| Clone Name | rbah59l13 |
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| Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 539/544 (99%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 539/544 (99%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 539/544 (99%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
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>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 538/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 537/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 537/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 537/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 537/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 537/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 kagstaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 537/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 537/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 536/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatantatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctakttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 536/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 536/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 535/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 | |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tnnntaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1483 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1424 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1423 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1364 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1304 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1244 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1184 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1124 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1064 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1063 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1004 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 945 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 944 ac 943
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1082 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 723 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 722 ac 721
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1082 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 723 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 722 ac 721
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56333 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 56274 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56273 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 56214 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56213 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 56154 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56153 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 56094 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56093 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 56034 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56033 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 55974 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55973 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 55914 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 55913 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55854 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55853 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 55795 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 55794 ac 55793
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 534/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1460 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1400 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1340 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1280 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1220 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1160 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1100 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1099 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1040 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 981 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 980 ac 979
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 535/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 535/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 535/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 533/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1477 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1417 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1357 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1297 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1237 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctt 1177 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1117 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1116 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 998 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 997 gcac 994
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 532/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcs 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 533/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 532/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggct 1365 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1305 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1185 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 885 ac 884
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1476 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1416 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1356 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1296 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1236 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1176 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1116 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1115 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 997 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 996 gcac 993
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1476 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1416 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1356 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1296 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1236 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1176 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1116 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1115 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 997 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 996 gcac 993
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1476 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1416 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1356 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1296 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1236 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1176 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1116 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1115 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 997 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 996 gcac 993
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1476 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1416 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1356 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1296 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1236 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1176 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1116 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1115 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 997 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 996 gcac 993
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1476 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1416 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1356 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1296 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1236 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1176 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1116 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1115 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 997 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 996 gcac 993
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1334 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1274 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1214 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1154 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1094 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1034 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1033 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 974 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 973 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 914 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 913 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 855 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 854 gcac 851
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 534/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 531/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcs 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 532/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 533/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 533/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 533/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 533/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1343 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1283 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1223 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1163 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1103 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1043 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 983 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 982 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 923 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 922 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 864 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 863 gcac 860
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1476 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1416 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1356 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1296 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1236 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1176 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 tttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1116 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1115 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 997 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 996 gcac 993
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 533/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1480 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1420 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1360 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1300 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1240 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1180 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1120 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1119 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1060 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 1001 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 1000 gcac 997
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 533/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1343 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1283 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1223 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1163 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1103 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1043 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 983 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 982 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 923 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 922 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 864 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 863 gcac 860
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 533/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1415 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1355 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 cgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1295 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1235 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1175 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1115 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1055 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1054 ctaacttacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 936 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 935 gcac 932
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 532/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcng 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagataatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 531/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgacca 1082 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 723 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 722 ac 721
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 531/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1476 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1416 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1356 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1296 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1236 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1176 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1175 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttcccctt 1116 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1115 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 997 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 996 gcac 993
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 532/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1480 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1420 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1360 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1300 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1240 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1180 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1120 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1119 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1060 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 1001 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 1000 gcac 997
