| Clone Name | rbaal0c02 |
|---|---|
| Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 602/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 602/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 602/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaa 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 598/603 (99%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctakt 1472 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 932 gaa 930
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 599/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttka 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 599/605 (99%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 598/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttn 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 nntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 598/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 598/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 598/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 598/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 598/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1481 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1423 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1422 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1363 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1303 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1243 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1183 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1123 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1063 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1004 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 944 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 884 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 883 gtgaa 879
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgs 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 56331 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 56273 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 56272 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 56213 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56212 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 56153 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56152 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 56093 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56092 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 56033 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56032 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 55973 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55972 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 55913 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55912 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55854 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55853 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 55794 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55793 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 55734 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 55733 gtgaa 55729
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1517 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1459 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1458 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1399 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1339 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1279 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1219 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1159 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1099 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1040 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 980 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 920 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 919 gtgaa 915
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 594/602 (98%), Gaps = 3/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gt 601 || Sbjct: 872 gt 871
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacann-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1201 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1200 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1141 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1081 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1021 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 961 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 901 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 841 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcg 662 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 661 gtgaa 657
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1201 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1200 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1141 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1081 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1021 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 961 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 901 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 841 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcg 662 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 661 gtgaa 657
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 933 gtgaa 929
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 933 gtgaa 929
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 933 gtgaa 929
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 933 gtgaa 929
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 933 gtgaa 929
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1389 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1331 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1330 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1271 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1211 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1151 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1091 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1031 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 971 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 912 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 852 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 851 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 792 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 791 gtgaa 787
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgccgcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 591/602 (98%), Gaps = 3/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gt 601 || Sbjct: 872 gt 871
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 594/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaag-ctgcngcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 594/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 ccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 933 gtgaa 929
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1477 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1476 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1417 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1357 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1297 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1237 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1177 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 938 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 937 gtgaa 933
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgs 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 592/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 933 gtgaa 929
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1477 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1476 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1417 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1357 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1297 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1237 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1177 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 caataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 938 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 937 gtgaa 933
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1333 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1332 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1273 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1213 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1153 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1093 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 taacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1033 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 973 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 794 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 793 gtgaa 789
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 591/602 (98%), Gaps = 3/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1333 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1332 gttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1273 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1213 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1153 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1093 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1033 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 973 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 794 Query: 600 gt 601 || Sbjct: 793 gt 792
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgg 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 ccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1340 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1339 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1280 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1220 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1160 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1100 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1040 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 980 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 921 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 861 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 860 cggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 801 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 800 gtgaa 796
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1340 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1339 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1280 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1220 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1160 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1100 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1040 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 980 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 921 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 861 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 860 cggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 801 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 800 gtgaa 796
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 872 gtgaa 868
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 590/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 592/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1477 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1476 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1417 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1357 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1297 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1237 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1177 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 938 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 937 gtgaa 933
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 592/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1201 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1200 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1141 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1140 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccag 1081 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1021 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 961 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 901 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 841 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcg 662 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 661 gtgaa 657
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 591/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1477 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1476 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1417 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1416 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccag 1357 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1297 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1237 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1177 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 938 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 937 gtgaa 933
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 591/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 590/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 ccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 590/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1473 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagcc-gcggcta 1415 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1414 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1355 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1295 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1294 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccc 1235 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1175 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1115 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 caataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1055 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 996 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 995 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgca 936 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 935 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 876 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 875 gtgaa 871
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 587/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgs 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1113 acttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnna 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 934 gtgaa 930
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 588/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1402 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagcc-gcggcta 1344 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1343 gttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1284 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1283 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccag 1224 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1223 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccc 1164 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1104 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1044 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 984 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 805 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 804 gtgaa 800
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 588/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1382 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagcc-gcggcta 1324 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1323 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1264 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccag 1204 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1203 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcac 1144 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1084 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 taacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1024 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 964 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 905 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 845 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 785 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 784 gtgaa 780
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 588/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagcc-gcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1243 gtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 588/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagcc-gcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 588/605 (97%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| Sbjct: 1520 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagcc-gcggcta 1462 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1461 gttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1402 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1342 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1341 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1282 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1222 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 taacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1162 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1102 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 gcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1043 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 983 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 982 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 923 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 922 gtgaa 918
