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcattac 5614434 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614433 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 5614374 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 5614373 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 5614314 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 5614313 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 5614254 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614253 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 5614194 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614193 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 5614135 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614134 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 5614076 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614075 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 5614016 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614015 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat-cccc 5613957 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 5613956 tggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 5613897 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 5613896 taatcatttcttcgcatgtacc 5613875 Score = 624 bits (315), Expect = e-176 Identities = 373/387 (96%), Gaps = 4/387 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 295 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 355 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttac 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt-cgcgttccccttctaacttac 13436986 Query: 415 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 474 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436985 ctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 13436927 Query: 475 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 534 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13436926 acacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 13436867 Query: 535 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 594 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13436866 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 13436807 Query: 595 cccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagc 654 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13436806 ccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagc 13436748 Query: 655 tctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436747 tctcttaatcatttcttcgcatgtacc 13436721 Score = 289 bits (146), Expect = 6e-75 Identities = 171/178 (96%), Gaps = 1/178 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 456 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 516 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 575 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 576 agtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 633 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 98 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 269 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 320 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.60 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 238 ggtcagagctggcatatgccaa 259 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 653/682 (95%), Gaps = 5/682 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203583 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 23203642 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 23203643 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gttac 23203701 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 23203702 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 23203761 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 23203762 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 23203821 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203822 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 23203881 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203882 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 23203941 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203942 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaacttacctact 23204000 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204001 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 23204059 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 23204060 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 23204119 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204120 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 23204179 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 23204180 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 23204238 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 23204239 taatcatttcttcgcatgtacc 23204260 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 102 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 103 atc 105 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 102 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 103 atc 105 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 653/682 (95%), Gaps = 5/682 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154231 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 154290 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 154291 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gttac 154349 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 154350 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 154409 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 154410 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 154469 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154470 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 154529 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154530 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 154589 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154590 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaacttacctact 154648 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154649 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 154707 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 154708 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 154767 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154768 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 154827 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 154828 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 154886 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 154887 taatcatttcttcgcatgtacc 154908
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 653/682 (95%), Gaps = 5/682 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38345 gctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 38404 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 38405 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gttac 38463 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38464 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 38523 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 38524 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 38583 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38584 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 38643 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38644 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 38703 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38704 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaacttacctact 38762 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38763 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 38821 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38822 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 38881 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38882 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 38941 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 38942 -ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 39000 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 39001 taatcatttcttcgcatgtacc 39022
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 652/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614542 gctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 5614483 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 5614482 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcattac 5614423 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614422 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 5614363 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 5614362 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 5614303 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 5614302 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 5614243 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614242 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 5614183 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614182 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 5614124 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614123 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 5614065 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614064 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 5614005 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614004 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat-cccc 5613946 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 5613945 tggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 5613886 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 5613885 taatcatttcttcgcatgtacc 5613864 Score = 624 bits (315), Expect = e-176 Identities = 373/387 (96%), Gaps = 4/387 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 295 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 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||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 98 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 269 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 320 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.60 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 238 ggtcagagctggcatatgccaa 259 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 652/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38332 gctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 38391 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 38392 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcattac 38451 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38452 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 38511 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 38512 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 38571 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38572 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 38631 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38632 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 38691 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38692 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 38750 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38751 actgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 38809 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38810 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 38869 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38870 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat-cccc 38928 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 38929 tggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttt 38988 Query: 660 taatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 38989 taatcatttcttcgcatgtacc 39010
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 616/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 991 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 932 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 931 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcatt 872 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 871 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 812 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gcggtgaatccccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 753 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 752 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 717
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 644/672 (95%), Gaps = 4/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 430 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 431 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 491 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 551 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 610 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtag 789 Query: 611 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 670 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| Sbjct: 788 tcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatatct 729 Query: 671 tcacatgtaccc 682 || ||||||||| Sbjct: 728 tcgcatgtaccc 717
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 616/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtattt 798 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-tgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaagcatttcttcacatgtacc 703
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 608/626 (97%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 805 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttcatcatttcttcacatgtacc 721
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 608/626 (97%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 805 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttcatcatttcttcacatgtacc 721
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 608/626 (97%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 936 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 876 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 816 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 815 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 757 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 756 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 731
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 623/646 (96%), Gaps = 3/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 702
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 622/645 (96%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcacatgtacc 703