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 531/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 atagtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1334 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1274 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1214 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1154 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1094 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1034 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 974 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 973 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 855 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 854 ac 853
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 530/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcs 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 532/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1336 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1276 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1216 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1156 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1096 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 gtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1036 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 976 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 975 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 916 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 857 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 856 gcac 853
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 532/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 530/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 933 ac 932
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 529/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 532/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1480 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1420 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1360 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1300 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1240 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1180 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1120 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1119 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1060 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tagctaatacacggaaatgcataccatga-ttnntctgtctatcaataactgcatgcatt 1001 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 1000 gcac 997
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 530/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 cgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1480 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1420 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1419 cgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnac 1360 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1300 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1240 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1180 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1120 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1119 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1060 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 1001 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 1000 gcac 997
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 526/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcs 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 530/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1477 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcgg 1418 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1417 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1358 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1298 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1297 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1238 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1178 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1118 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1058 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1057 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 998 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 997 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcagtaactgcatgcatt 939 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 938 gcac 935
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 530/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 529/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 528/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1246 caggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcgtgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 528/544 (97%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcag 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 526/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1404 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggct 1345 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1285 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacca 1225 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcc 1165 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttct 985 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 865 ac 864
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 526/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1365 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1185 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1004 agcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 885 ac 884
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 526/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1522 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1463 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1462 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1403 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1343 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1342 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1283 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1223 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1163 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1103 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1102 agcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1043 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 984 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 983 ac 982
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 523/542 (96%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | Sbjct: 1114 aacttacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnna 1055 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 995 ac 994
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 527/544 (96%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1386 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcgg 1327 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1326 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1267 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcac 1207 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1206 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1147 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 caccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1087 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1027 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 967 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 966 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 907 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 906 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 848 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 847 gcac 844
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 526/544 (96%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1426 cgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1246 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1186 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 887 gcac 884
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 519/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 983 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 924 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 atacacgaaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 869
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 510/524 (97%), Gaps = 1/524 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 101 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 160 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 161 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 220 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 221 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 281 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 341 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 400 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 401 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 460 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 461 ccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgc 520 |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 917 Query: 521 ataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 874
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 519/536 (96%), Gaps = 3/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124338 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124279 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124278 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 124224 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 519/536 (96%), Gaps = 3/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 29811 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29752 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 29751 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 29697
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54988
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54988
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55050 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54991 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 54990 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54936
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 125391 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 125332 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125331 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 125277 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 30332 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 30331 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 30272 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30271 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 30217
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 124304 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 29723
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 124304 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 29723
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55094 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55035 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55034 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54980
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 519/540 (96%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 519/540 (96%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1411 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1352 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1351 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1292 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1291 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1232 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1231 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1172 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1171 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1112 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1052 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 992 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 991 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 932 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 gctaatacacgaaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 873
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 984 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 925 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 atacacgaaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 870
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 519/540 (96%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1409 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1350 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1290 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1289 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1230 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1229 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1170 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1169 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1110 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1050 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 990 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 989 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 930 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 gctaatacacgaaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 871
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 519/540 (96%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1423 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1364 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1304 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1303 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1244 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1243 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1184 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1183 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1124 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1064 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1004 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1003 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 944 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 gctaatacacgaaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 885
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 33527570 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 33527629 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527630 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 33527684
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 72767 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 72826 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72827 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 72881