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 535/537 (99%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 808
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 576/589 (97%), Gaps = 3/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 aactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccattt 75 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccattt 1338 Query: 76 gcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagc 135 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1337 gcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagc 1278 Query: 136 ttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 195 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1277 ttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagg 1218 Query: 196 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 255 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcag 1158 Query: 256 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 315 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatgga 1098 Query: 316 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 375 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcg 1038 Query: 376 caataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 435 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 caataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 978 Query: 436 acccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 495 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 a-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 919 Query: 496 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 859 Query: 556 gtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 gtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 810
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 534/537 (99%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 794
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 586/604 (97%), Gaps = 3/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagcc-gcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 824 Query: 601 tgaa 604 |||| Sbjct: 823 tgaa 820
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 541/547 (98%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 770 cggtgaa 764
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 541/547 (98%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 770 cggtgaa 764
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 586/605 (96%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | || |||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagcc-gcagcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcac 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 596 tgcggtgaa 604 ||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaa 800
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 540/547 (98%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 806 cggtgaa 800
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 539/546 (98%), Gaps = 1/546 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 119 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 178 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 179 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 238 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 239 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 299 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 359 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 419 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 539 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 598 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 599 ggtgaa 604 |||||| Sbjct: 805 ggtgaa 800
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 581/600 (96%), Gaps = 3/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagt 1345 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1344 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgt 1285 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1225 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1224 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1165 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1164 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1105 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1045 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 985 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 926 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 925 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 866 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 865 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 806
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 582/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagt 1346 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1345 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1286 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1226 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1225 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1166 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1165 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1106 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1046 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 986 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 927 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 926 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 867 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 807 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 806 gaa 804
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 538/547 (98%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 796 cggtgaa 790
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 596 tgcggtgaa 604 ||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaa 800
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 583/605 (96%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 583/605 (96%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1409 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggcta 1351 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1350 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1291 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1290 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1231 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1230 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1171 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1170 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1111 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1051 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 991 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 932 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 872 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 812 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 811 gtgaa 807
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 583/605 (96%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1407 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggcta 1349 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1348 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1289 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1288 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1229 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1228 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1169 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1168 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1109 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1049 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 989 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 930 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 870 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 810 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 809 gtgaa 805
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 583/605 (96%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggcta 1363 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1362 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1303 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1302 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1243 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1242 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1183 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1182 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1123 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1063 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1003 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 944 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 884 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 824 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 823 gtgaa 819
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 537/547 (98%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 824 cggtgaa 818
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 583/603 (96%), Gaps = 5/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagt 124698 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 124697 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 124638 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124637 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124578 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124577 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 124518 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124517 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 124459 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 124458 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttca 124400 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124399 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124340 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124339 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124281 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124280 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124221 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124220 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 124161 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 124160 gaa 124158 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 583/603 (96%), Gaps = 5/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagt 30171 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 30170 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 30111 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30110 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30051 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30050 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 29991 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 29990 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 29932 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 29931 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttca 29873 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29872 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29813 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29812 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29754 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29753 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29694 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29693 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 29634 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 29633 gaa 29631
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 527/534 (98%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 811
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 552/566 (97%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcat 98 ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcat 1305 Query: 99 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 158 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1304 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1245 Query: 159 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 218 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1185 Query: 219 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 278 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 attgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1125 Query: 279 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 338 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 taccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1065 Query: 339 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1005 Query: 399 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1004 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 459 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 519 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatag 578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataa 826 Query: 579 tgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 825 tgagccaaactagtatttgcggtgaa 800
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 538/549 (97%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 596 tgcggtgaa 604 ||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaa 801
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 582/605 (96%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 55464 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55463 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55404 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54925 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 54924 gaa 54922
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 55464 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55463 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55404 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54925 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 54924 gaa 54922
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 55412 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55411 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55352 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55351 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55292 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55291 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55232 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55231 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55172 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55171 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55112 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55111 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55052 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55051 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54993 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54992 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54933 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54932 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54873 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 54872 gaa 54870
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 536/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 790 cggtgaa 784
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 536/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 807 cggtgaa 801
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 125753 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 125752 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 125693 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 125692 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 125633 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 125632 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 125573 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 125572 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 125513 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125512 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 125453 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125452 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 125393 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125392 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 125334 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 125333 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 125274 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125273 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 125214 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 125213 gaa 125211 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 30693 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 30692 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 30633 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30632 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30573 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30572 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30513 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30512 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 30453 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30452 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 30393 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30392 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 30333 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30332 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 30274 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 30273 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 30214 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30213 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 30154 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 30153 gaa 30151