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 594/608 (97%), Gaps = 3/608 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 374 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 433 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 939 Query: 434 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 879 Query: 494 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 878 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 819 Query: 554 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtca 613 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 818 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtca 760 Query: 614 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 700 Query: 674 catgtacc 681 |||||||| Sbjct: 699 catgtacc 692
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 615/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 403 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 996 Query: 404 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 463 |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 937 Query: 464 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 877 Query: 524 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 583 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 876 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 817 Query: 584 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 643 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 816 ttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctc 758 Query: 644 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta 679 |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 757 gcaaatacggctcttttaatcatttcttcgcatgta 722
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 594/608 (97%), Gaps = 3/608 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 374 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 433 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 939 Query: 434 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 879 Query: 494 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 878 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 819 Query: 554 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtca 613 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 818 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtca 760 Query: 614 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 700 Query: 674 catgtacc 681 |||||||| Sbjct: 699 catgtacc 692
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 607/626 (96%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 607/626 (96%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 647/678 (95%), Gaps = 4/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 gaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 63 |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 gaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 1318 Query: 64 gcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagc 123 | ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1317 ggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttgcgagc 1258 Query: 124 ttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 183 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 ttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 1198 Query: 184 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 243 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1197 gtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcag 1138 Query: 244 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 303 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 agctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatgga 1078 Query: 304 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 363 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcg 1018 Query: 364 caataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactg 423 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 caataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactg 959 Query: 424 tacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 483 || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 ta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 900 Query: 484 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 899 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840 Query: 544 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggt 603 |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 839 agtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agt 781 Query: 604 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct: 780 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttcat 721 Query: 664 catttcttcacatgtacc 681 ||||||||| |||||||| Sbjct: 720 catttcttcgcatgtacc 703
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 621/645 (96%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 703
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 621/645 (96%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 648/680 (95%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgcattccccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaatataatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctact 419 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 420 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 479 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgctaatacacg 934 Query: 480 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 933 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 874 Query: 540 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 599 |||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 873 aagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcggtgaatcctcc 814 Query: 600 gggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctct 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 813 -agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctct 755 Query: 660 taatcatttcttcacatgta 679 ||||||||||||| |||||| Sbjct: 754 taatcatttcttcgcatgta 735
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 619/643 (96%), Gaps = 3/643 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 896 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 837 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 836 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 777 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 776 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 717 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 716 ctagtatttgcggtgaatcctcc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 658 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta 679 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 657 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta 615
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 614/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtattt 798 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-tgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaagcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 648/680 (95%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactac 421 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 422 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 481 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 482 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 541 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 542 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 601 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctcc-a 813 Query: 602 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctta 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 812 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctctta 753 Query: 662 atcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||| |||||||| Sbjct: 752 atcatttcttcgcatgtacc 733
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/615 (97%), Gaps = 3/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 126 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 127 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 186 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 187 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 246 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 247 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 307 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 367 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 426 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 971 Query: 427 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 486 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 911 Query: 487 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 851 Query: 547 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaa 606 | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 850 aggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttat 792 Query: 607 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 732 Query: 667 ttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||| Sbjct: 731 ttcttcacatgtacc 717
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 625/651 (96%), Gaps = 3/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 91 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 150 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261 Query: 151 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 210 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 211 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 270 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 271 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 330 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 331 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 390 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca- 1022 Query: 391 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccca 963 Query: 451 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 510 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 903 Query: 511 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtga 570 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 902 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatga 843 Query: 571 gccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaac 630 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 842 gccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 631 ccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| Sbjct: 783 ccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttgttcgcatgtacc 733
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 638/667 (95%), Gaps = 4/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 tgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctc 74 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctt 1252 Query: 75 ggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaag 134 |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1251 tgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacagg 1192 Query: 135 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaag 194 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 cttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaag 1132 Query: 195 ttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatat 254 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 ttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatat 1072 Query: 255 gccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcct 314 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 gccaaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcct 1012 Query: 315 gagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 374 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 gagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 952 Query: 375 caaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 434 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 951 caaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 894 Query: 435 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 494 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 893 gatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 834 Query: 495 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 833 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccatt 774 Query: 555 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcat 614 |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| Sbjct: 773 gtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctcc-agttaaatagtcat 715 Query: 615 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcac 674 ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 714 gcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgc 655 Query: 675 atgtacc 681 ||||||| Sbjct: 654 atgtacc 648
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 606/626 (96%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagct 747 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 721
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 634/662 (95%), Gaps = 4/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 430 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 970 Query: 431 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 490 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 969 cgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 910 Query: 491 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 909 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 850 Query: 551 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 610 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 849 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtag 791 Query: 611 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 670 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 790 tcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttct 731 Query: 671 tc 672 || Sbjct: 730 tc 729
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 616/638 (96%), Gaps = 4/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 430 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 431 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 491 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 551 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 610 |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatccccc-agttaagtag 789 Query: 611 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 648 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 788 tcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaa 751
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 606/626 (96%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 967 Query: 416 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 475 |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tactactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 476 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 848 Query: 536 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 595 |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 788 Query: 596 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 655 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 787 cccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagct 729 Query: 656 ctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 728 ctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 614/637 (96%), Gaps = 3/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 988 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 868 gctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 809 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 808 gcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 750 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 749 aaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 713