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1055 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 996 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 941
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 798 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 739 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 684
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55029 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54970 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 54969 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54915
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1420 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1361 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1360 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 1306 Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 109 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 520/542 (95%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1426 cgatagtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1306 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1246 ccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1186 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gc 562 || Sbjct: 887 gc 886
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 477/485 (98%), Gaps = 1/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 80 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 140 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 199 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 200 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 259 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 260 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 320 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 380 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 440 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgct 499 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 500 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcat 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 560 tgcac 564 ||||| Sbjct: 868 tgcac 864
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 518/540 (95%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 82 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatg-ttttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 515/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 500/516 (96%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 871
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 515/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 53304 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 53245 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53244 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 53190
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 515/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 128237 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 128178 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128177 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 128123
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 515/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10346912 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10346853 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346852 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 10346798
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 515/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10352951 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10352892 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352891 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 10352837
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 515/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1387 tacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1328 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 1273
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 492/506 (97%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 118 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 119 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 178 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 179 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 238 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 239 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 298 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 299 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 358 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 359 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 419 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 479 nccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntg 538 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctg 890 Query: 539 tntatcaataactgcatgcattgcac 564 | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcac 864
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 519/542 (95%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcgg 1367 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1366 ctagttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagat 1307 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1306 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1247 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 ctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1187 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1186 ctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1127 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1126 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctt 1067 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 tttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 1007 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 946 ttgctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 888 Query: 561 gc 562 || Sbjct: 887 gc 886
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 467/473 (98%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 515/537 (95%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 26 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 85 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 86 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 145 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 146 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 205 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 206 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 265 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 266 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 325 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 326 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 385 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 386 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 446 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagct 505 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 914 Query: 506 aatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 aatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 858
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 514/536 (95%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaact 1001 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacgaaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 520/544 (95%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 cgatagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcgg 1282 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1281 caagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagat 1222 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1221 cgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcac 1162 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1161 ccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1102 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1101 ccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1042 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 gtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 982 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 922 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 921 ctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 862 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 861 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 803 Query: 561 gcac 564 |||| Sbjct: 802 gcac 799
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 514/536 (95%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 5614142 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614083 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614082 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 5614028 Score = 383 bits (193), Expect = e-103 Identities = 223/232 (96%), Gaps = 2/232 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 331 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 391 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 451 tactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatac 510 |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 511 acggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatga-ttattctgtctatcaataactgcatgcattgc 13436874 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 67/70 (95%), Gaps = 1/70 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 13398093 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 13398035 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 13398034 catgcattgc 13398025 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 79 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 134 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 276 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 305 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 356 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 390 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.49 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 274 ggtcagagctggcatatgccaa 295 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 514/536 (95%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 5614131 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614072 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614071 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 5614017 Score = 383 bits (193), Expect = e-103 Identities = 223/232 (96%), Gaps = 2/232 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 331 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 391 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 451 tactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatac 510 |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 511 acggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatga-ttattctgtctatcaataactgcatgcattgc 13391148 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 67/70 (95%), Gaps = 1/70 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 13352367 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 13352309 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 13352308 catgcattgc 13352299 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 79 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 134 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 276 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 305 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 356 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 390 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.49 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 274 ggtcagagctggcatatgccaa 295 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 514/536 (95%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38743 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38802 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38803 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 38857
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 474/483 (98%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 830 cac 828
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 474/483 (98%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 830 cac 828
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 474/483 (98%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 866 cac 864
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 473/482 (98%), Gaps = 1/482 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 563 ac 564 || Sbjct: 865 ac 864
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 466/473 (98%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 858
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 514/537 (95%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 26 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 85 ||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 86 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 145 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 146 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 205 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 206 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 265 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 266 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 325 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 326 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 386 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 446 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagct 505 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 857 Query: 506 aatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 aatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 801
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 514/536 (95%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 23203993 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 23204052 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204053 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 23204107 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 79 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 138 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 139 atc 141 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 79 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 138 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 139 atc 141 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 514/536 (95%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 154641 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 154700 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154701 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 154755
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 514/536 (95%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38755 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38814 Query: 507 atacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38815 atacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 38869