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 124780 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 124779 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 124720 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 124241 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 124240 gaa 124238 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 30199 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 30198 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 30139 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 29660 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 29659 gaa 29657
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 124780 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 124779 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 124720 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 124241 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 124240 gaa 124238 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 30199 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 30198 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 30139 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 29660 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 29659 gaa 29657
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 55456 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55455 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55396 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55395 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55336 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55335 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55276 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55275 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55216 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55215 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55156 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55155 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55096 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55095 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55037 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55036 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54977 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54976 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54917 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 54916 gaa 54914
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 536/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 790 cggtgaa 784
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 1362 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 822 gaa 820
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaag-ctgcggctagt 1362 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 822 gaa 820
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 33527208 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 33527209 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 33527268 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527269 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 33527328 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 33527329 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 33527388 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 33527389 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 33527448 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527449 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 33527508 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527509 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 33527568 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527569 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 33527627 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 33527628 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 33527687 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527688 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 33527747 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 33527748 gaa 33527750 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 36/38 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 567 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 39115435
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 536/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 796 cggtgaa 790
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 72405 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 72406 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 72465 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 72466 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 72525 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 72526 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 72585 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 72586 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 72645 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72646 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 72705 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72706 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 72765 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72766 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 72824 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 72825 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 72884 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 72885 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 72944 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 72945 gaa 72947
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 1417 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1416 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1357 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1297 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1296 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1237 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1236 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1177 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1117 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1057 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 998 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 997 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 938 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 937 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 878 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 877 gaa 875
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 1160 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1159 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1100 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1040 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1039 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 980 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 979 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 920 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 860 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 800 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 741 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 740 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 681 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 680 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 621 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 620 gaa 618
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 55391 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55390 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55331 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55330 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55271 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55270 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55211 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55210 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55151 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55150 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55091 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55090 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55031 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55030 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54972 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54971 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54912 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54911 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54852 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 54851 gaa 54849
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 1749 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1748 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1689 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1688 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1629 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1628 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1569 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1568 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1509 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1449 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1448 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1389 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1330 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1329 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1270 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 1210 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 1209 gaa 1207
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 1782 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1781 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1722 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1721 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1662 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1661 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1602 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1601 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1542 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1482 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1422 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1363 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1303 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1302 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 1243 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 1242 gaa 1240 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 85 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 528/537 (98%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 808
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 537/549 (97%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1349 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1290 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1230 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1170 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1110 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1050 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccct 990 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 931 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 871 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 870 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 811 Query: 596 tgcggtgaa 604 ||||||||| Sbjct: 810 tgcggtgaa 802
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 581/605 (96%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1337 agtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaag-ctgcggcaa 1279 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1278 gttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1219 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1218 gcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccg 1159 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1158 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccc 1099 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1098 caaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggta 1039 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 taacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 979 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 919 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 860 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 800 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 740 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 739 gtgaa 735
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 581/605 (96%), Gaps = 3/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 59 ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaag-ctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcac 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccg 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct: 1243 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 824 gtgaa 820
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 580/604 (96%), Gaps = 3/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctag 60 |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaag-ctgcggctag 1335 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1334 ttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1275 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1274 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1215 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1214 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1155 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| Sbjct: 1154 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtat 1095 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1094 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttc 1035 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 975 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 916 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 915 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 856 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 855 ggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 796 Query: 601 tgaa 604 |||| Sbjct: 795 tgaa 792
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 562/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 1327 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 tgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtac 1267 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1266 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1207 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1147 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 catatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggataccca 1087 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1027 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1026 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 808
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 579/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 1362 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 822 gaa 820
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 530/541 (97%), Gaps = 1/541 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 123 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 124 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 183 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 184 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 243 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 244 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 304 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 363 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 364 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 424 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 483 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 484 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 544 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 603 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 809 Query: 604 a 604 | Sbjct: 808 a 808
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 822 gaa 820