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 3/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 118 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 119 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 178 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 179 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 239 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 299 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 359 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctac 418 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 419 tactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 478 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 tactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 915 Query: 479 ggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 ggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 855 Query: 539 gaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccc 598 ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 854 gaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccc 795 Query: 599 cgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 658 | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 c-agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctc 736 Query: 659 ttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 735 ttaatcatttcttcacatgtacc 713
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 647/680 (95%), Gaps = 4/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactac 421 |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 422 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 481 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 482 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 541 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 542 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 601 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctcc-a 813 Query: 602 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctta 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 812 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctctta 753 Query: 662 atcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||| |||||||| Sbjct: 752 atcatttcttcgcatgtacc 733
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 615/639 (96%), Gaps = 3/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 979 Query: 404 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 463 |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 920 Query: 464 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 523 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 ctttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgca 860 Query: 524 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 583 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 859 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 800 Query: 584 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 643 |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 799 ttgcagtgaatccacc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctc 741 Query: 644 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 740 gcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtaccc 702
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 620/646 (95%), Gaps = 3/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtaccc 702
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 619/645 (95%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattataataggagcccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 612/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 857 gctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 798 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgc 739 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/615 (96%), Gaps = 3/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 126 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 127 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 186 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 187 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 246 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 247 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 307 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 366 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 367 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 426 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 930 Query: 427 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 486 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 870 Query: 487 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 810 Query: 547 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaa 606 | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 809 aggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttat 751 Query: 607 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 750 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcat 691 Query: 667 ttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||| Sbjct: 690 ttcttcacatgtacc 676
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 548/551 (99%), Gaps = 3/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 132 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 192 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 252 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 312 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 372 caacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 431 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 1877 Query: 432 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1876 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 1817 Query: 492 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1816 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 1757 Query: 552 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagt 611 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1756 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-ggttaagtagt 1698 Query: 612 catgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1697 catgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 1638 Query: 672 cacatgtaccc 682 ||||||||||| Sbjct: 1637 cacatgtaccc 1627
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/615 (96%), Gaps = 3/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 126 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 127 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 186 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 187 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 246 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 247 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 307 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 366 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 367 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 426 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 930 Query: 427 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 486 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 870 Query: 487 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 810 Query: 547 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaa 606 | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 809 aggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttat 751 Query: 607 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 750 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcat 691 Query: 667 ttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||| Sbjct: 690 ttcttcacatgtacc 676
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 623/651 (95%), Gaps = 3/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305 Query: 91 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 150 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1304 ttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1245 Query: 151 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 210 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1185 Query: 211 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 270 |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1184 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatacc 1125 Query: 271 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 330 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1065 Query: 331 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 390 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca- 1006 Query: 391 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccccca 947 Query: 451 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 510 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 887 Query: 511 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtga 570 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 886 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatga 827 Query: 571 gccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaac 630 |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 826 gccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggagc 768 Query: 631 ccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 767 ccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 717
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 586/602 (97%), Gaps = 3/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 140 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 141 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 201 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 260 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 261 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 320 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 321 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 380 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 381 ctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatg 440 ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtga-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatg 920 Query: 441 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 860 Query: 501 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 800 Query: 561 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcatta 620 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 799 gcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcatta 741 Query: 621 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 680 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 740 caataggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctcttcatcatttcttcacatgtac 681 Query: 681 cc 682 || Sbjct: 680 cc 679
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 618/645 (95%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 618/645 (95%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 618/645 (95%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataaca 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| Sbjct: 866 gcatgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 ttctctcgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 608/632 (96%), Gaps = 3/632 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 983 Query: 410 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 469 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 924 Query: 470 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 923 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 864 Query: 530 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 589 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 804 Query: 590 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 649 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 803 tgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 745 Query: 650 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 744 acagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 713
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 611/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 405 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 406 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 465 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 466 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 525 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 526 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 585 || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 586 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 645 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 646 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 638/671 (95%), Gaps = 4/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 430 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 983 Query: 431 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 490 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 923 Query: 491 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 863 Query: 551 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 610 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 862 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 804 Query: 611 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 670 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 tcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttct 744 Query: 671 tcacatgtacc 681 || |||||||| Sbjct: 743 tcgcatgtacc 733
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 638/671 (95%), Gaps = 4/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 430 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57856 Query: 431 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 490 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57855 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57796 Query: 491 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 57795 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 57736 Query: 551 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 610 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 57735 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 57677 Query: 611 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 670 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57676 tcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttct 57617 Query: 671 tcacatgtacc 681 || |||||||| Sbjct: 57616 tcgcatgtacc 57606