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 474/485 (97%), Gaps = 1/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 80 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 140 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 199 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 200 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 259 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 260 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 320 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 379 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 380 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 440 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgct 499 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 500 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcat 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 560 tgcac 564 ||||| Sbjct: 868 tgcac 864
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 472/483 (97%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 884 cac 882
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 472/483 (97%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 856 cac 854
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 489/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 118 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 119 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 178 ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 179 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 238 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 239 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 298 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 299 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 358 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 359 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 419 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 479 nccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntg 538 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctg 890 Query: 539 tntatcaataactgcatgcattgcac 564 | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcac 864
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 516/542 (95%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 cgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcgg 80 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1396 cgatggtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcgg 1337 Query: 81 ctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 140 |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1336 ctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 141 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 200 | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 201 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 260 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1157 Query: 261 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 320 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 321 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctt 1037 Query: 381 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 441 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctt 500 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 501 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcatt 560 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 561 gc 562 || Sbjct: 857 gc 856
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 464/473 (98%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 503/525 (95%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 97 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 98 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 157 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 158 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 217 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 218 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 278 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 337 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 338 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 398 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 457 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 458 gtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaa 517 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 518 tgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 496/516 (96%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 871
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 471/483 (97%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 850 cac 848
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 471/483 (97%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 867 cac 865
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 471/483 (97%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 850 cac 848
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/494 (96%), Gaps = 1/494 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 71 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 130 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 131 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 190 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 191 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 250 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 251 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 310 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 311 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 370 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 371 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 430 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 431 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacata 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 491 cncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataac 550 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataac 880 Query: 551 tgcatgcattgcac 564 |||||||||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcac 866
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 463/473 (97%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 472/485 (97%), Gaps = 1/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 80 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 140 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 199 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 200 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 259 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 260 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 319 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 320 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 379 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 380 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 440 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgct 499 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 500 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcat 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 560 tgcac 564 ||||| Sbjct: 869 tgcac 865
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 511/537 (95%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 26 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 85 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 86 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 145 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 146 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 205 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 206 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 265 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 266 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 325 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 326 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 385 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 386 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1419 Query: 446 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagct 505 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1418 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagct 1359 Query: 506 aatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 aatacacggaaatggataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 1303
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 511/537 (95%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 26 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 85 ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 86 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 145 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 146 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 205 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 206 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 265 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 266 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 325 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 326 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 385 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 386 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439 Query: 446 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagct 505 ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1438 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 1379 Query: 506 aatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1378 aatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 1323
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 502/525 (95%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 97 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 98 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 157 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 158 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 217 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 218 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 278 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 337 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 338 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 398 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 457 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 458 gtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaa 517 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 518 tgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 470/483 (97%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 856 cac 854
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 462/473 (97%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 874
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 471/485 (97%), Gaps = 1/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 80 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 140 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 199 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 200 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 259 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 260 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 319 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 320 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 380 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 440 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgct 499 |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 500 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcat 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 560 tgcac 564 ||||| Sbjct: 873 tgcac 869
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 494/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 873
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 488/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 114 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 115 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 174 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 175 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 234 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 235 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 294 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 295 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 354 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 355 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 415 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1032 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatg 973 Query: 475 atctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnt 534 |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 972 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattt-t 914 Query: 535 tntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 | ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 473/488 (96%), Gaps = 1/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 136 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 137 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 196 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 197 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 256 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 257 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 316 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 317 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 377 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 436 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 437 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaat 496 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 497 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatg 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 557 cattgcac 564 |||||||| Sbjct: 891 cattgcac 884
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 464/477 (97%), Gaps = 1/477 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 147 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 148 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 207 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 208 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 267 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 268 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 328 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 387 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 388 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 448 acctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaa 507 ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 508 tacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 469/483 (97%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 850 cac 848