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 579/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 53666 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 53665 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 53606 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 53605 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 53546 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 53545 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 53486 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 53485 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 53426 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53425 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 53366 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53365 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 53306 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53305 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 53247 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 53246 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 53187 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53186 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 53127 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 53126 gaa 53124
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 579/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 128599 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 128598 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 128539 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 128538 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 128479 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 128478 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 128419 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 128418 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 128359 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128358 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 128299 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128298 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 128239 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128238 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 128180 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 128179 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 128120 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128119 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 128060 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 128059 gaa 128057
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 579/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 10347274 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 10347273 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 10347214 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347213 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10347154 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10347153 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10347094 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10347093 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10347034 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347033 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10346974 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346973 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10346914 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346913 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10346855 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10346854 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10346795 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10346794 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 10346735 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 10346734 gaa 10346732
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 579/603 (96%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 10353313 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 10353312 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 10353253 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353252 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10353193 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10353192 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10353133 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10353132 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10353073 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353072 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10353013 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353012 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10352953 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352952 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10352894 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10352893 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10352834 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10352833 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 10352774 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 10352773 gaa 10352771
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 527/537 (98%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 808
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 527/537 (98%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 810
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 536/549 (97%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 596 tgcggtgaa 604 ||||||||| Sbjct: 815 tgcggtgaa 807
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 536/549 (97%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 596 tgcggtgaa 604 ||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaa 805
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 538/552 (97%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 112 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 113 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 172 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 173 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 232 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 233 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 292 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 293 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 353 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 412 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 413 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 472 ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 473 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 533 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 592 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 593 atttgcggtgaa 604 |||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaa 820
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 534/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 790 cggtgaa 784
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 578/603 (95%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaag-ctgcggctagt 5614504 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 5614503 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 5614444 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614443 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614384 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614383 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614324 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614323 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614264 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614263 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614204 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614203 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614144 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614143 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614085 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614084 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 5614025 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614024 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 5613965 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 5613964 gaa 5613962 Score = 496 bits (250), Expect = e-137 Identities = 288/298 (96%), Gaps = 2/298 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 307 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 367 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13436926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436925 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13436866 Query: 547 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13436865 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 13436808 Score = 226 bits (114), Expect = 7e-56 Identities = 132/138 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 467 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 527 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 586 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 587 agtagtatttgcggtgaa 604 | |||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaa 13397959 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 252 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 281 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 332 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.53 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 ggtcagagctggcatatgccaa 271 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 528/539 (97%), Gaps = 1/539 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 126 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 186 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 246 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 306 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 366 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 426 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 485 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 486 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 545 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 546 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 790
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 578/603 (95%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaag-ctgcggctagt 5614493 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 5614492 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 5614433 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614432 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614373 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614372 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614313 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614312 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614253 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614252 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614193 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614192 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614133 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614074 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614073 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 5614014 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614013 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 5613954 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 5613953 gaa 5613951 Score = 496 bits (250), Expect = e-137 Identities = 288/298 (96%), Gaps = 2/298 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 307 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 367 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13391200 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391199 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13391140 Query: 547 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13391139 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 13391082 Score = 226 bits (114), Expect = 7e-56 Identities = 132/138 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 467 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 527 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 586 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 587 agtagtatttgcggtgaa 604 | |||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaa 13352233 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 252 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 281 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 332 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.53 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 ggtcagagctggcatatgccaa 271 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 578/603 (95%), Gaps = 3/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaag-ctgcggctagt 38381 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 38382 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 38441 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38442 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38501 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38502 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38561 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38562 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38621 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38622 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38681 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38682 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 38741 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38742 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38800 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38801 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38860 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38861 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 38920 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 38921 gaa 38923
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 549/566 (96%), Gaps = 2/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcat 98 ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcat 1305 Query: 99 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 158 ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1304 taccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1245 Query: 159 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 218 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1185 Query: 219 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 278 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 attgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1125 Query: 279 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 338 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 taccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1065 Query: 339 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1005 Query: 399 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1004 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 459 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 519 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatag 578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataa 826 Query: 579 tgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 825 tgagccaaactagtatttgcggtgaa 800
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 535/549 (97%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 596 tgcggtgaa 604 ||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaa 800
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 531/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 601 tgaa 604 |||| Sbjct: 784 tgaa 781
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 531/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 601 tgaa 604 |||| Sbjct: 784 tgaa 781
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 578/604 (95%), Gaps = 3/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctag 60 ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctag 1278 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1277 ttcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1218 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccagg 1158 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1157 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1098 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1097 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtat 1038 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1037 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttc 978 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 918 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttag 859 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 858 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 799 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| Sbjct: 798 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcgg 739 Query: 601 tgaa 604 |||| Sbjct: 738 tgaa 735
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 528/541 (97%), Gaps = 1/541 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 123 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 124 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 183 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 184 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 243 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 244 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 304 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 363 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 364 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 424 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 483 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 484 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 544 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 603 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809 Query: 604 a 604 | Sbjct: 808 a 808