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 610/635 (96%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 106 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 107 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 166 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 167 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 226 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 227 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 287 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 346 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 347 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttc 1006 Query: 407 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 466 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 467 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 526 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 527 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 586 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 587 cggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 646 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 826 cggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgca 768 Query: 647 aatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 767 aatatagctctcttcatcatatcttcgcatgtacc 733
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 638/671 (95%), Gaps = 4/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 430 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 120064 Query: 431 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 490 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120063 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 120004 Query: 491 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 120003 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 119944 Query: 551 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 610 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 119943 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 119885 Query: 611 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 670 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119884 tcatgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttct 119825 Query: 671 tcacatgtacc 681 || |||||||| Sbjct: 119824 tcgcatgtacc 119814
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 638/671 (95%), Gaps = 4/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 430 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57866 Query: 431 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 490 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57865 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57806 Query: 491 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 57805 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 57746 Query: 551 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 610 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 57745 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 57687 Query: 611 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 670 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57686 tcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttct 57627 Query: 671 tcacatgtacc 681 || |||||||| Sbjct: 57626 tcgcatgtacc 57616
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 638/671 (95%), Gaps = 4/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 430 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 58437 Query: 431 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 490 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58436 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 58377 Query: 491 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 58376 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 58317 Query: 551 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 610 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 58316 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 58258 Query: 611 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 670 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58257 tcatgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttct 58198 Query: 671 tcacatgtacc 681 || |||||||| Sbjct: 58197 tcgcatgtacc 58187
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 108 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 168 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 228 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 287 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 288 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 347 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 348 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttct 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttct 948 Query: 408 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 467 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 889 Query: 468 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 527 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 829 Query: 528 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 587 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 828 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 769 Query: 588 ggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 647 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 768 ggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 710 Query: 648 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 709 atatagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 676
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 618/646 (95%), Gaps = 3/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttccc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 ggcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataaca 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 682 ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtaccc 702
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 617/645 (95%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 617/645 (95%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 617/645 (95%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 ttcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 617/645 (95%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 617/645 (95%), Gaps = 3/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 396 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 397 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 456 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 457 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 516 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 517 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaa 807 Query: 577 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 636 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 637 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttcccttgcaaatccagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 703
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 643/679 (94%), Gaps = 4/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 cgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1845 cgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1786 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1785 tgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1726 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1725 cttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1666 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1665 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtca 1606 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1605 gagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatgg 1546 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 atacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatcgc 1486 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactact 422 ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 gcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaacttacctactact 1427 Query: 423 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 482 ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 gta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1368 Query: 483 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1367 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 1308 Query: 543 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggg 602 ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1307 aagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcggtgaatcctcc-ag 1249 Query: 603 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | Sbjct: 1248 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatatagctctcttca 1189 Query: 663 tcatttcttcacatgtacc 681 |||||||||| |||||||| Sbjct: 1188 tcatttcttcgcatgtacc 1170
>emb|AJ746280.1| Agrostis stolonifera chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1316 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 588/607 (96%), Gaps = 3/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 ggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaag 134 |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1316 ggataatttccttaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacagg 1257 Query: 135 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaag 194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1256 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgccctaaag 1197 Query: 195 ttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatat 254 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 ttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatat 1137 Query: 255 gccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcct 314 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1136 gccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggcatggatgcccagtcct 1077 Query: 315 gagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 1017 Query: 375 caaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 434 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1016 caaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 959 Query: 435 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 899 Query: 495 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 554 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 898 atttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 839 Query: 555 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcat 614 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 838 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcat 780 Query: 615 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcac 674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 779 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcac 720 Query: 675 atgtacc 681 ||||||| Sbjct: 719 atgtacc 713
>emb|AJ746279.1| Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1301 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 585/603 (97%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 138 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1301 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1242 Query: 139 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1182 Query: 199 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 258 ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 cccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1122 Query: 259 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1121 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcttgagt 1062 Query: 319 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1002 Query: 379 acctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggata 438 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1001 acctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtgaata 944 Query: 439 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt 884 Query: 499 ttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcg 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 883 ttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcg 824 Query: 559 cggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcat 618 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 823 cggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcat 765 Query: 619 tacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgt 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 764 tacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgt 705 Query: 679 acc 681 ||| Sbjct: 704 acc 702
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 620/650 (95%), Gaps = 3/650 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 32 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 91 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 92 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 151 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 152 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 211 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 212 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 271 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 272 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 331 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 332 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 391 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-t 1003 Query: 392 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccag 944 Query: 452 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaa 884 Query: 512 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 571 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 883 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 824 Query: 572 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacc 631 ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 ccaaactagtatttgcggtgaatcctcc-tgttatgtagtcatgcattacaataggaacc 765 Query: 632 cctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 681 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 764 cctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 715 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 5,387,676 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 5387676 Number of successful extensions: 168459 Number of sequences better than 10.0: 15158 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15090 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 82 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 105452 Number of HSP's gapped (non-prelim): 29661 length of query: 682 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 659 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 11297433186936 effective search space used: 11297433186936 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)