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 466/479 (97%), Gaps = 1/479 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 146 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 205 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 206 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 265 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 266 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 326 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 386 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 446 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagct 505 ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 506 aatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 474/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 474/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 461/473 (97%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 470/485 (96%), Gaps = 1/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 80 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 140 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 199 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 200 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 259 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 260 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 320 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 380 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 439 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 440 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgct 499 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 500 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcat 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 560 tgcac 564 ||||| Sbjct: 875 tgcac 871
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 466/480 (97%), Gaps = 1/480 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 145 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 204 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 205 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 264 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 265 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 324 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 325 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 385 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 444 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 445 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagc 504 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 505 taatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 466/480 (97%), Gaps = 1/480 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 145 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 204 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 205 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 264 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 265 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 324 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 325 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 385 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 444 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 445 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagc 504 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 505 taatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 487/508 (95%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 114 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 115 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 174 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 175 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 234 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 235 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 294 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 295 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 354 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 355 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 415 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatg 957 Query: 475 atctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnt 534 |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 956 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattt-t 898 Query: 535 tntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 | ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgc 870
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 493/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 120001 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 119967
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 493/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 58374 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 58340
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 493/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 1370 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1310 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 1275
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 463/477 (97%), Gaps = 1/477 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 147 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 148 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 207 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 208 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 267 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 268 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 328 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 387 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 388 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 448 acctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaa 507 ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 508 tacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 468/483 (96%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 866 cac 864
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 462/475 (97%), Gaps = 1/475 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 150 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 210 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 270 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 330 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 390 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 450 ctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaata 509 ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 510 cacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 854
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 460/473 (97%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 460/473 (97%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 460/473 (97%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 460/473 (97%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 872
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 469/485 (96%), Gaps = 1/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 80 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 140 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 199 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 200 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 259 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 260 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 319 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 320 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 379 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 380 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 440 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgct 499 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 500 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcat 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 560 tgcac 564 ||||| Sbjct: 868 tgcac 864
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 492/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 492/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 57793 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 57759
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 492/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 57803 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 57769
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 467/483 (96%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 870 cac 868
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 464/479 (96%), Gaps = 1/479 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 146 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 205 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 206 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 265 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 266 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 326 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 385 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 386 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 446 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagct 505 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 506 aatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcgtgcattgcac 873
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 472/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 776 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 775 catgcattgc 766
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 467/483 (96%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 856 cac 854
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 472/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 472/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 472/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 827 bits (417), Expect = 0.0 Identities = 465/481 (96%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 562 c 562 | Sbjct: 867 c 867
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 445/455 (97%), Gaps = 1/455 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 110 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 169 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 170 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 229 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 230 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 289 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 290 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 350 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 410 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 470 atatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 529 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 530 tttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 ttt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 846
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 445/455 (97%), Gaps = 1/455 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 110 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 169 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 170 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 229 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 230 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 289 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 290 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 350 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 410 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 470 atatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 529 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 530 tttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 ttt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 846
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 466/483 (96%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 562 cac 564 ||| Sbjct: 856 cac 854
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 471/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 471/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 471/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 471/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 471/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 471/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 471/490 (96%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 819 bits (413), Expect = 0.0 Identities = 458/473 (96%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcgataactgcatgcattgcac 872
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 819 bits (413), Expect = 0.0 Identities = 458/473 (96%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcgataactgcatgcattgcac 872
>gb|AY506529.1| Zea mays strain NB mitochondrion, complete genome Length = 569630 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 490/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 349056 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 349115 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349116 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 349175 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 349176 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 349235 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349236 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 349295 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349296 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 349355 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349356 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 349415 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349416 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 349475 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349476 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 349535 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 349536 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 349570
>gb|DQ490952.1| Zea mays subsp. mays genotype male-fertile NA mitochondrion, complete genome Length = 701046 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 490/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 206653 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 206594 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206593 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 206534 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 206533 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 206474 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206473 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 206414 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206413 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 206354 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206353 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 206294 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206293 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 206234 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206233 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 206174 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 206173 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 206139 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 490/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 77961 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 77902 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77901 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 77842 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 77841 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 77782 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77781 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 77722 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77721 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 77662 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77661 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 77602 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77601 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 77542 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77541 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 77482 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 77481 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 77447