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 512/519 (98%), Gaps = 1/519 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 386 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 446 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 506 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 566 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 782
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 533/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 806 cggtgaa 800
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 512/519 (98%), Gaps = 1/519 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 386 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 446 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 506 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 566 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 782
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 562/583 (96%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 1327 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1267 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1266 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1207 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1147 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1146 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1087 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1027 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1026 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 805
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 578/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 23203632 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 23203633 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 23203692 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203693 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 23203751 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 23203752 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 23203811 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 23203812 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 23203871 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203872 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 23203931 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 23203932 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 23203991 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203992 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 23204050 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 23204051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 23204110 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 23204111 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 23204170 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 23204171 gaa 23204173 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 115 atc 117 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 115 atc 117 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 578/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 154280 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 154281 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 154340 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154341 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 154399 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 154400 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 154459 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 154460 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 154519 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154520 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 154579 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 154580 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 154639 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154640 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 154698 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 154699 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 154758 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 154759 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 154818 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 154819 gaa 154821
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 578/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctagt 38394 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 38395 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 38454 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38455 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38513 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38514 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38573 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38574 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38633 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38634 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38693 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38694 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 38753 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38754 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38812 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38813 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38872 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38873 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 38932 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 38933 gaa 38935
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 538/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 525/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 525/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 525/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 577/604 (95%), Gaps = 3/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaag-ctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctgg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttg 944 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 884 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcgg 824 Query: 601 tgaa 604 |||| Sbjct: 823 tgaa 820
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 577/604 (95%), Gaps = 3/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaag-ctgcggctag 1333 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1332 ttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1273 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 cccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1213 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1212 tgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1153 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1152 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1093 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1092 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttc 1033 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 973 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 914 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 913 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 854 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 853 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 794 Query: 601 tgaa 604 |||| Sbjct: 793 tgaa 790
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 532/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 810 cggtgaa 804
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 529/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 811 gaa 809
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 532/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 796 cggtgaa 790
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 531/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 807 cggtgaa 801
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgctagc 1329 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 tgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1269 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1268 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1209 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1149 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1148 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1089 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 gtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1029 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1028 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 970 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 969 cgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 910 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 909 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 850 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 807
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 544/563 (96%), Gaps = 2/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 ttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattac 101 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1322 Query: 102 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 161 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1321 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1262 Query: 162 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 221 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 222 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 281 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 282 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 341 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 342 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 402 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 461 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccca 963 Query: 462 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 521 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 903 Query: 522 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtga 581 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 902 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatga 843 Query: 582 gccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 842 gccaaagtagtatttgcggtgaa 820
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 531/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 796 cggtgaa 790
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 523/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 523/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 523/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 523/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 818
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 566/592 (95%), Gaps = 3/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactcca 72 |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 73 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 132 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 133 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 192 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 193 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 253 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 312 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 313 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 372 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 373 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 432 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 433 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 492 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 493 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 552 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 553 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaa 820
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 509/519 (98%), Gaps = 1/519 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 386 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 446 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 506 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 566 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 779
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 509/519 (98%), Gaps = 1/519 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 386 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 446 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 506 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 566 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 779
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1252 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1193 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1192 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1133 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1132 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacng 1073 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1072 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1013 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1012 caaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 953 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 gatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 893 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 ccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 834 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 833 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 774 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 773 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 714 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 713 gtatttgcggtgaa 700
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 529/546 (96%), Gaps = 1/546 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 119 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 179 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 238 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 239 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 299 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 358 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 359 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 419 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 478 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 538 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 539 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 598 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 599 ggtgaa 604 |||||| Sbjct: 825 ggtgaa 820
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacataggc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 531/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 596 tgcggtgaa 604 ||| ||||| Sbjct: 798 tgcagtgaa 790
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 519/534 (97%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 71 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 130 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 131 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 190 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 191 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 251 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 311 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 371 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 431 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 490 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 491 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 551 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 800
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 565/592 (95%), Gaps = 3/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactcca 72 |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 73 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 132 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 133 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 192 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 193 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 253 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 312 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 313 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 372 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 373 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 432 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 433 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 492 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 493 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 552 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 553 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaa 820