>emb|AJ746253.1| Arthraxon sp. TH-111 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1391 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 490/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1387 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1328 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccactggtacaacacctggcatggatacccag 1088 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 968 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 967 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacca 908 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 873
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 444/455 (97%), Gaps = 1/455 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 110 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 169 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 170 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 229 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 230 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 289 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 290 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 350 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 410 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 470 atatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 529 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 530 tttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 876 ttt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 843
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 444/455 (97%), Gaps = 1/455 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 110 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 169 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 170 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 229 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 230 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 289 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 290 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 350 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 410 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 470 atatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 529 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 530 tttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 876 ttt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 843
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 468/487 (96%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataacag 866 Query: 553 catgcat 559 ||||||| Sbjct: 865 catgcat 859
>dbj|AK062203.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-046-G09, full insert sequence Length = 838 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 462/480 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 86 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 480 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 421 Query: 87 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| Sbjct: 420 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaaggtcgcgcc 361 Query: 147 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 206 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 301 Query: 207 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 300 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 241 Query: 267 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 181 Query: 327 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 121 Query: 387 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 61 Query: 447 tacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagcta 506 |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 60 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 470/490 (95%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 470/490 (95%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 457/473 (96%), Gaps = 1/473 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 152 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 211 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 212 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 271 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 272 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 332 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 391 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 392 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 452 actactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaataca 511 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 512 cggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 882
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 466/485 (96%), Gaps = 1/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 80 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 140 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 199 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 200 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 260 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 319 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 320 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 379 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 380 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 440 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgct 499 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 500 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcat 559 || ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 560 tgcac 564 ||||| Sbjct: 858 tgcac 854
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 463/481 (96%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 142 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 202 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 262 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 322 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 381 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 382 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 442 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttt 501 ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 502 agctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattg 561 |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 562 c 562 | Sbjct: 856 c 856
>gb|DQ490951.1| Zea mays subsp. mays genotype CMS-S mitochondrion, complete genome Length = 569553 Score = 809 bits (408), Expect = 0.0 Identities = 489/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 106 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 540663 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 540604 Query: 107 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 166 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540603 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 540544 Query: 167 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 226 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 540543 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 540484 Query: 227 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 286 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540483 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 540424 Query: 287 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 346 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540423 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 540364 Query: 347 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 406 ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540363 tccagagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 540304 Query: 407 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 466 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540303 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 540244 Query: 467 tggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 526 |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540243 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 540184 Query: 527 tgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 540183 tgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 540149
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 809 bits (408), Expect = 0.0 Identities = 454/470 (96%), Gaps = 1/470 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 95 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 154 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 155 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 214 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 215 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 275 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 335 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 395 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 455 actgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacgg 514 |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 515 aaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 864
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 809 bits (408), Expect = 0.0 Identities = 462/480 (96%), Gaps = 1/480 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 143 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 203 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 263 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 323 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 382 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 383 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 443 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgcttta 502 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 503 gctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgc 562 ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 473/495 (95%), Gaps = 1/495 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 127 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 128 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 187 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 188 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 247 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 248 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 307 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 308 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 367 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 368 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 427 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 1002 Query: 428 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1001 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagac 942 Query: 488 atacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaat 547 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| Sbjct: 941 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgattt-ttctgtctatcaat 883 Query: 548 aactgcatgcattgc 562 ||||||||||||||| Sbjct: 882 aactgcatgcattgc 868
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 448/462 (96%), Gaps = 1/462 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 103 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 162 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 163 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 222 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 223 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 282 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 283 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 343 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 402 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 403 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 463 ggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcat 522 || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 523 accatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 827
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 448/462 (96%), Gaps = 1/462 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 103 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 162 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 163 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 222 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 223 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 282 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 283 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 343 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 402 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 403 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 463 ggagtggatatgatctnccccagacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcat 522 || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 523 accatgatttnttntgtntatcaataactgcatgcattgcac 564 |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgattt-ttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 827
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 469/490 (95%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt-ttctgtctatcaataacag 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 469/490 (95%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 133 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 192 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 193 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 252 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 253 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 312 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 313 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 372 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 373 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 433 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctnccccagacatacn 492 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccccgacatacg 925 Query: 493 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttnttntgtntatcaataactg 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccataattt-ttctgtctatcaataactg 866 Query: 553 catgcattgc 562 |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgc 856 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 3,856,749 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 3856749 Number of successful extensions: 115292 Number of sequences better than 10.0: 15073 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15002 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 82 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 75322 Number of HSP's gapped (non-prelim): 20836 length of query: 564 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 541 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9274524057864 effective search space used: 9274524057864 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)