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 542/563 (96%), Gaps = 2/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 ttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattac 101 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1306 Query: 102 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 161 |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1305 cttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1246 Query: 162 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 221 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1186 Query: 222 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 281 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1185 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatac 1126 Query: 282 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 341 | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1066 Query: 342 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1006 Query: 402 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 461 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccccca 947 Query: 462 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 521 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 887 Query: 522 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtga 581 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 886 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatga 827 Query: 582 gccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||| |||||||||||||||| Sbjct: 826 gccaaactagtatttgcggtgaa 804
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 796 cggtgaa 790
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 537/555 (96%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgcga 109 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcacga 1284 Query: 110 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 169 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 170 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 229 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 230 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 289 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 290 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 349 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 350 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgc 984 Query: 410 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 469 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 589 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 590 agtatttgcggtgaa 604 ||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaa 790
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 513/526 (97%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 138 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 139 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 198 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 199 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 258 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 259 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 319 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 378 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 379 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 439 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 498 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 499 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 559 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 763
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 513/526 (97%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 138 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 139 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 198 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 199 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 258 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 259 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 319 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 379 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 970 Query: 439 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 499 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 559 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 804
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 513/526 (97%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 138 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 139 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 198 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 199 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 258 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 259 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 319 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 378 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 379 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 439 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 498 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 499 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 559 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 763
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 534/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 534/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 534/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 521/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 790
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 527/545 (96%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768 Query: 600 gtgaa 604 ||||| Sbjct: 767 gtgaa 763
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 573/604 (94%), Gaps = 3/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctag 60 ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctag 1800 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1799 ttcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1740 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1739 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccagg 1680 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1679 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1620 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1619 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1560 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1559 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttc 1500 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1499 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaa 1440 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1439 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttag 1381 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1380 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 1321 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1320 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcgg 1261 Query: 601 tgaa 604 |||| Sbjct: 1260 tgaa 1257
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 525/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 802 gaa 800
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 525/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 925 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 865 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 805 Query: 602 gaa 604 ||| Sbjct: 804 gaa 802
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 557/583 (95%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagc 120423 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120422 tgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 120363 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 120362 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 120303 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120302 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 120243 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120242 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggataccca 120183 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120182 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 120123 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 120122 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 120064 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120063 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 120004 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 120003 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 119944 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 119943 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaa 119901
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 528/547 (96%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaa 604 ||||||| Sbjct: 796 cggtgaa 790
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 557/583 (95%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagc 58796 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58795 tgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 58736 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 58735 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 58676 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58675 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 58616 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58615 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggataccca 58556 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58555 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 58496 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 58495 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 58437 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58436 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 58377 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 58376 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 58317 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 58316 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaa 58274
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 533/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| Sbjct: 863 tgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 533/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 533/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaacta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 501/512 (97%), Gaps = 1/512 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 152 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 153 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 212 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 213 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 272 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 273 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 332 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 333 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 392 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 393 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatga 452 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatga 919 Query: 453 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 859 Query: 513 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 799 Query: 573 caatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 caataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 767
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 572/604 (94%), Gaps = 3/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctag 60 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctag 1780 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1779 ttcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1720 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1719 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccagg 1660 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1659 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcc 1600 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1599 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1540 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1539 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttc 1480 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1479 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaa 1420 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1419 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttag 1361 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1360 ctaatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 1301 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| Sbjct: 1300 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagacaaactagtatttgcgg 1241 Query: 601 tgaa 604 |||| Sbjct: 1240 tgaa 1237
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 556/583 (95%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagc 1342 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 tgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1282 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1281 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1222 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1162 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 1102 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1042 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1041 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 983 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 923 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 863 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaa 820
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 556/583 (95%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagc 58215 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58214 tgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 58155 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 58154 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 58095 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58094 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 58035 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58034 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 57975 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57974 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 57915 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57914 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57856 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57855 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57796 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 57795 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 57736 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 57735 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaa 57693
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 527/547 (96%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaa 604 | ||||| Sbjct: 796 cagtgaa 790
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 556/583 (95%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagc 58225 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58224 tgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 58165 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 58164 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 58105 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58104 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 58045 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58044 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 57985 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57984 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 57925 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57924 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57866 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57865 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57806 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 57805 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 57746 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 604 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 57745 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaa 57703
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 532/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 532/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 111 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 170 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 171 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 230 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 231 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 290 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 291 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaac 1043 Query: 351 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 411 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 470 |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 471 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 531 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 590 |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 591 gtatttgcggtgaa 604 |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaa 790 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,555,241 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4555241 Number of successful extensions: 132084 Number of sequences better than 10.0: 15104 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15038 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 76 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 90345 Number of HSP's gapped (non-prelim): 22212 length of query: 604 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 581 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9960255966024 effective search space used: 9960255966024 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)